Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11113
• Subject: NM_021136.3
• Aligned Length: 2328
• Identities: 2104
• Gaps: 222

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCCGCGCCGGGGGATCCGCAGGACGAGCTGCTGCCGCTGGCCGGCCCCGGGTCCCAGTGGCTCAGGCACCG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GGGGGAGGGGGAGAACGAAGCGGTGACGCCGAAAGGGGCCACGCCGGCGCCGCAGGCTGGGGAGCCCAGCCCGG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  GGTTGGGCGCCAGGGCCCGGGAAGCGGCGTCGCGGGAAGCCGGCTCGGGCCCCGCCCGGCAGTCGCCCGTTGCC  222

Query    1  ATGGAAACTGCATCCACAGGTGTGGCAGGTGTTTCCAGTGCCATGGACCACACCTTCTCAACAACATCAAAAGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATGGAAACTGCATCCACAGGTGTGGCAGGTGTTTCCAGTGCCATGGACCACACCTTCTCAACAACATCAAAAGA  296

Query   75  TGGGGAAGGATCGTGTTACACATCTCTCATTTCTGACATCTGCTATCCACCTCAGGAGGATTCTACATATTTTA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGGGGAAGGATCGTGTTACACATCTCTCATTTCTGACATCTGCTATCCACCTCAGGAGGATTCTACATATTTTA  370

Query  149  CTGGAATTCTTCAGAAGGAAAATGGCCACGTCACCATTTCAGAGAGCCCTGAGGAGCTGGGTACACCCGGCCCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTGGAATTCTTCAGAAGGAAAATGGCCACGTCACCATTTCAGAGAGCCCTGAGGAGCTGGGTACACCCGGCCCC  444

Query  223  TCCTTACCAGATGTGCCTGGGATAGAGTCTCGTGGCTTATTTAGTTCTGATTCTGGAATAGAGATGACTCCTGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCCTTACCAGATGTGCCTGGGATAGAGTCTCGTGGCTTATTTAGTTCTGATTCTGGAATAGAGATGACTCCTGC  518

Query  297  AGAGTCCACGGAAGTGAACAAGATCTTAGCAGACCCTCTGGACCAGATGAAAGCAGAGGCCTATAAATACATTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGAGTCCACGGAAGTGAACAAGATCTTAGCAGACCCTCTGGACCAGATGAAAGCAGAGGCCTATAAATACATTG  592

Query  371  ACATAACCAGACCCGAGGAGGTGAAGCACCAAGAACAACATCACCCCGAGCTGGAAGATAAAGACTTGGACTTT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACATAACCAGACCCGAGGAGGTGAAGCACCAAGAACAACATCACCCCGAGCTGGAAGATAAAGACTTGGACTTT  666

Query  445  AAGAATAAAGACACTGACATCTCAATTAAACCTGAAGGAGTCCGTGAACCTGACAAACCAGCTCCTGTGGAGGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGAATAAAGACACTGACATCTCAATTAAACCTGAAGGAGTCCGTGAACCTGACAAACCAGCTCCTGTGGAGGG  740

Query  519  AAAAATCATCAAGGACCATTTATTGGAAGAATCCACATTTGCTCCATACATAGATGATCTCTCTGAAGAACAGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AAAAATCATCAAGGACCATTTATTGGAAGAATCCACATTTGCTCCATACATAGATGATCTCTCTGAAGAACAGC  814

Query  593  GCAGGGCTCCTCAGATCACCACCCCTGTCAAAATCACACTGACGGAAATAGAACCTTCTGTTGAAACCACTACC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCAGGGCTCCTCAGATCACCACCCCTGTCAAAATCACACTGACGGAAATAGAACCTTCTGTTGAAACCACTACC  888

Query  667  CAAGAGAAGACCCCTGAGAAGCAAGATATATGTCTAAAGCCAAGTCCTGACACAGTCCCCACTGTCACTGTCTC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CAAGAGAAGACCCCTGAGAAGCAAGATATATGTCTAAAGCCAAGTCCTGACACAGTCCCCACTGTCACTGTCTC  962

Query  741  GGAGCCTGAAGACGACAGCCCAGGATCTATCACCCCTCCATCTTCTGGAACAGAACCATCTGCTGCAGAATCCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGAGCCTGAAGACGACAGCCCAGGATCTATCACCCCTCCATCTTCTGGAACAGAACCATCTGCTGCAGAATCCC  1036

Query  815  AGGGGAAAGGCAGCATCTCCGAGGATGAGCTGATCACCGCCATCAAAGAAGCAAAGGGATTATCGTATGAAACC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGGGGAAAGGCAGCATCTCCGAGGATGAGCTGATCACCGCCATCAAAGAAGCAAAGGGATTATCGTATGAAACC  1110

Query  889  GCCGAGAACCCACGGCCGGTGGGCCAGCTGGCCGACAGGCCCGAGGTCAAGGCCAGGTCCGGACCGCCAACCAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCCGAGAACCCACGGCCGGTGGGCCAGCTGGCCGACAGGCCCGAGGTCAAGGCCAGGTCCGGACCGCCAACCAT  1184

Query  963  CCCCAGCCCCCTGGACCACGAGGCCAGCAGCGCGGAGTCGGGGGACTCAGAGATCGAGCTGGTGTCCGAGGACC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCCCAGCCCCCTGGACCACGAGGCCAGCAGCGCGGAGTCGGGGGACTCAGAGATCGAGCTGGTGTCCGAGGACC  1258

