Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11132
• Subject: XM_006510108.2
• Aligned Length: 1122
• Identities: 866
• Gaps: 126

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGGCAGCCCCGAGATGCCAACGTGTCTTGTACCACTGCCATTCCTCCCAGACCGAGGGGTGGCCCGAGGCAG  74

Query    1  ----------------------------------------------ATGGTCAGCAAGTCCCGCTGGAAGCTCC  28
                                                          |||..||||||.||.|.|||||||||||
Sbjct   75  CCGGGATGACACTTCTCCCCAGGAACCCTGCTATCTGCTGAGAAACATGACCAGCAAATCTCACTGGAAGCTCC  148

Query   29  TGGCCATGTTGGCTCTGGTCC---TGGTCGTCATGGTGTGGTATTCCATCTCCCGGGAAGACAGGTACATCGAG  99
            |||||   .||||||||||||   |.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||
Sbjct  149  TGGCC---CTGGCTCTGGTCCTTGTTGTTGTCATGGTGTGGTATTCCATCTCCCGAGAAGATAGGTACATTGAG  219

Query  100  CTTTTTTATTTTCCCATCCCAGAGAAGAAGGAGCCGTGCCTCCAGGGTGAGGCAGAGAGCAAGGCCTCTAAGCT  173
            .|.|||||||||||||||.||||||||||.|||||.|||.|||||||||||||||||||..|||||||||||.|
Sbjct  220  TTCTTTTATTTTCCCATCTCAGAGAAGAAAGAGCCATGCTTCCAGGGTGAGGCAGAGAGACAGGCCTCTAAGAT  293

Query  174  CTTTGGCAACTACTCCCGGGATCAGCCCATCTTCCTGCGGCTTGAGGATTATTTCTGGGTCAAGACGCCATCTG  247
            .|||||||||...||..||||.|||||||||||.||||.||||.||||||||||.|||||.|||||||||||..
Sbjct  294  TTTTGGCAACCGTTCTAGGGAACAGCCCATCTTTCTGCAGCTTAAGGATTATTTTTGGGTAAAGACGCCATCCA  367

Query  248  CTTACGAGCTGCCCTATGGGACCAAGGGGAGTGAGGATCTGCTCCTCCGGGTGCTAGCCATCACCAGCTCCTCC  321
            |.||.||||||||||.||||||.||.||.|||||.||.||.||.|||||||||||.||||||||.||||..||.
Sbjct  368  CCTATGAGCTGCCCTTTGGGACTAAAGGAAGTGAAGACCTTCTTCTCCGGGTGCTGGCCATCACTAGCTATTCT  441

Query  322  ATCCCCAAGAACATCCAGAGCCTCAGGTGCCGCCGCTGTGTGGTCGTGGGGAACGGGCACCGGCTGCGGAACAG  395
            ||.||..|||.|||..||||||||..|||.||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||.||||||||||
Sbjct  442  ATACCTGAGAGCATAAAGAGCCTCGAGTGTCGTCGCTGTGTTGTGGTGGGAAATGGGCACCGGTTGCGGAACAG  515

Query  396  CTCACTGGGAGATGCCATCAACAAGTACGATGTGGTCATCAGATTGAACAATGCCCCAGTGGCTGGCTATGAGG  469
            |||.|||||.|.||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||
Sbjct  516  CTCGCTGGGCGGTGTCATCAACAAGTACGACGTGGTCATCAGATTGAACAATGCTCCTGTGGCTGGCTACGAGG  589

Query  470  GTGACGTGGGCTCCAAGACCACCATGCGTCTCTTCTACCCTGAATCTGCCCACTTCGACCCCAAAGTAGAAAAC  543
            |.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||.||||||||
Sbjct  590  GAGATGTGGGCTCCAAGACCACCATACGTCTCTTCTATCCTGAGTCGGCCCACTTTGACCCTAAAATAGAAAAC  663

Query  544  AACCCAGACACACTCCTCGTCCTGGTAGCTTTCAAGGCAATGGACTTCCACTGGATTGAGACCATCCTGAGTGA  617
            |||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  664  AACCCAGACACGCTCTTGGTCCTGGTAGCTTTCAAGGCGATGGACTTCCACTGGATTGAGACCATCTTGAGTGA  737

Query  618  TAAGAAGCGGGTGCGAAAGGGTTTCTGGAAACAGCCTCCCCTCATCTGGGATGTCAATCCTAAACAGATTCGGA  691
            ||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||.|.||||
Sbjct  738  TAAGAAGCGGGTGCGAAAAGGCTTCTGGAAACAGCCTCCCCTCATCTGGGATGTCAACCCCAAACAGGTCCGGA  811

Query  692  TTCTCAACCCCTTCTTCATGGAGATTGCAGCTGACAAACTGCTGAGCCTGCCAATGCAACAGCCACGGAAGATT  765
            ||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||.
Sbjct  812  TTCTAAACCCCTTCTTTATGGAGATTGCAGCAGACAAGCTCCTGAGCCTGCCCATACAACAGCCTCGAAAGATC  885

Query  766  AAGCAGAAGCCCACCACGGGCCTGTTGGCCATCACGCTGGCCCTCCACCTCTGTGACTTGGTGCACATTGCCGG  839
            |||||||||||.||||||||.|||.|.||||||||..||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||
Sbjct  886  AAGCAGAAGCCAACCACGGGTCTGCTAGCCATCACCTTGGCTCTACACCTCTGCGACTTAGTGCACATTGCTGG  959

Query  840  CTTTGGCTACCCAGACGCCTACAACAAGAAGCAGACCATTCACTACTATGAGCAGATCACGCTCAAGTCCATGG  913
            |||||||||.|||||.||||.||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||||
Sbjct  960  CTTTGGCTATCCAGATGCCTCCAACAAGAAGCAGACCATCCACTACTATGAACAGATCACACTTAAGTCTATGG  1033

Query  914  CGGGGTCAGGCCATAATGTCTCCCAAGAGGCCCTGGCCATTAAGCGGATGCTGGAGATGGGAGCTATCAAGAAC  987
            ||||.||||||||||||||||||||||||||..|.|||||.|||||||||||.||||||||||||.||||||||
Sbjct 1034  CGGGATCAGGCCATAATGTCTCCCAAGAGGCTATCGCCATCAAGCGGATGCTAGAGATGGGAGCTGTCAAGAAC  1107

Query  988  CTCACGTCCTTC  999
            |||||.|.||||
Sbjct 1108  CTCACATACTTC  1119