Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11185
• Subject: NM_001166585.1
• Aligned Length: 1245
• Identities: 969
• Gaps: 186

Alignment

Query    1  ATGGAAAGGATGAGTGACTCTGCAGATAAGCCAATTGACAATGATGCAGAAGGGGTCTGGAGCCCCGACATCGA  74
            ||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.||.||.||.||||||||.||.||.||.||
Sbjct    1  ATGGAAAGGATGAGCGACTCGGCAGATAAGCCGATTGACAACGACGCGGAGGGCGTCTGGAGTCCTGATATTGA  74

Query   75  GCAAAGCTTTCAGGAGGCCCTGGCTATCTATCCACCATGTGGGAGGAGGAAAATCATCTTATCAGACGAAGGCA  148
            |||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCAGAGTTTCCAGGAGGCCCTGGCTATCTATCCGCCGTGTGGGAGGAGAAAAATCATCTTATCAGACGAAGGCA  148

Query  149  AAATGTATGGTAGGAATGAATTGATAGCCAGATACATCAAACTCAGGACAGGCAAGACGAGGACCAGAAAACAG  222
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||
Sbjct  149  AAATGTATGGTAGAAATGAATTGATAGCCAGATACATCAAACTCAGGACGGGAAAGACAAGGACCAGGAAGCAG  222

Query  223  GTGTCTAGTCACATTCAGGTTCTTGCCAGAAGGAAATCTCGTGATTTTCATTCCAAGCTAAAGGTAACAAGCAT  296
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||            
Sbjct  223  GTGTCTAGTCACATTCAGGTTCTTGCCAGAAGGAAATCTCGTGATTTTCATTCCAAGCTGAA------------  284

Query  297  GGATCAGACTGCAAAGGATAAGGCCCTGCAGCACATGGCGGCCATGTCCTCAGCCCAGATCGTCTCGGCCACTG  370
            ||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  285  GGATCAGACTGCCAAGGACAAGGCCCTGCAGCACATGGCTGCCATGTCATCAGCCCAGATCGTCTCGGCTACTG  358

Query  371  CCATTCATAACAAGCTGGGGCTGCCTGGGATTCCACGCCCGACCTTCCCAGGGGCGCCGGGGTTCTGGCCGGGA  444
            ||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||..||||||||||||||.||.
Sbjct  359  CCATCCACAACAAGCTGGGGCTGCCTGGGATTCCACGCCCCACCTTCCCGGGGGGTCCGGGGTTCTGGCCTGGG  432

Query  445  ATGATTCAAACAGGGCAGCCAGGATCCTCACAAGACGTCAAGCCTTTTGTGCAGCAGGCCTACCCCATCCAGCC  518
            |||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  433  ATGATACAGACAGGACAGCCAGGATCCTCACAAGACGTCAAGCCCTTTGTGCAGCAGGCCTACCCCATCCAGCC  506

Query  519  AGCGGTCACAGCCCCCATTCCAGGGTTTGAGCCTGCATCGGCCCCAGCTCCCTCAGTCCCTGCCTGGCAAGGTC  592
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|
Sbjct  507  AGCAGTCACAGCCCCCATTCCAGGGTTTGAGCCTACGTCAGCCCCAGCCCCCTCAGTTCCTGCCTGGCAGGGCC  580

Query  593  GCTCCATTGGCACAACCAAGCTTCGCCTGGTGGAATTTTCAGCTTTTCTCGAGCAGCAGCGAGACCCAGACTC-  665
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||||||.||||||||||||| 
Sbjct  581  GATCCATTGGCACAACCAAGCTTCGCCTGGTGGAATTCTCCGCTTTCCTTGAACAGCAGAGAGACCCAGACTCG  654

Query  666  --------------------------------------------------------------------------  665
                                                                                      
Sbjct  655  TACAACAAACACCTCTTCGTGCACATCGGGCATGCCAACCATTCTTACAGTGACCCGTTGCTCGAATCTGTGGA  728

Query  666  --------------------------------------------------------------------------  665
                                                                                      
Sbjct  729  CATTCGTCAGATATATGACAAATTTCCTGAAAAGAAAGGTGGCTTGAAGGAGCTGTTTGGAAAGGGCCCTCAAA  802

Query  666  -------------------------GGCTGATTTAAACTGCAATATTCAAGATGATGCTGGGGCTTTTTATGGT  714
                                     |||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.|||||||||
Sbjct  803  ACGCCTTCTTCCTCGTCAAATTCTGGGCGGACTTAAACTGCAATATCCAAGACGACGCCGGGGCCTTTTATGGT  876

Query  715  GTAACCAGTCAGTACGAGAGTTCTGAAAATATGACAGTCACCTGTTCCACCAAAGTTTGCTCCTTTGGGAAGCA  788
            ||.|.|||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct  877  GTGAGCAGTCAGTATGAGAGTTCTGAGAACATGACAGTTACCTGTTCCACCAAAGTGTGCTCCTTTGGGAAACA  950

Query  789  AGTAGTAGAAAAAGTAGAGACGGAGTATGCAAGGTTTGAGAATGGCCGATTTGTATACCGAATAAACCGCTCCC  862
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  951  AGTAGTAGAAAAAGTAGAGACGGAGTATGCGAGGTTCGAGAATGGTCGATTCGTGTACCGAATAAACCGCTCGC  1024

Query  863  CAATGTGTGAATATATGATCAACTTCATCCACAAGCTCAAACACTTACCAGAGAAATATATGATGAACAGTGTT  936
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1025  CAATGTGTGAATATATGATCAACTTCATCCACAAGCTCAAACACCTACCAGAGAAATATATGATGAACAGTGTT  1098

Query  937  TTGGAAAACTTCACAATTTTATTGGTGGTAACAAACAGGGATACACAAGAAACTCTACTCTGCATGGCCTGTGT  1010
            ||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1099  TTGGAAAACTTCACCATATTATTGGTGGTAACAAACAGGGATACACAAGAAACTCTGCTCTGCATGGCCTGTGT  1172

Query 1011  GTTTGAAGTTTCAAATAGTGAACACGGAGCACAACATCATATTTACAGGCTTGTAAAGGAC  1071
            .||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1173  ATTTGAAGTCTCGAATAGCGAACACGGAGCACAGCACCATATCTACAGGCTTGTGAAGGAC  1233