Query 1037  CCATGGCCGCGGAGGACGCGCTGCCCTCAGGCTATGTGAGCTTTGGCCACGTGGGCGGCCCGCCGCCCTCGCCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCATGGCCGCGGAGGACGCGCTGCCCTCAGGCTATGTGAGCTTTGGCCACGTGGGCGGCCCGCCGCCCTCGCCC  1332

Query 1111  GCCTCGCCATCCATCCAGTACAGCATCCTGAGGGAGGAGCGCGAGGCCGAGCTGGACAGCGAGCTCATCATCGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCCTCGCCATCCATCCAGTACAGCATCCTGAGGGAGGAGCGCGAGGCCGAGCTGGACAGCGAGCTCATCATCGA  1406

Query 1185  GTCGTGCGACGCCTCCTCGGCCTCGGAGGAGAGCCCCAAGCGGGAGCAGGACTCACCCCCGATGAAGCCCAGCG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GTCGTGCGACGCCTCCTCGGCCTCGGAGGAGAGCCCCAAGCGGGAGCAGGACTCACCCCCGATGAAGCCCAGCG  1480

Query 1259  CCCTGGATGCCATCCGGGAGGAGACTGGCGTCCGGGCCGAGGAGCGTGCGCCAAGCCGGCGGGGCCTGGCCGAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CCCTGGATGCCATCCGGGAGGAGACTGGCGTCCGGGCCGAGGAGCGTGCGCCAAGCCGGCGGGGCCTGGCCGAG  1554

Query 1333  CCGGGTTCCTTCCTCGACTACCCCTCAACTGAGCCCCAGCCTGGCCCCGAGCTGCCCCCTGGAGACGGAGCCCT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CCGGGTTCCTTCCTCGACTACCCCTCAACTGAGCCCCAGCCTGGCCCCGAGCTGCCCCCTGGAGACGGAGCCCT  1628

Query 1407  GGAGCCTGAGACGCCCATGTTGCCACGGAAGCCTGAAGAAGACTCGAGTTCCAACCAAAGTCCTGCGGCCACAA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GGAGCCTGAGACGCCCATGTTGCCACGGAAGCCTGAAGAAGACTCGAGTTCCAACCAAAGTCCTGCGGCCACAA  1702

Query 1481  AGGGCCCTGGGCCTCTAGGTCCTGGCGCCCCGCCCCCACTGCTGTTTCTCAATAAGCAAAAAGCTATTGACCTG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AGGGCCCTGGGCCTCTAGGTCCTGGCGCCCCGCCCCCACTGCTGTTTCTCAATAAGCAAAAAGCTATTGACCTG  1776

Query 1555  TTGTATTGGCGGGACATCAAGCAGACGGGCATCGTGTTTGGGAGTTTCCTGCTGCTGCTCTTCTCCCTGACCCA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TTGTATTGGCGGGACATCAAGCAGACGGGCATCGTGTTTGGGAGTTTCCTGCTGCTGCTCTTCTCCCTGACCCA  1850

Query 1629  GTTCAGCGTGGTGAGCGTCGTGGCCTACCTGGCCCTGGCCGCACTCTCAGCCACCATCAGTTTCCGCATCTACA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GTTCAGCGTGGTGAGCGTCGTGGCCTACCTGGCCCTGGCCGCACTCTCAGCCACCATCAGTTTCCGCATCTACA  1924

Query 1703  AGTCTGTTTTACAAGCAGTGCAGAAAACCGACGAAGGCCACCCTTTCAAGGCCTACTTGGAGCTTGAGATCACC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AGTCTGTTTTACAAGCAGTGCAGAAAACCGACGAAGGCCACCCTTTCAAGGCCTACTTGGAGCTTGAGATCACC  1998

Query 1777  CTTTCTCAGGAGCAGATTCAGAAGTACACGGACTGCCTGCAGTTCTACGTGAACAGCACACTTAAGGAACTGAG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CTTTCTCAGGAGCAGATTCAGAAGTACACGGACTGCCTGCAGTTCTACGTGAACAGCACACTTAAGGAACTGAG  2072

Query 1851  GAGGCTCTTCCTTGTCCAGGACCTGGTGGATTCTTTAAAATTTGCAGTCCTGATGTGGCTCCTGACCTACGTTG  1924
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GAGGCTCTTCCTTGTCCAGGACCTGGTGGATTCCTTAAAATTTGCAGTCCTGATGTGGCTCCTGACCTACGTTG  2146

Query 1925  GCGCTCTCTTCAATGGCCTGACCCTGCTGCTCATGGCTGTGGTTTCAATGTTTACTCTACCTGTAGTGTATGTT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  GCGCTCTCTTCAATGGCCTGACCCTGCTGCTCATGGCTGTGGTTTCAATGTTTACTCTACCTGTAGTGTATGTT  2220

Query 1999  AAGCACCAGGCACAGATTGACCAATATCTGGGACTTGTGAGGACTCACATAAATGCTGTTGTGGCAAAGATTCA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  AAGCACCAGGCACAGATTGACCAATATCTGGGACTTGTGAGGACTCACATAAATGCTGTTGTGGCAAAGATTCA  2294

Query 2073  GGCTAAAATCCCAGGCGCTAAGAGGCACGCTGAG  2106
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 2295  GGCTAAAATCCCAGGCGCTAAGAGGCATGCTGAG  2328