Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11157
• Subject: NM_146032.3
• Aligned Length: 1881
• Identities: 1568
• Gaps: 99

Alignment

Query    1  ATGGCTGCTGAGAAGCAGGTCCCAGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCAGTGGCGGCGGCGGTGGCAGTGGCGGCGG  74
            ||||||||||||||||||.||||.||.||.||..|.||.||.|   ||||..|||||.|.|||.|.||||||||
Sbjct    1  ATGGCTGCTGAGAAGCAGATCCCGGGTGGTGGTAGTGGTGGTG---GTGGAAGCGGCAGCGGCGGCGGCGGCGG  71

Query   75  CGGTAGCGGCGGTGGACGTGGTGCCGGAGGGGAAGAAAATAAAGAAAACGAACGCCCTTCGGCCGGATCGAAGG  148
            .||.|||||.||.|||||..||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct   72  AGGGAGCGGTGGCGGACGCAGTGCCGGAGGAGACGAGAATAAAGAAAACGAACGCCCTTCAGCCGGATCGAAGG  145

Query  149  CAAACAAAGAATTTGGGGATAGCCTGAGTTTGGAGATTCTTCAGATTATTAAGGAATCCCAGCAGCAGCATGGT  222
            ||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.
Sbjct  146  CAAACAAAGAGTTCGGGGACAGCCTGAGTTTGGAGATTCTGCAGATCATTAAGGAGTCGCAGCAGCAGCATGGC  219

Query  223  TTACGGCATGGAGATTTTCAGAGGTACAGGGGCTACTGTTCCCGTAGACAAAGACGTCTTCGAAAAACACTCAA  296
            ||||||||.|||||.||.|||.|||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||||||||
Sbjct  220  TTACGGCACGGAGACTTCCAGCGGTACAGGGGCTACTGTTCTCGAAGACAAAGACGCCTCCGGAAAACACTCAA  293

Query  297  CTTCAAGATGGGTAACAGACACAAATTCACAGGGAAGAAAGTGACTGAAGAGCTTCTGACCGATAATAGATACT  370
            |||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct  294  CTTTAAGATGGGGAACAGACACAAATTCACGGGGAAGAAAGTAACGGAGGAGCTCCTGACTGATAACAGATACT  367

Query  371  TGCTTCTGGTTCTGATGGATGCTGAAAGAGCCTGGAGCTACGCCATGCAGCTGAAACAGGAAGCCAACACTGAA  444
            ||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.
Sbjct  368  TGCTGCTGGTGCTGATGGATGCAGAAAGAGCCTGGAGCTACGCCATGCAGCTCAAACAGGAAGCCAACACCGAG  441

Query  445  CCCCGAAAACGGTTTCACTTGTTATCTCGCCTACGCAAAGCCGTGAAGCATGCAGAGGAATTGGAACGCTTGTG  518
            ||.||.|||||||||||||||.|.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||
Sbjct  442  CCGCGGAAACGGTTTCACTTGCTGTCTCGCCTTCGAAAAGCCGTGAAGCATGCAGAGGAACTGGAGCGCTTGTG  515

Query  519  TGAGAGCAATCGCGTGGATGCCAAGACCAAATTAGAGGCTCAGGCTTACACAGCTTACCTCTCAGGAATGCTAC  592
            |||||||||.||.|||||||||||||||||..|||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||.|.|
Sbjct  516  TGAGAGCAACCGGGTGGATGCCAAGACCAAGCTAGAGGCTCAGGCCTACACGGCTTACCTCTCAGGAATGTTGC  589

Query  593  GTTTTGAACATCAAGAATGGAAAGCTGCCATTGAGGCTTTTAACAAATGCAAAACTATCTATGAGAAGCTAGCC  666
            |.||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  590  GCTTTGAACATCAAGAGTGGAAATCTGCCATTGAGGCTTTCAACAAATGCAAAACTATCTATGAGAAGCTAGCC  663

Query  667  AGTGCTTTCACAGAGGAGCAGGCTGTGCTGTATAACCAACGTGTGGAAGAGATTTCACCCAACATCCGCTATTG  740
            |||||.|||||||||||||||||||||.||||.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.||
Sbjct  664  AGTGCATTCACAGAGGAGCAGGCTGTGTTGTACAACCAGCGTGTAGAAGAGATCTCGCCCAACATCCGCTACTG  737

Query  741  TGCATATAATATTGGGGACCAGTC--------------------------------------------------  764
            ||||||.||.||||||||||||||                                                  
Sbjct  738  TGCATACAACATTGGGGACCAGTCAGCTATCAATGAGCTCATGCAGATGAGACTAAGGTCTGGGGGCACAGAGG  811

Query  765  -------------------------------------------AGCCAAACAGGCAGCTACCATGAGTGAAGTG  795
                                                       ||||||.|||||.||.|||||||||||.|||
Sbjct  812  GGCTCCTTGCTGAAAAACTTGAGGCCTTGATCACTCAGACTCGAGCCAAGCAGGCGGCGACCATGAGTGAGGTG  885

Query  796  GAGTGGAGAGGGAGAACGGTTCCAGTGAAGATTGACAAAGTGCGCATTTTCTTATTAGGACTGGCTGATAACGA  869
            ||||||.||||..|.|||||.||.||||||||.|||||||||.|.||.|||.|..|.||.|||||.||.|||||
Sbjct  886  GAGTGGCGAGGCCGGACGGTCCCCGTGAAGATCGACAAAGTGAGGATCTTCCTCCTGGGCCTGGCCGACAACGA  959

