Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11132
• Subject: XM_006510110.3
• Aligned Length: 1104
• Identities: 866
• Gaps: 108

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCTGTACCTCACCAGTGTGCCGGAGAGTCTGGGCCAGCAGGTGGCCCGAGGCAGCCGGGATGACACTTCTCC  74

Query    1  ----------------------------ATGGTCAGCAAGTCCCGCTGGAAGCTCCTGGCCATGTTGGCTCTGG  46
                                        |||..||||||.||.|.||||||||||||||||   .|||||||||
Sbjct   75  CCAGGAACCCTGCTATCTGCTGAGAAACATGACCAGCAAATCTCACTGGAAGCTCCTGGCC---CTGGCTCTGG  145

Query   47  TCC---TGGTCGTCATGGTGTGGTATTCCATCTCCCGGGAAGACAGGTACATCGAGCTTTTTTATTTTCCCATC  117
            |||   |.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||.|.|||||||||||||||
Sbjct  146  TCCTTGTTGTTGTCATGGTGTGGTATTCCATCTCCCGAGAAGATAGGTACATTGAGTTCTTTTATTTTCCCATC  219

Query  118  CCAGAGAAGAAGGAGCCGTGCCTCCAGGGTGAGGCAGAGAGCAAGGCCTCTAAGCTCTTTGGCAACTACTCCCG  191
            .||||||||||.|||||.|||.|||||||||||||||||||..|||||||||||.|.|||||||||...||..|
Sbjct  220  TCAGAGAAGAAAGAGCCATGCTTCCAGGGTGAGGCAGAGAGACAGGCCTCTAAGATTTTTGGCAACCGTTCTAG  293

Query  192  GGATCAGCCCATCTTCCTGCGGCTTGAGGATTATTTCTGGGTCAAGACGCCATCTGCTTACGAGCTGCCCTATG  265
            |||.|||||||||||.||||.||||.||||||||||.|||||.|||||||||||..|.||.||||||||||.||
Sbjct  294  GGAACAGCCCATCTTTCTGCAGCTTAAGGATTATTTTTGGGTAAAGACGCCATCCACCTATGAGCTGCCCTTTG  367

Query  266  GGACCAAGGGGAGTGAGGATCTGCTCCTCCGGGTGCTAGCCATCACCAGCTCCTCCATCCCCAAGAACATCCAG  339
            ||||.||.||.|||||.||.||.||.|||||||||||.||||||||.||||..||.||.||..|||.|||..||
Sbjct  368  GGACTAAAGGAAGTGAAGACCTTCTTCTCCGGGTGCTGGCCATCACTAGCTATTCTATACCTGAGAGCATAAAG  441

Query  340  AGCCTCAGGTGCCGCCGCTGTGTGGTCGTGGGGAACGGGCACCGGCTGCGGAACAGCTCACTGGGAGATGCCAT  413
            ||||||..|||.||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||.|||||||||||||.|||||.|.||.|||
Sbjct  442  AGCCTCGAGTGTCGTCGCTGTGTTGTGGTGGGAAATGGGCACCGGTTGCGGAACAGCTCGCTGGGCGGTGTCAT  515

Query  414  CAACAAGTACGATGTGGTCATCAGATTGAACAATGCCCCAGTGGCTGGCTATGAGGGTGACGTGGGCTCCAAGA  487
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||
Sbjct  516  CAACAAGTACGACGTGGTCATCAGATTGAACAATGCTCCTGTGGCTGGCTACGAGGGAGATGTGGGCTCCAAGA  589

Query  488  CCACCATGCGTCTCTTCTACCCTGAATCTGCCCACTTCGACCCCAAAGTAGAAAACAACCCAGACACACTCCTC  561
            |||||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||.|||||||||||||||||||.|||.|.
Sbjct  590  CCACCATACGTCTCTTCTATCCTGAGTCGGCCCACTTTGACCCTAAAATAGAAAACAACCCAGACACGCTCTTG  663

Query  562  GTCCTGGTAGCTTTCAAGGCAATGGACTTCCACTGGATTGAGACCATCCTGAGTGATAAGAAGCGGGTGCGAAA  635
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  664  GTCCTGGTAGCTTTCAAGGCGATGGACTTCCACTGGATTGAGACCATCTTGAGTGATAAGAAGCGGGTGCGAAA  737

Query  636  GGGTTTCTGGAAACAGCCTCCCCTCATCTGGGATGTCAATCCTAAACAGATTCGGATTCTCAACCCCTTCTTCA  709
            .||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||.|.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  738  AGGCTTCTGGAAACAGCCTCCCCTCATCTGGGATGTCAACCCCAAACAGGTCCGGATTCTAAACCCCTTCTTTA  811

Query  710  TGGAGATTGCAGCTGACAAACTGCTGAGCCTGCCAATGCAACAGCCACGGAAGATTAAGCAGAAGCCCACCACG  783
            |||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||
Sbjct  812  TGGAGATTGCAGCAGACAAGCTCCTGAGCCTGCCCATACAACAGCCTCGAAAGATCAAGCAGAAGCCAACCACG  885

Query  784  GGCCTGTTGGCCATCACGCTGGCCCTCCACCTCTGTGACTTGGTGCACATTGCCGGCTTTGGCTACCCAGACGC  857
            ||.|||.|.||||||||..||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||
Sbjct  886  GGTCTGCTAGCCATCACCTTGGCTCTACACCTCTGCGACTTAGTGCACATTGCTGGCTTTGGCTATCCAGATGC  959

Query  858  CTACAACAAGAAGCAGACCATTCACTACTATGAGCAGATCACGCTCAAGTCCATGGCGGGGTCAGGCCATAATG  931
            ||.||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct  960  CTCCAACAAGAAGCAGACCATCCACTACTATGAACAGATCACACTTAAGTCTATGGCGGGATCAGGCCATAATG  1033

Query  932  TCTCCCAAGAGGCCCTGGCCATTAAGCGGATGCTGGAGATGGGAGCTATCAAGAACCTCACGTCCTTC  999
            |||||||||||||..|.|||||.|||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||.|.||||
Sbjct 1034  TCTCCCAAGAGGCTATCGCCATCAAGCGGATGCTAGAGATGGGAGCTGTCAAGAACCTCACATACTTC  1101