Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_11132
- Subject:
- XM_006510112.3
- Aligned Length:
- 1098
- Identities:
- 866
- Gaps:
- 102
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAAGTGTCGTTCAATTCCCAGTAACTTCAGAAAGGTGGCCCGAGGCAGCCGGGATGACACTTCTCCCCAGGA 74
Query 1 ----------------------ATGGTCAGCAAGTCCCGCTGGAAGCTCCTGGCCATGTTGGCTCTGGTCC--- 49
|||..||||||.||.|.|||||||||||||||| .||||||||||||
Sbjct 75 ACCCTGCTATCTGCTGAGAAACATGACCAGCAAATCTCACTGGAAGCTCCTGGCC---CTGGCTCTGGTCCTTG 145
Query 50 TGGTCGTCATGGTGTGGTATTCCATCTCCCGGGAAGACAGGTACATCGAGCTTTTTTATTTTCCCATCCCAGAG 123
|.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||.|.|||||||||||||||.|||||
Sbjct 146 TTGTTGTCATGGTGTGGTATTCCATCTCCCGAGAAGATAGGTACATTGAGTTCTTTTATTTTCCCATCTCAGAG 219
Query 124 AAGAAGGAGCCGTGCCTCCAGGGTGAGGCAGAGAGCAAGGCCTCTAAGCTCTTTGGCAACTACTCCCGGGATCA 197
|||||.|||||.|||.|||||||||||||||||||..|||||||||||.|.|||||||||...||..||||.||
Sbjct 220 AAGAAAGAGCCATGCTTCCAGGGTGAGGCAGAGAGACAGGCCTCTAAGATTTTTGGCAACCGTTCTAGGGAACA 293
Query 198 GCCCATCTTCCTGCGGCTTGAGGATTATTTCTGGGTCAAGACGCCATCTGCTTACGAGCTGCCCTATGGGACCA 271
|||||||||.||||.||||.||||||||||.|||||.|||||||||||..|.||.||||||||||.||||||.|
Sbjct 294 GCCCATCTTTCTGCAGCTTAAGGATTATTTTTGGGTAAAGACGCCATCCACCTATGAGCTGCCCTTTGGGACTA 367
Query 272 AGGGGAGTGAGGATCTGCTCCTCCGGGTGCTAGCCATCACCAGCTCCTCCATCCCCAAGAACATCCAGAGCCTC 345
|.||.|||||.||.||.||.|||||||||||.||||||||.||||..||.||.||..|||.|||..||||||||
Sbjct 368 AAGGAAGTGAAGACCTTCTTCTCCGGGTGCTGGCCATCACTAGCTATTCTATACCTGAGAGCATAAAGAGCCTC 441
Query 346 AGGTGCCGCCGCTGTGTGGTCGTGGGGAACGGGCACCGGCTGCGGAACAGCTCACTGGGAGATGCCATCAACAA 419
..|||.||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||.|||||||||||||.|||||.|.||.|||||||||
Sbjct 442 GAGTGTCGTCGCTGTGTTGTGGTGGGAAATGGGCACCGGTTGCGGAACAGCTCGCTGGGCGGTGTCATCAACAA 515
Query 420 GTACGATGTGGTCATCAGATTGAACAATGCCCCAGTGGCTGGCTATGAGGGTGACGTGGGCTCCAAGACCACCA 493
||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 516 GTACGACGTGGTCATCAGATTGAACAATGCTCCTGTGGCTGGCTACGAGGGAGATGTGGGCTCCAAGACCACCA 589
Query 494 TGCGTCTCTTCTACCCTGAATCTGCCCACTTCGACCCCAAAGTAGAAAACAACCCAGACACACTCCTCGTCCTG 567
|.|||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||.|||||||||||||||||||.|||.|.||||||
Sbjct 590 TACGTCTCTTCTATCCTGAGTCGGCCCACTTTGACCCTAAAATAGAAAACAACCCAGACACGCTCTTGGTCCTG 663
Query 568 GTAGCTTTCAAGGCAATGGACTTCCACTGGATTGAGACCATCCTGAGTGATAAGAAGCGGGTGCGAAAGGGTTT 641
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 664 GTAGCTTTCAAGGCGATGGACTTCCACTGGATTGAGACCATCTTGAGTGATAAGAAGCGGGTGCGAAAAGGCTT 737
Query 642 CTGGAAACAGCCTCCCCTCATCTGGGATGTCAATCCTAAACAGATTCGGATTCTCAACCCCTTCTTCATGGAGA 715
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||.|.||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 738 CTGGAAACAGCCTCCCCTCATCTGGGATGTCAACCCCAAACAGGTCCGGATTCTAAACCCCTTCTTTATGGAGA 811
Query 716 TTGCAGCTGACAAACTGCTGAGCCTGCCAATGCAACAGCCACGGAAGATTAAGCAGAAGCCCACCACGGGCCTG 789
|||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 812 TTGCAGCAGACAAGCTCCTGAGCCTGCCCATACAACAGCCTCGAAAGATCAAGCAGAAGCCAACCACGGGTCTG 885
Query 790 TTGGCCATCACGCTGGCCCTCCACCTCTGTGACTTGGTGCACATTGCCGGCTTTGGCTACCCAGACGCCTACAA 863
.|.||||||||..||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||.|||
Sbjct 886 CTAGCCATCACCTTGGCTCTACACCTCTGCGACTTAGTGCACATTGCTGGCTTTGGCTATCCAGATGCCTCCAA 959
Query 864 CAAGAAGCAGACCATTCACTACTATGAGCAGATCACGCTCAAGTCCATGGCGGGGTCAGGCCATAATGTCTCCC 937
|||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 960 CAAGAAGCAGACCATCCACTACTATGAACAGATCACACTTAAGTCTATGGCGGGATCAGGCCATAATGTCTCCC 1033
Query 938 AAGAGGCCCTGGCCATTAAGCGGATGCTGGAGATGGGAGCTATCAAGAACCTCACGTCCTTC 999
|||||||..|.|||||.|||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||.|.||||
Sbjct 1034 AAGAGGCTATCGCCATCAAGCGGATGCTAGAGATGGGAGCTGTCAAGAACCTCACATACTTC 1095