Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11132
• Subject: NM_001254759.2
• Aligned Length: 1001
• Identities: 992
• Gaps: 7

Alignment

Query    1  ATG-GT-CAGCAAGTCCCGCTGGAAGCTCCTGGCCATGTTGGCTCTGGTCCTGGTCGTCATGGTGTGGTATTCC  72
            ||| || |.|||     .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTGTCCTGCA-----GGCTGGAAGCTCCTGGCCATGTTGGCTCTGGTCCTGGTCGTCATGGTGTGGTATTCC  69

Query   73  ATCTCCCGGGAAGACAGGTACATCGAGCTTTTTTATTTTCCCATCCCAGAGAAGAAGGAGCCGTGCCTCCAGGG  146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   70  ATCTCCCGGGAAGACAGGTACATCGAGCTTTTTTATTTTCCCATCCCAGAGAAGAAGGAGCCGTGCCTCCAGGG  143

Query  147  TGAGGCAGAGAGCAAGGCCTCTAAGCTCTTTGGCAACTACTCCCGGGATCAGCCCATCTTCCTGCGGCTTGAGG  220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  144  TGAGGCAGAGAGCAAGGCCTCTAAGCTCTTTGGCAACTACTCCCGGGATCAGCCCATCTTCCTGCGGCTTGAGG  217

Query  221  ATTATTTCTGGGTCAAGACGCCATCTGCTTACGAGCTGCCCTATGGGACCAAGGGGAGTGAGGATCTGCTCCTC  294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  218  ATTATTTCTGGGTCAAGACGCCATCTGCTTACGAGCTGCCCTATGGGACCAAGGGGAGTGAGGATCTGCTCCTC  291

Query  295  CGGGTGCTAGCCATCACCAGCTCCTCCATCCCCAAGAACATCCAGAGCCTCAGGTGCCGCCGCTGTGTGGTCGT  368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  292  CGGGTGCTAGCCATCACCAGCTCCTCCATCCCCAAGAACATCCAGAGCCTCAGGTGCCGCCGCTGTGTGGTCGT  365

Query  369  GGGGAACGGGCACCGGCTGCGGAACAGCTCACTGGGAGATGCCATCAACAAGTACGATGTGGTCATCAGATTGA  442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  366  GGGGAACGGGCACCGGCTGCGGAACAGCTCACTGGGAGATGCCATCAACAAGTACGATGTGGTCATCAGATTGA  439

Query  443  ACAATGCCCCAGTGGCTGGCTATGAGGGTGACGTGGGCTCCAAGACCACCATGCGTCTCTTCTACCCTGAATCT  516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  440  ACAATGCCCCAGTGGCTGGCTATGAGGGTGACGTGGGCTCCAAGACCACCATGCGTCTCTTCTACCCTGAATCT  513

Query  517  GCCCACTTCGACCCCAAAGTAGAAAACAACCCAGACACACTCCTCGTCCTGGTAGCTTTCAAGGCAATGGACTT  590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  514  GCCCACTTCGACCCCAAAGTAGAAAACAACCCAGACACACTCCTCGTCCTGGTAGCTTTCAAGGCAATGGACTT  587

Query  591  CCACTGGATTGAGACCATCCTGAGTGATAAGAAGCGGGTGCGAAAGGGTTTCTGGAAACAGCCTCCCCTCATCT  664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  588  CCACTGGATTGAGACCATCCTGAGTGATAAGAAGCGGGTGCGAAAGGGTTTCTGGAAACAGCCTCCCCTCATCT  661

Query  665  GGGATGTCAATCCTAAACAGATTCGGATTCTCAACCCCTTCTTCATGGAGATTGCAGCTGACAAACTGCTGAGC  738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  662  GGGATGTCAATCCTAAACAGATTCGGATTCTCAACCCCTTCTTCATGGAGATTGCAGCTGACAAACTGCTGAGC  735

Query  739  CTGCCAATGCAACAGCCACGGAAGATTAAGCAGAAGCCCACCACGGGCCTGTTGGCCATCACGCTGGCCCTCCA  812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  736  CTGCCAATGCAACAGCCACGGAAGATTAAGCAGAAGCCCACCACGGGCCTGTTGGCCATCACGCTGGCCCTCCA  809

Query  813  CCTCTGTGACTTGGTGCACATTGCCGGCTTTGGCTACCCAGACGCCTACAACAAGAAGCAGACCATTCACTACT  886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  810  CCTCTGTGACTTGGTGCACATTGCCGGCTTTGGCTACCCAGACGCCTACAACAAGAAGCAGACCATTCACTACT  883

Query  887  ATGAGCAGATCACGCTCAAGTCCATGGCGGGGTCAGGCCATAATGTCTCCCAAGAGGCCCTGGCCATTAAGCGG  960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  884  ATGAGCAGATCACGCTCAAGTCCATGGCGGGGTCAGGCCATAATGTCTCCCAAGAGGCCCTGGCCATTAAGCGG  957

Query  961  ATGCTGGAGATGGGAGCTATCAAGAACCTCACGTCCTTC  999
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  958  ATGCTGGAGATGGGAGCTATCAAGAACCTCACGTCCTTC  996