Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_11094
- Subject:
- NM_002908.4
- Aligned Length:
- 1857
- Identities:
- 1761
- Gaps:
- 96
Alignment
Query 1 ATGGCCTCCGGTGCGTATAACCCGTATATAGAGATAATTGAACAACCCAGGCAGAGGGGAATGCGTTTTAGATA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCCTCCGGTGCGTATAACCCGTATATAGAGATAATTGAACAACCCAGGCAGAGGGGAATGCGTTTTAGATA 74
Query 75 CAAATGTGAAGGGCGATCAGCAGGCAGCATTCCAGGGGAGCACAGCACAGACAACAACCGAACATACCCTTCTA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CAAATGTGAAGGGCGATCAGCAGGCAGCATTCCAGGGGAGCACAGCACAGACAACAACCGAACATACCCTTCTA 148
Query 149 TCCAGATTATGAACTATTATGGAAAAGGAAAAGTGAGAATTACATTAGTAACAAAGAATGACCCATATAAACCT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCCAGATTATGAACTATTATGGAAAAGGAAAAGTGAGAATTACATTAGTAACAAAGAATGACCCATATAAACCT 222
Query 223 CATCCTCATGATTTAGTTGGAAAAGACTGCAGAGACGGCTACTATGAAGCAGAATTTGGACAAGAACGCAGACC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CATCCTCATGATTTAGTTGGAAAAGACTGCAGAGACGGCTACTATGAAGCAGAATTTGGACAAGAACGCAGACC 296
Query 297 TTTGTTTTTCCAAAATTTGGGTATTCGATGTGTGAAGAAAAAAGAAGTAAAAGAAGCTATTATTACAAGAATAA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TTTGTTTTTCCAAAATTTGGGTATTCGATGTGTGAAGAAAAAAGAAGTAAAAGAAGCTATTATTACAAGAATAA 370
Query 371 AGGCAGGAATCAATCCATTCAATGTCCCTGAAAAACAGCTGAATGATATTGAAGATTGTGACCTCAATGTGGTG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGGCAGGAATCAATCCATTCAATGTCCCTGAAAAACAGCTGAATGATATTGAAGATTGTGACCTCAATGTGGTG 444
Query 445 AGACTGTGTTTTCAAGTTTTTCTCCCTGATGAACATGGTAATTTGACGACTGCTCTTCCTCCTGTTGTCTCGAA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AGACTGTGTTTTCAAGTTTTTCTCCCTGATGAACATGGTAATTTGACGACTGCTCTTCCTCCTGTTGTCTCGAA 518
Query 519 CCCAATTTATGACAACCGTGCTCCAAATACTGCAGAATTAAGGATTTGTCGTGTAAACAAGAATTGTGGAAGTG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CCCAATTTATGACAACCGTGCTCCAAATACTGCAGAATTAAGGATTTGTCGTGTAAACAAGAATTGTGGAAGTG 592
Query 593 TCAGAGGAGGAGATGAAATATTTCTACTTTGTGACAAAGTTCAGAAAGATGACATAGAAGTTCGTTTTGTGTTG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TCAGAGGAGGAGATGAAATATTTCTACTTTGTGACAAAGTTCAGAAAGATGACATAGAAGTTCGTTTTGTGTTG 666
Query 667 AACGATTGGGAAGCAAAAGGCATCTTTTCACAAGCTGATGTACACCGTCAAGTAGCCATTGTTTTCAAAACTCC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AACGATTGGGAAGCAAAAGGCATCTTTTCACAAGCTGATGTACACCGTCAAGTAGCCATTGTTTTCAAAACTCC 740
Query 741 ACCATATTGCAAAGCTATCACAGAACCCGTAACAGTAAAAATGCAGTTGCGGAGACCTTCTGACCAGGAAGTTA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ACCATATTGCAAAGCTATCACAGAACCCGTAACAGTAAAAATGCAGTTGCGGAGACCTTCTGACCAGGAAGTTA 814
Query 815 GTGAATCTATGGATTTTAGATATCTGCCAGATGAAAAAGATACTTACGGCAATAAAGCAAAGAAACAAAAGACA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GTGAATCTATGGATTTTAGATATCTGCCAGATGAAAAAGATACTTACGGCAATAAAGCAAAGAAACAAAAGACA 888
Query 889 ACTCTGCTTTTCCAGAAACTGTGCCAGGATCAC----------------------------------------- 921
