Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11094
• Subject: XM_011533010.3
• Aligned Length: 1761
• Identities: 1466
• Gaps: 294

Alignment

Query    1  ATGGCCTCCGGTGCGTATAACCCGTATATAGAGATAATTGAACAACCCAGGCAGAGGGGAATGCGTTTTAGATA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CAAATGTGAAGGGCGATCAGCAGGCAGCATTCCAGGGGAGCACAGCACAGACAACAACCGAACATACCCTTCTA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TCCAGATTATGAACTATTATGGAAAAGGAAAAGTGAGAATTACATTAGTAACAAAGAATGACCCATATAAACCT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CATCCTCATGATTTAGTTGGAAAAGACTGCAGAGACGGCTACTATGAAGCAGAATTTGGACAAGAACGCAGACC  296
                                                                             |.|     |
Sbjct    1  -----------------------------------------------------------------ATG-----C  4

Query  297  TTTGTTTTTCCAAAATTTGGGTATTCGATGTGTGAAGAAAAAAGAAGTAAAAGAAGCTATTATTACAAGAATAA  370
            ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    5  TTTG--TTTCCAAAATTTGGGTATTCGATGTGTGAAGAAAAAAGAAGTAAAAGAAGCTATTATTACAAGAATAA  76

Query  371  AGGCAGGAATCAATCCATTCAATGTCCCTGAAAAACAGCTGAATGATATTGAAGATTGTGACCTCAATGTGGTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   77  AGGCAGGAATCAATCCATTCAATGTCCCTGAAAAACAGCTGAATGATATTGAAGATTGTGACCTCAATGTGGTG  150

Query  445  AGACTGTGTTTTCAAGTTTTTCTCCCTGATGAACATGGTAATTTGACGACTGCTCTTCCTCCTGTTGTCTCGAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  151  AGACTGTGTTTTCAAGTTTTTCTCCCTGATGAACATGGTAATTTGACGACTGCTCTTCCTCCTGTTGTCTCGAA  224

Query  519  CCCAATTTATGACAACCGTGCTCCAAATACTGCAGAATTAAGGATTTGTCGTGTAAACAAGAATTGTGGAAGTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  225  CCCAATTTATGACAACCGTGCTCCAAATACTGCAGAATTAAGGATTTGTCGTGTAAACAAGAATTGTGGAAGTG  298

Query  593  TCAGAGGAGGAGATGAAATATTTCTACTTTGTGACAAAGTTCAGAAAGATGACATAGAAGTTCGTTTTGTGTTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  299  TCAGAGGAGGAGATGAAATATTTCTACTTTGTGACAAAGTTCAGAAAGATGACATAGAAGTTCGTTTTGTGTTG  372

Query  667  AACGATTGGGAAGCAAAAGGCATCTTTTCACAAGCTGATGTACACCGTCAAGTAGCCATTGTTTTCAAAACTCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  373  AACGATTGGGAAGCAAAAGGCATCTTTTCACAAGCTGATGTACACCGTCAAGTAGCCATTGTTTTCAAAACTCC  446

Query  741  ACCATATTGCAAAGCTATCACAGAACCCGTAACAGTAAAAATGCAGTTGCGGAGACCTTCTGACCAGGAAGTTA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  447  ACCATATTGCAAAGCTATCACAGAACCCGTAACAGTAAAAATGCAGTTGCGGAGACCTTCTGACCAGGAAGTTA  520

Query  815  GTGAATCTATGGATTTTAGATATCTGCCAGATGAAAAAGATACTTACGGCAATAAAGCAAAGAAACAAAAGACA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  521  GTGAATCTATGGATTTTAGATATCTGCCAGATGAAAAAGATACTTACGGCAATAAAGCAAAGAAACAAAAGACA  594

Query  889  ACTCTGCTTTTCCAGAAACTGTGCCAGGATCACGTTAATTTTCCTGAGAGACCAAGACCTGGTCTCCTCGGTTC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  595  ACTCTGCTTTTCCAGAAACTGTGCCAGGATCACGTTAATTTTCCTGAGAGACCAAGACCTGGTCTCCTCGGTTC  668