Query  870  AGCAGCTATTGTCCAGGCTGAAAGCGAAGAAACTAAGGAGCGCCTGTTTGAATCAATGCTCAGCGAGTGTCGGG  943
            .||.||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||.|||||.||.|||||.||.|
Sbjct  960  GGCCGCCATCGTCCAGGCTGAAAGTGAAGAAACGAAGGAGCGTCTGTTCGAGTCCATGCTGAGTGAGTGCCGAG  1033

Query  944  ACGCCATCCAGGTGGTTCGGGAGGAGCTCAAGCCAGATCAGAAACAGAGAGATTATATCCTTGAAGGAGAGCCA  1017
            |||||.||||.|..||..||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||..||||||.||||||.|.
Sbjct 1034  ACGCCCTCCAAGCCGTGAGGGAAGAGCTCAAGCCCGATCAGAAGCAGAGAGACTATGCCCTTGATGGAGAGTCT  1107

Query 1018  GGGAAGGTGTCTAATCTTCAATACTTGCATAGCTACCTGACTTACATCAAGCTATCAACGGCAATCAAGCGTAA  1091
            |||||||||||.|||||.||.|||.||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||.|||.||
Sbjct 1108  GGGAAGGTGTCAAATCTCCAGTACCTGCACAGCTACCTGACCTACATCAAGCTGTCAACAGCAATCAGGCGAAA  1181

Query 1092  TGAGAACATGGCCAAAGGTCTGCAGAGGGCTCTGCTGCAGCAGCAGCCAGAGGATGACAGCAAGCGCTCACCCC  1165
            .|||||||||||.|||||..||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||.
Sbjct 1182  CGAGAACATGGCTAAAGGCTTGCACAGGGCTCTGCTGCAGCAGCAGCCGGAAGATGACAGCAAGCGCTCTCCCA  1255

Query 1166  GGCCCCAGGACCTGATCCGACTCTATGACATCATCTTACAGAATCTGGTGGAATTGCTCCAGCTTCCTGGTTTA  1239
            ||||.||||||||.|||||.||||||||||||||..|.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 1256  GGCCTCAGGACCTCATCCGGCTCTATGACATCATTCTGCAGAATCTGGTGGAATTGCTGCAGCTTCCTGGCTTA  1329

Query 1240  GAGGAAGACAAAGCCTTCCAGAAAGAGATAGGCCTCAAGACTCTGGTGTTCAAAGCTTACAGGTGTTTTTTCAT  1313
            ||.||.||||.|.|||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1330  GAAGAGGACAGAACCTTCCAGAAAGAGATAAGCCTCAAGACCCTGGTGTTCAAAGCTTACAGGTGTTTCTTCAT  1403

Query 1314  TGCTCAGTCCTATGTGCTGGTGAAGAAGTGGAGCGAAGCCCTTGTCCTGTATGACAGAGTCCTGAAATATGCAA  1387
            |||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||
Sbjct 1404  TGCTCAGTCTTACGTGCTGGTGAAGAAGTGGAGCGAAGCCCTCGTCCTGTACGACAGAGTTCTCAAATATGCAA  1477

Query 1388  ATGAAGTAAATTCTGATGCTGGCGCCTTCAAGAACAGCCTAAAGGACCTGCCTGATGTGCAAGAGCTCATCACT  1461
            |||||||.|.||||.|.|..||.||||.||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||
Sbjct 1478  ATGAAGTGAGTTCTCACGGAGGAGCCTCCAAGAACAGCCTGAAGGACCTGCCCGACGTGCAAGAACTCATCACT  1551

Query 1462  CAAGTGCGGTCAGAGAAGTGCTCCCTGCAGGCCGCAGCCATCCTTGATGCAAACGACGCTCATCAAACAGAGAC  1535
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||   
Sbjct 1552  CAAGTGCGGTCAGAGAAGTGCTCGCTGCAGGCCGCAGCCATCCTGGATGCAAACGACTCTCATCAAACAGA---  1622

Query 1536  CTCCTCCTCCCAAGTCAAGGACAATAAGCCTCTGGTTGAACGGTTTGAGACATTCTGCCTGGACCCTTCCCTTG  1609
            |.||||.|||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||.|.||.|||||||||||.|||||.|
Sbjct 1623  CACCTCATCCCAAGTCAAAGACAATACGCCTCTGGTTGAACGGTTTGAGTCCTTTTGCCTGGACCCGTCCCTGG  1696

Query 1610  TCACCAAGCAAGCCAACCTTGTGCACTTCCCACCAGGCTTCCAGCCCATTCCCTGCAAGCCTTTGTTCTTTGAC  1683
            |||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1697  TCACCAAACAAGCCAACCTCGTGCACTTCCCACCAGGGTTCCAGCCCATCCCTTGCAAGCCTTTGTTCTTTGAC  1770

Query 1684  CTGGCCCTCAACCATGTGGCTTTCCCACCCCTTGAGGACAAGTTGGAACAGAAGACCAAGAGTGGCCTCACTGG  1757
            ||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 1771  CTGGCCCTCAACCACGTGGCCTTCCCACCCCTTGAGGACAAATTGGAGCAGAAGACTAAGAGTGGCCTCACAGG  1844

Query 1758  ATACATCAAGGGCATCTTTGGATTCAGGAGC  1788
            .||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1845  CTACATCAAGGGCATCTTTGGTTTCAGGAGC  1875