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ACTCTGCTTTTCCAGAAACTGTGCCAGGATCACGTAGAAACAGGGTTTCGCCATGTTGACCAGGATGGTCTTGA 962
Query 922 -------------------------------------------------------GTTAATTTTCCTGAGAGAC 940
|||||||||||||||||||
Sbjct 963 ACTCCTGACATCAGGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGTTAATTTTCCTGAGAGAC 1036
Query 941 CAAGACCTGGTCTCCTCGGTTCAATTGGAGAAGGAAGATACTTCAAAAAAGAACCAAACTTGTTTTCTCATGAT 1014
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CAAGACCTGGTCTCCTCGGTTCAATTGGAGAAGGAAGATACTTCAAAAAAGAACCAAACTTGTTTTCTCATGAT 1110
Query 1015 GCAGTTGTGAGAGAAATGCCTACAGGGGTTTCAAGTCAAGCAGAATCCTACTATCCCTCACCTGGGCCCATCTC 1088
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GCAGTTGTGAGAGAAATGCCTACAGGGGTTTCAAGTCAAGCAGAATCCTACTATCCCTCACCTGGGCCCATCTC 1184
Query 1089 AAGTGGATTGTCACATCATGCCTCAATGGCACCTCTGCCTTCTTCAAGCTGGTCATCAGTGGCCCACCCCACCC 1162
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AAGTGGATTGTCACATCATGCCTCAATGGCACCTCTGCCTTCTTCAAGCTGGTCATCAGTGGCCCACCCCACCC 1258
Query 1163 CACGCTCAGGCAATACAAACCCACTGAGTAGTTTTTCAACAAGGACACTTCCTTCTAATTCGCAAGGTATCCCA 1236
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CACGCTCAGGCAATACAAACCCACTGAGTAGTTTTTCAACAAGGACACTTCCTTCTAATTCGCAAGGTATCCCA 1332
Query 1237 CCATTCCTGAGAATACCTGTTGGGAATGATTTAAATGCTTCTAATGCTTGCATTTACAACAATGCCGATGACAT 1310
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CCATTCCTGAGAATACCTGTTGGGAATGATTTAAATGCTTCTAATGCTTGCATTTACAACAATGCCGATGACAT 1406
Query 1311 AGTCGGAATGGAAGCGTCATCCATGCCATCAGCAGATTTATATGGTATTTCTGATCCCAACATGCTGTCTAATT 1384
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 AGTCGGAATGGAAGCGTCATCCATGCCATCAGCAGATTTATATGGTATTTCTGATCCCAACATGCTGTCTAATT 1480
Query 1385 GTTCTGTGAATATGATGACAACCAGCAGTGACAGCATGGGAGAGACTGATAATCCAAGACTTCTGAGCATGAAT 1458
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 GTTCTGTGAATATGATGACAACCAGCAGTGACAGCATGGGAGAGACTGATAATCCAAGACTTCTGAGCATGAAT 1554
Query 1459 CTTGAAAACCCCTCATGTAATTCAGTGTTAGACCCAAGAGACTTGAGACAGCTCCATCAGATGTCCTCTTCCAG 1532
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CTTGAAAACCCCTCATGTAATTCAGTGTTAGACCCAAGAGACTTGAGACAGCTCCATCAGATGTCCTCTTCCAG 1628
Query 1533 TATGTCAGCAGGCGCCAATTCCAATACTACTGTTTTTGTTTCACAATCAGATGCATTTGAGGGATCTGACTTCA 1606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TATGTCAGCAGGCGCCAATTCCAATACTACTGTTTTTGTTTCACAATCAGATGCATTTGAGGGATCTGACTTCA 1702
Query 1607 GTTGTGCAGATAACAGCATGATAAATGAGTCGGGACCATCAAACAGTACTAATCCAAACAGTCATGGTTTTGTT 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GTTGTGCAGATAACAGCATGATAAATGAGTCGGGACCATCAAACAGTACTAATCCAAACAGTCATGGTTTTGTT 1776
Query 1681 CAAGATAGTCAGTATTCAGGTATTGGCAGTATGCAAAATGAGCAATTGAGTGACTCCTTTCCATATGAATTTTT 1754
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 CAAGATAGTCAGTATTCAGGTATTGGCAGTATGCAAAATGAGCAATTGAGTGACTCCTTTCCATATGAATTTTT 1850
Query 1755 TCAAGTA 1761
|||||||
Sbjct 1851 TCAAGTA 1857