Query  963  AATTGGAGAAGGAAGATACTTCAAAAAAGAACCAAACTTGTTTTCTCATGATGCAGTTGTGAGAGAAATGCCTA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  669  AATTGGAGAAGGAAGATACTTCAAAAAAGAACCAAACTTGTTTTCTCATGATGCAGTTGTGAGAGAAATGCCTA  742

Query 1037  CAGGGGTTTCAAGTCAAGCAGAATCCTACTATCCCTCACCTGGGCCCATCTCAAGTGGATTGTCACATCATGCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  743  CAGGGGTTTCAAGTCAAGCAGAATCCTACTATCCCTCACCTGGGCCCATCTCAAGTGGATTGTCACATCATGCC  816

Query 1111  TCAATGGCACCTCTGCCTTCTTCAAGCTGGTCATCAGTGGCCCACCCCACCCCACGCTCAGGCAATACAAACCC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  817  TCAATGGCACCTCTGCCTTCTTCAAGCTGGTCATCAGTGGCCCACCCCACCCCACGCTCAGGCAATACAAACCC  890

Query 1185  ACTGAGTAGTTTTTCAACAAGGACACTTCCTTCTAATTCGCAAGGTATCCCACCATTCCTGAGAATACCTGTTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  891  ACTGAGTAGTTTTTCAACAAGGACACTTCCTTCTAATTCGCAAGGTATCCCACCATTCCTGAGAATACCTGTTG  964

Query 1259  GGAATGATTTAAATGCTTCTAATGCTTGCATTTACAACAATGCCGATGACATAGTCGGAATGGAAGCGTCATCC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  965  GGAATGATTTAAATGCTTCTAATGCTTGCATTTACAACAATGCCGATGACATAGTCGGAATGGAAGCGTCATCC  1038

Query 1333  ATGCCATCAGCAGATTTATATGGTATTTCTGATCCCAACATGCTGTCTAATTGTTCTGTGAATATGATGACAAC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1039  ATGCCATCAGCAGATTTATATGGTATTTCTGATCCCAACATGCTGTCTAATTGTTCTGTGAATATGATGACAAC  1112

Query 1407  CAGCAGTGACAGCATGGGAGAGACTGATAATCCAAGACTTCTGAGCATGAATCTTGAAAACCCCTCATGTAATT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1113  CAGCAGTGACAGCATGGGAGAGACTGATAATCCAAGACTTCTGAGCATGAATCTTGAAAACCCCTCATGTAATT  1186

Query 1481  CAGTGTTAGACCCAAGAGACTTGAGACAGCTCCATCAGATGTCCTCTTCCAGTATGTCAGCAGGCGCCAATTCC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1187  CAGTGTTAGACCCAAGAGACTTGAGACAGCTCCATCAGATGTCCTCTTCCAGTATGTCAGCAGGCGCCAATTCC  1260

Query 1555  AATACTACTGTTTTTGTTTCACAATCAGATGCATTTGAGGGATCTGACTTCAGTTGTGCAGATAACAGCATGAT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1261  AATACTACTGTTTTTGTTTCACAATCAGATGCATTTGAGGGATCTGACTTCAGTTGTGCAGATAACAGCATGAT  1334

Query 1629  AAATGAGTCGGGACCATCAAACAGTACTAATCCAAACAGTCATGGTTTTGTTCAAGATAGTCAGTATTCAGGTA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1335  AAATGAGTCGGGACCATCAAACAGTACTAATCCAAACAGTCATGGTTTTGTTCAAGATAGTCAGTATTCAGGTA  1408

Query 1703  TTGGCAGTATGCAAAATGAGCAATTGAGTGACTCCTTTCCATATGAATTTTTTCAAGTA  1761
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1409  TTGGCAGTATGCAAAATGAGCAATTGAGTGACTCCTTTCCATATGAATTTTTTCAAGTA  1467