Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11132
• Subject: NM_009178.4
• Aligned Length: 1002
• Identities: 866
• Gaps: 6

Alignment

Query    1  ATGGTCAGCAAGTCCCGCTGGAAGCTCCTGGCCATGTTGGCTCTGGTCC---TGGTCGTCATGGTGTGGTATTC  71
            |||..||||||.||.|.||||||||||||||||   .||||||||||||   |.||.|||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACCAGCAAATCTCACTGGAAGCTCCTGGCC---CTGGCTCTGGTCCTTGTTGTTGTCATGGTGTGGTATTC  71

Query   72  CATCTCCCGGGAAGACAGGTACATCGAGCTTTTTTATTTTCCCATCCCAGAGAAGAAGGAGCCGTGCCTCCAGG  145
            |||||||||.|||||.||||||||.|||.|.|||||||||||||||.||||||||||.|||||.|||.||||||
Sbjct   72  CATCTCCCGAGAAGATAGGTACATTGAGTTCTTTTATTTTCCCATCTCAGAGAAGAAAGAGCCATGCTTCCAGG  145

Query  146  GTGAGGCAGAGAGCAAGGCCTCTAAGCTCTTTGGCAACTACTCCCGGGATCAGCCCATCTTCCTGCGGCTTGAG  219
            |||||||||||||..|||||||||||.|.|||||||||...||..||||.|||||||||||.||||.||||.||
Sbjct  146  GTGAGGCAGAGAGACAGGCCTCTAAGATTTTTGGCAACCGTTCTAGGGAACAGCCCATCTTTCTGCAGCTTAAG  219

Query  220  GATTATTTCTGGGTCAAGACGCCATCTGCTTACGAGCTGCCCTATGGGACCAAGGGGAGTGAGGATCTGCTCCT  293
            ||||||||.|||||.|||||||||||..|.||.||||||||||.||||||.||.||.|||||.||.||.||.||
Sbjct  220  GATTATTTTTGGGTAAAGACGCCATCCACCTATGAGCTGCCCTTTGGGACTAAAGGAAGTGAAGACCTTCTTCT  293

Query  294  CCGGGTGCTAGCCATCACCAGCTCCTCCATCCCCAAGAACATCCAGAGCCTCAGGTGCCGCCGCTGTGTGGTCG  367
            |||||||||.||||||||.||||..||.||.||..|||.|||..||||||||..|||.||.||||||||.||.|
Sbjct  294  CCGGGTGCTGGCCATCACTAGCTATTCTATACCTGAGAGCATAAAGAGCCTCGAGTGTCGTCGCTGTGTTGTGG  367

Query  368  TGGGGAACGGGCACCGGCTGCGGAACAGCTCACTGGGAGATGCCATCAACAAGTACGATGTGGTCATCAGATTG  441
            ||||.||.|||||||||.|||||||||||||.|||||.|.||.|||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  368  TGGGAAATGGGCACCGGTTGCGGAACAGCTCGCTGGGCGGTGTCATCAACAAGTACGACGTGGTCATCAGATTG  441

Query  442  AACAATGCCCCAGTGGCTGGCTATGAGGGTGACGTGGGCTCCAAGACCACCATGCGTCTCTTCTACCCTGAATC  515
            ||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||
Sbjct  442  AACAATGCTCCTGTGGCTGGCTACGAGGGAGATGTGGGCTCCAAGACCACCATACGTCTCTTCTATCCTGAGTC  515

Query  516  TGCCCACTTCGACCCCAAAGTAGAAAACAACCCAGACACACTCCTCGTCCTGGTAGCTTTCAAGGCAATGGACT  589
            .||||||||.|||||.|||.|||||||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  516  GGCCCACTTTGACCCTAAAATAGAAAACAACCCAGACACGCTCTTGGTCCTGGTAGCTTTCAAGGCGATGGACT  589

Query  590  TCCACTGGATTGAGACCATCCTGAGTGATAAGAAGCGGGTGCGAAAGGGTTTCTGGAAACAGCCTCCCCTCATC  663
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  590  TCCACTGGATTGAGACCATCTTGAGTGATAAGAAGCGGGTGCGAAAAGGCTTCTGGAAACAGCCTCCCCTCATC  663

Query  664  TGGGATGTCAATCCTAAACAGATTCGGATTCTCAACCCCTTCTTCATGGAGATTGCAGCTGACAAACTGCTGAG  737
            |||||||||||.||.||||||.|.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||
Sbjct  664  TGGGATGTCAACCCCAAACAGGTCCGGATTCTAAACCCCTTCTTTATGGAGATTGCAGCAGACAAGCTCCTGAG  737

Query  738  CCTGCCAATGCAACAGCCACGGAAGATTAAGCAGAAGCCCACCACGGGCCTGTTGGCCATCACGCTGGCCCTCC  811
            ||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||.|.||||||||..||||.||.|
Sbjct  738  CCTGCCCATACAACAGCCTCGAAAGATCAAGCAGAAGCCAACCACGGGTCTGCTAGCCATCACCTTGGCTCTAC  811

Query  812  ACCTCTGTGACTTGGTGCACATTGCCGGCTTTGGCTACCCAGACGCCTACAACAAGAAGCAGACCATTCACTAC  885
            |||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||.||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  812  ACCTCTGCGACTTAGTGCACATTGCTGGCTTTGGCTATCCAGATGCCTCCAACAAGAAGCAGACCATCCACTAC  885

Query  886  TATGAGCAGATCACGCTCAAGTCCATGGCGGGGTCAGGCCATAATGTCTCCCAAGAGGCCCTGGCCATTAAGCG  959
            |||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||..|.|||||.|||||
Sbjct  886  TATGAACAGATCACACTTAAGTCTATGGCGGGATCAGGCCATAATGTCTCCCAAGAGGCTATCGCCATCAAGCG  959

Query  960  GATGCTGGAGATGGGAGCTATCAAGAACCTCACGTCCTTC  999
            ||||||.||||||||||||.|||||||||||||.|.||||
Sbjct  960  GATGCTAGAGATGGGAGCTGTCAAGAACCTCACATACTTC  999