Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11185
• Subject: NM_009346.3
• Aligned Length: 1245
• Identities: 981
• Gaps: 174

Alignment

Query    1  ATGGAAAGGATGAGTGACTCTGCAGATAAGCCAATTGACAATGATGCAGAAGGGGTCTGGAGCCCCGACATCGA  74
            ||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.||.||.||.||||||||.||.||.||.||
Sbjct    1  ATGGAAAGGATGAGCGACTCGGCAGATAAGCCGATTGACAACGACGCGGAGGGCGTCTGGAGTCCTGATATTGA  74

Query   75  GCAAAGCTTTCAGGAGGCCCTGGCTATCTATCCACCATGTGGGAGGAGGAAAATCATCTTATCAGACGAAGGCA  148
            |||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCAGAGTTTCCAGGAGGCCCTGGCTATCTATCCGCCGTGTGGGAGGAGAAAAATCATCTTATCAGACGAAGGCA  148

Query  149  AAATGTATGGTAGGAATGAATTGATAGCCAGATACATCAAACTCAGGACAGGCAAGACGAGGACCAGAAAACAG  222
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||
Sbjct  149  AAATGTATGGTAGAAATGAATTGATAGCCAGATACATCAAACTCAGGACGGGAAAGACAAGGACCAGGAAGCAG  222

Query  223  GTGTCTAGTCACATTCAGGTTCTTGCCAGAAGGAAATCTCGTGATTTTCATTCCAAGCTAAAGGTAACAAGCAT  296
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  223  GTGTCTAGTCACATTCAGGTTCTTGCCAGAAGGAAATCTCGTGATTTTCATTCCAAGCTGAAGGTAACAAGCAT  296

Query  297  GGATCAGACTGCAAAGGATAAGGCCCTGCAGCACATGGCGGCCATGTCCTCAGCCCAGATCGTCTCGGCCACTG  370
            ||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  297  GGATCAGACTGCCAAGGACAAGGCCCTGCAGCACATGGCTGCCATGTCATCAGCCCAGATCGTCTCGGCTACTG  370

Query  371  CCATTCATAACAAGCTGGGGCTGCCTGGGATTCCACGCCCGACCTTCCCAGGGGCGCCGGGGTTCTGGCCGGGA  444
            ||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||..||||||||||||||.||.
Sbjct  371  CCATCCACAACAAGCTGGGGCTGCCTGGGATTCCACGCCCCACCTTCCCGGGGGGTCCGGGGTTCTGGCCTGGG  444

Query  445  ATGATTCAAACAGGGCAGCCAGGATCCTCACAAGACGTCAAGCCTTTTGTGCAGCAGGCCTACCCCATCCAGCC  518
            |||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATGATACAGACAGGACAGCCAGGATCCTCACAAGACGTCAAGCCCTTTGTGCAGCAGGCCTACCCCATCCAGCC  518

Query  519  AGCGGTCACAGCCCCCATTCCAGGGTTTGAGCCTGCATCGGCCCCAGCTCCCTCAGTCCCTGCCTGGCAAGGTC  592
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|
Sbjct  519  AGCAGTCACAGCCCCCATTCCAGGGTTTGAGCCTACGTCAGCCCCAGCCCCCTCAGTTCCTGCCTGGCAGGGCC  592

Query  593  GCTCCATTGGCACAACCAAGCTTCGCCTGGTGGAATTTTCAGCTTTTCTCGAGCAGCAGCGAGACCCAGACTC-  665
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||||||.||||||||||||| 
Sbjct  593  GATCCATTGGCACAACCAAGCTTCGCCTGGTGGAATTCTCCGCTTTCCTTGAACAGCAGAGAGACCCAGACTCG  666

Query  666  --------------------------------------------------------------------------  665
                                                                                      
Sbjct  667  TACAACAAACACCTCTTCGTGCACATCGGGCATGCCAACCATTCTTACAGTGACCCGTTGCTCGAATCTGTGGA  740

Query  666  --------------------------------------------------------------------------  665
                                                                                      
Sbjct  741  CATTCGTCAGATATATGACAAATTTCCTGAAAAGAAAGGTGGCTTGAAGGAGCTGTTTGGAAAGGGCCCTCAAA  814

Query  666  -------------------------GGCTGATTTAAACTGCAATATTCAAGATGATGCTGGGGCTTTTTATGGT  714
                                     |||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.|||||||||
Sbjct  815  ACGCCTTCTTCCTCGTCAAATTCTGGGCGGACTTAAACTGCAATATCCAAGACGACGCCGGGGCCTTTTATGGT  888

Query  715  GTAACCAGTCAGTACGAGAGTTCTGAAAATATGACAGTCACCTGTTCCACCAAAGTTTGCTCCTTTGGGAAGCA  788
            ||.|.|||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct  889  GTGAGCAGTCAGTATGAGAGTTCTGAGAACATGACAGTTACCTGTTCCACCAAAGTGTGCTCCTTTGGGAAACA  962

Query  789  AGTAGTAGAAAAAGTAGAGACGGAGTATGCAAGGTTTGAGAATGGCCGATTTGTATACCGAATAAACCGCTCCC  862
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  963  AGTAGTAGAAAAAGTAGAGACGGAGTATGCGAGGTTCGAGAATGGTCGATTCGTGTACCGAATAAACCGCTCGC  1036

Query  863  CAATGTGTGAATATATGATCAACTTCATCCACAAGCTCAAACACTTACCAGAGAAATATATGATGAACAGTGTT  936
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAATGTGTGAATATATGATCAACTTCATCCACAAGCTCAAACACCTACCAGAGAAATATATGATGAACAGTGTT  1110

Query  937  TTGGAAAACTTCACAATTTTATTGGTGGTAACAAACAGGGATACACAAGAAACTCTACTCTGCATGGCCTGTGT  1010
            ||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTGGAAAACTTCACCATATTATTGGTGGTAACAAACAGGGATACACAAGAAACTCTGCTCTGCATGGCCTGTGT  1184

Query 1011  GTTTGAAGTTTCAAATAGTGAACACGGAGCACAACATCATATTTACAGGCTTGTAAAGGAC  1071
            .||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1185  ATTTGAAGTCTCGAATAGCGAACACGGAGCACAGCACCATATCTACAGGCTTGTGAAGGAC  1245