Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_11185
- Subject:
- NM_021961.6
- Aligned Length:
- 1290
- Identities:
- 1059
- Gaps:
- 231
Alignment
Query 1 ---------------------------------------------ATGGAAAGGATGAGTGACTCTGCAGATAA 29
|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATTGAGCCCAGCAGCTGGAGCGGCAGTGAGAGCCCTGCCGAAAACATGGAAAGGATGAGTGACTCTGCAGATAA 74
Query 30 GCCAATTGACAATGATGCAGAAGGGGTCTGGAGCCCCGACATCGAGCAAAGCTTTCAGGAGGCCCTGGCTATCT 103
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GCCAATTGACAATGATGCAGAAGGGGTCTGGAGCCCCGACATCGAGCAAAGCTTTCAGGAGGCCCTGGCTATCT 148
Query 104 ATCCACCATGTGGGAGGAGGAAAATCATCTTATCAGACGAAGGCAAAATGTATGGTAGGAATGAATTGATAGCC 177
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ATCCACCATGTGGGAGGAGGAAAATCATCTTATCAGACGAAGGCAAAATGTATGGTAGGAATGAATTGATAGCC 222
Query 178 AGATACATCAAACTCAGGACAGGCAAGACGAGGACCAGAAAACAGGTGTCTAGTCACATTCAGGTTCTTGCCAG 251
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AGATACATCAAACTCAGGACAGGCAAGACGAGGACCAGAAAACAGGTGTCTAGTCACATTCAGGTTCTTGCCAG 296
Query 252 AAGGAAATCTCGTGATTTTCATTCCAAGCTAAAGGTAACAAGCATGGATCAGACTGCAAAGGATAAGGCCCTGC 325
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AAGGAAATCTCGTGATTTTCATTCCAAGCTAAA------------GGATCAGACTGCAAAGGATAAGGCCCTGC 358
Query 326 AGCACATGGCGGCCATGTCCTCAGCCCAGATCGTCTCGGCCACTGCCATTCATAACAAGCTGGGGCTGCCTGGG 399
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 359 AGCACATGGCGGCCATGTCCTCAGCCCAGATCGTCTCGGCCACTGCCATTCATAACAAGCTGGGGCTGCCTGGG 432
Query 400 ATTCCACGCCCGACCTTCCCAGGGGCGCCGGGGTTCTGGCCGGGAATGATTCAAACAGGGCAGCCAGGATCCTC 473
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 433 ATTCCACGCCCGACCTTCCCAGGGGCGCCGGGGTTCTGGCCGGGAATGATTCAAACAGGGCAGCCAGGATCCTC 506
Query 474 ACAAGACGTCAAGCCTTTTGTGCAGCAGGCCTACCCCATCCAGCCAGCGGTCACAGCCCCCATTCCAGGGTTTG 547
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 507 ACAAGACGTCAAGCCTTTTGTGCAGCAGGCCTACCCCATCCAGCCAGCGGTCACAGCCCCCATTCCAGGGTTTG 580
Query 548 AGCCTGCATCGGCCCCAGCTCCCTCAGTCCCTGCCTGGCAAGGTCGCTCCATTGGCACAACCAAGCTTCGCCTG 621
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 581 AGCCTGCATCGGCCCCAGCTCCCTCAGTCCCTGCCTGGCAAGGTCGCTCCATTGGCACAACCAAGCTTCGCCTG 654
Query 622 GTGGAATTTTCAGCTTTTCTCGAGCAGCAGCGAGACCCAGACTC------------------------------ 665
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 655 GTGGAATTTTCAGCTTTTCTCGAGCAGCAGCGAGACCCAGACTCGTACAACAAACACCTCTTCGTGCACATTGG 728
Query 666 -------------------------------------------------------------------------- 665
Sbjct 729 GCATGCCAACCATTCTTACAGTGACCCATTGCTTGAATCAGTGGACATTCGTCAGATTTATGACAAATTTCCTG 802
Query 666 ----------------------------------------------------------------------GGCT 669
||||
Sbjct 803 AAAAGAAAGGTGGCTTAAAGGAACTGTTTGGAAAGGGCCCTCAAAATGCCTTCTTCCTCGTAAAATTCTGGGCT 876
Query 670 GATTTAAACTGCAATATTCAAGATGATGCTGGGGCTTTTTATGGTGTAACCAGTCAGTACGAGAGTTCTGAAAA 743
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 877 GATTTAAACTGCAATATTCAAGATGATGCTGGGGCTTTTTATGGTGTAACCAGTCAGTACGAGAGTTCTGAAAA 950
Query 744 TATGACAGTCACCTGTTCCACCAAAGTTTGCTCCTTTGGGAAGCAAGTAGTAGAAAAAGTAGAGACGGAGTATG 817
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 951 TATGACAGTCACCTGTTCCACCAAAGTTTGCTCCTTTGGGAAGCAAGTAGTAGAAAAAGTAGAGACGGAGTATG 1024
Query 818 CAAGGTTTGAGAATGGCCGATTTGTATACCGAATAAACCGCTCCCCAATGTGTGAATATATGATCAACTTCATC 891
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1025 CAAGGTTTGAGAATGGCCGATTTGTATACCGAATAAACCGCTCCCCAATGTGTGAATATATGATCAACTTCATC 1098
Query 892 CACAAGCTCAAACACTTACCAGAGAAATATATGATGAACAGTGTTTTGGAAAACTTCACAATTTTATTGGTGGT 965
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1099 CACAAGCTCAAACACTTACCAGAGAAATATATGATGAACAGTGTTTTGGAAAACTTCACAATTTTATTGGTGGT 1172
Query 966 AACAAACAGGGATACACAAGAAACTCTACTCTGCATGGCCTGTGTGTTTGAAGTTTCAAATAGTGAACACGGAG 1039
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1173 AACAAACAGGGATACACAAGAAACTCTACTCTGCATGGCCTGTGTGTTTGAAGTTTCAAATAGTGAACACGGAG 1246
Query 1040 CACAACATCATATTTACAGGCTTGTAAAGGAC 1071
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1247 CACAACATCATATTTACAGGCTTGTAAAGGAC 1278