Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_11132
Subject:
XM_006510111.3
Aligned Length:
1098
Identities:
866
Gaps:
102

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAAGTGTCGTTCAATTCCCAGTAACTTCAGAAAGGTGGCCCGAGGCAGCCGGGATGACACTTCTCCCCAGGA  74

Query    1  ----------------------ATGGTCAGCAAGTCCCGCTGGAAGCTCCTGGCCATGTTGGCTCTGGTCC---  49
                                  |||..||||||.||.|.||||||||||||||||   .||||||||||||   
Sbjct   75  ACCCTGCTATCTGCTGAGAAACATGACCAGCAAATCTCACTGGAAGCTCCTGGCC---CTGGCTCTGGTCCTTG  145

Query   50  TGGTCGTCATGGTGTGGTATTCCATCTCCCGGGAAGACAGGTACATCGAGCTTTTTTATTTTCCCATCCCAGAG  123
            |.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||.|.|||||||||||||||.|||||
Sbjct  146  TTGTTGTCATGGTGTGGTATTCCATCTCCCGAGAAGATAGGTACATTGAGTTCTTTTATTTTCCCATCTCAGAG  219

Query  124  AAGAAGGAGCCGTGCCTCCAGGGTGAGGCAGAGAGCAAGGCCTCTAAGCTCTTTGGCAACTACTCCCGGGATCA  197
            |||||.|||||.|||.|||||||||||||||||||..|||||||||||.|.|||||||||...||..||||.||
Sbjct  220  AAGAAAGAGCCATGCTTCCAGGGTGAGGCAGAGAGACAGGCCTCTAAGATTTTTGGCAACCGTTCTAGGGAACA  293

Query  198  GCCCATCTTCCTGCGGCTTGAGGATTATTTCTGGGTCAAGACGCCATCTGCTTACGAGCTGCCCTATGGGACCA  271
            |||||||||.||||.||||.||||||||||.|||||.|||||||||||..|.||.||||||||||.||||||.|
Sbjct  294  GCCCATCTTTCTGCAGCTTAAGGATTATTTTTGGGTAAAGACGCCATCCACCTATGAGCTGCCCTTTGGGACTA  367

Query  272  AGGGGAGTGAGGATCTGCTCCTCCGGGTGCTAGCCATCACCAGCTCCTCCATCCCCAAGAACATCCAGAGCCTC  345
            |.||.|||||.||.||.||.|||||||||||.||||||||.||||..||.||.||..|||.|||..||||||||
Sbjct  368  AAGGAAGTGAAGACCTTCTTCTCCGGGTGCTGGCCATCACTAGCTATTCTATACCTGAGAGCATAAAGAGCCTC  441

Query  346  AGGTGCCGCCGCTGTGTGGTCGTGGGGAACGGGCACCGGCTGCGGAACAGCTCACTGGGAGATGCCATCAACAA  419
            ..|||.||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||.|||||||||||||.|||||.|.||.|||||||||
Sbjct  442  GAGTGTCGTCGCTGTGTTGTGGTGGGAAATGGGCACCGGTTGCGGAACAGCTCGCTGGGCGGTGTCATCAACAA  515

Query  420  GTACGATGTGGTCATCAGATTGAACAATGCCCCAGTGGCTGGCTATGAGGGTGACGTGGGCTCCAAGACCACCA  493
            ||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct  516  GTACGACGTGGTCATCAGATTGAACAATGCTCCTGTGGCTGGCTACGAGGGAGATGTGGGCTCCAAGACCACCA  589

Query  494  TGCGTCTCTTCTACCCTGAATCTGCCCACTTCGACCCCAAAGTAGAAAACAACCCAGACACACTCCTCGTCCTG  567
            |.|||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||.|||||||||||||||||||.|||.|.||||||
Sbjct  590  TACGTCTCTTCTATCCTGAGTCGGCCCACTTTGACCCTAAAATAGAAAACAACCCAGACACGCTCTTGGTCCTG  663

Query  568  GTAGCTTTCAAGGCAATGGACTTCCACTGGATTGAGACCATCCTGAGTGATAAGAAGCGGGTGCGAAAGGGTTT  641
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct  664  GTAGCTTTCAAGGCGATGGACTTCCACTGGATTGAGACCATCTTGAGTGATAAGAAGCGGGTGCGAAAAGGCTT  737

Query  642  CTGGAAACAGCCTCCCCTCATCTGGGATGTCAATCCTAAACAGATTCGGATTCTCAACCCCTTCTTCATGGAGA  715
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||.|.||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct  738  CTGGAAACAGCCTCCCCTCATCTGGGATGTCAACCCCAAACAGGTCCGGATTCTAAACCCCTTCTTTATGGAGA  811

Query  716  TTGCAGCTGACAAACTGCTGAGCCTGCCAATGCAACAGCCACGGAAGATTAAGCAGAAGCCCACCACGGGCCTG  789
            |||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  812  TTGCAGCAGACAAGCTCCTGAGCCTGCCCATACAACAGCCTCGAAAGATCAAGCAGAAGCCAACCACGGGTCTG  885

Query  790  TTGGCCATCACGCTGGCCCTCCACCTCTGTGACTTGGTGCACATTGCCGGCTTTGGCTACCCAGACGCCTACAA  863
            .|.||||||||..||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||.|||
Sbjct  886  CTAGCCATCACCTTGGCTCTACACCTCTGCGACTTAGTGCACATTGCTGGCTTTGGCTATCCAGATGCCTCCAA  959

Query  864  CAAGAAGCAGACCATTCACTACTATGAGCAGATCACGCTCAAGTCCATGGCGGGGTCAGGCCATAATGTCTCCC  937
            |||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  960  CAAGAAGCAGACCATCCACTACTATGAACAGATCACACTTAAGTCTATGGCGGGATCAGGCCATAATGTCTCCC  1033

Query  938  AAGAGGCCCTGGCCATTAAGCGGATGCTGGAGATGGGAGCTATCAAGAACCTCACGTCCTTC  999
            |||||||..|.|||||.|||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||.|.||||
Sbjct 1034  AAGAGGCTATCGCCATCAAGCGGATGCTAGAGATGGGAGCTGTCAAGAACCTCACATACTTC  1095