Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11132
• Subject: XM_011242432.2
• Aligned Length: 1065
• Identities: 866
• Gaps: 69

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------------------------ATGGTCAGCAA  11
                                                                           |||..||||||
Sbjct    1  ATGGTGGCCCGAGGCAGCCGGGATGACACTTCTCCCCAGGAACCCTGCTATCTGCTGAGAAACATGACCAGCAA  74

Query   12  GTCCCGCTGGAAGCTCCTGGCCATGTTGGCTCTGGTCC---TGGTCGTCATGGTGTGGTATTCCATCTCCCGGG  82
            .||.|.||||||||||||||||   .||||||||||||   |.||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct   75  ATCTCACTGGAAGCTCCTGGCC---CTGGCTCTGGTCCTTGTTGTTGTCATGGTGTGGTATTCCATCTCCCGAG  145

Query   83  AAGACAGGTACATCGAGCTTTTTTATTTTCCCATCCCAGAGAAGAAGGAGCCGTGCCTCCAGGGTGAGGCAGAG  156
            ||||.||||||||.|||.|.|||||||||||||||.||||||||||.|||||.|||.|||||||||||||||||
Sbjct  146  AAGATAGGTACATTGAGTTCTTTTATTTTCCCATCTCAGAGAAGAAAGAGCCATGCTTCCAGGGTGAGGCAGAG  219

Query  157  AGCAAGGCCTCTAAGCTCTTTGGCAACTACTCCCGGGATCAGCCCATCTTCCTGCGGCTTGAGGATTATTTCTG  230
            ||..|||||||||||.|.|||||||||...||..||||.|||||||||||.||||.||||.||||||||||.||
Sbjct  220  AGACAGGCCTCTAAGATTTTTGGCAACCGTTCTAGGGAACAGCCCATCTTTCTGCAGCTTAAGGATTATTTTTG  293

Query  231  GGTCAAGACGCCATCTGCTTACGAGCTGCCCTATGGGACCAAGGGGAGTGAGGATCTGCTCCTCCGGGTGCTAG  304
            |||.|||||||||||..|.||.||||||||||.||||||.||.||.|||||.||.||.||.|||||||||||.|
Sbjct  294  GGTAAAGACGCCATCCACCTATGAGCTGCCCTTTGGGACTAAAGGAAGTGAAGACCTTCTTCTCCGGGTGCTGG  367

Query  305  CCATCACCAGCTCCTCCATCCCCAAGAACATCCAGAGCCTCAGGTGCCGCCGCTGTGTGGTCGTGGGGAACGGG  378
            |||||||.||||..||.||.||..|||.|||..||||||||..|||.||.||||||||.||.|||||.||.|||
Sbjct  368  CCATCACTAGCTATTCTATACCTGAGAGCATAAAGAGCCTCGAGTGTCGTCGCTGTGTTGTGGTGGGAAATGGG  441

Query  379  CACCGGCTGCGGAACAGCTCACTGGGAGATGCCATCAACAAGTACGATGTGGTCATCAGATTGAACAATGCCCC  452
            ||||||.|||||||||||||.|||||.|.||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  442  CACCGGTTGCGGAACAGCTCGCTGGGCGGTGTCATCAACAAGTACGACGTGGTCATCAGATTGAACAATGCTCC  515

Query  453  AGTGGCTGGCTATGAGGGTGACGTGGGCTCCAAGACCACCATGCGTCTCTTCTACCCTGAATCTGCCCACTTCG  526
            .|||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.|
Sbjct  516  TGTGGCTGGCTACGAGGGAGATGTGGGCTCCAAGACCACCATACGTCTCTTCTATCCTGAGTCGGCCCACTTTG  589

Query  527  ACCCCAAAGTAGAAAACAACCCAGACACACTCCTCGTCCTGGTAGCTTTCAAGGCAATGGACTTCCACTGGATT  600
            ||||.|||.|||||||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  590  ACCCTAAAATAGAAAACAACCCAGACACGCTCTTGGTCCTGGTAGCTTTCAAGGCGATGGACTTCCACTGGATT  663

Query  601  GAGACCATCCTGAGTGATAAGAAGCGGGTGCGAAAGGGTTTCTGGAAACAGCCTCCCCTCATCTGGGATGTCAA  674
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  664  GAGACCATCTTGAGTGATAAGAAGCGGGTGCGAAAAGGCTTCTGGAAACAGCCTCCCCTCATCTGGGATGTCAA  737

Query  675  TCCTAAACAGATTCGGATTCTCAACCCCTTCTTCATGGAGATTGCAGCTGACAAACTGCTGAGCCTGCCAATGC  748
            .||.||||||.|.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.|
Sbjct  738  CCCCAAACAGGTCCGGATTCTAAACCCCTTCTTTATGGAGATTGCAGCAGACAAGCTCCTGAGCCTGCCCATAC  811

Query  749  AACAGCCACGGAAGATTAAGCAGAAGCCCACCACGGGCCTGTTGGCCATCACGCTGGCCCTCCACCTCTGTGAC  822
            |||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||.|.||||||||..||||.||.||||||||.|||
Sbjct  812  AACAGCCTCGAAAGATCAAGCAGAAGCCAACCACGGGTCTGCTAGCCATCACCTTGGCTCTACACCTCTGCGAC  885

Query  823  TTGGTGCACATTGCCGGCTTTGGCTACCCAGACGCCTACAACAAGAAGCAGACCATTCACTACTATGAGCAGAT  896
            ||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||.||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct  886  TTAGTGCACATTGCTGGCTTTGGCTATCCAGATGCCTCCAACAAGAAGCAGACCATCCACTACTATGAACAGAT  959

Query  897  CACGCTCAAGTCCATGGCGGGGTCAGGCCATAATGTCTCCCAAGAGGCCCTGGCCATTAAGCGGATGCTGGAGA  970
            |||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||..|.|||||.|||||||||||.||||
Sbjct  960  CACACTTAAGTCTATGGCGGGATCAGGCCATAATGTCTCCCAAGAGGCTATCGCCATCAAGCGGATGCTAGAGA  1033

Query  971  TGGGAGCTATCAAGAACCTCACGTCCTTC  999
            ||||||||.|||||||||||||.|.||||
Sbjct 1034  TGGGAGCTGTCAAGAACCTCACATACTTC  1062