Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11185
• Subject: XM_006507561.2
• Aligned Length: 1308
• Identities: 969
• Gaps: 249

Alignment

Query    1  ATGGAAAGGATGAGTGACTCTGCAGATAAGCCAATTGACAATGATGCAGAAGGGGTCTGGAGCCCCGACATCGA  74
            ||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.||.||.||.||||||||.||.||.||.||
Sbjct    1  ATGGAAAGGATGAGCGACTCGGCAGATAAGCCGATTGACAACGACGCGGAGGGCGTCTGGAGTCCTGATATTGA  74

Query   75  GCAAAGCTTTCAGGAGGCCCTGGCTATCTATCCACCATGTGGGAGGAGGAAAATCATCTTATCAGACGAAGGCA  148
            |||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCAGAGTTTCCAGGAGGCCCTGGCTATCTATCCGCCGTGTGGGAGGAGAAAAATCATCTTATCAGACGAAGGCA  148

Query  149  AAATGTATGGTAGGAATGAATTGATAGCCAGATACATCAAACTCAGGACAGGCAAGACGAGGACCAGAAAAC--  220
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.|  
Sbjct  149  AAATGTATGGTAGAAATGAATTGATAGCCAGATACATCAAACTCAGGACGGGAAAGACAAGGACCAGGAAGCAG  222

Query  221  -------------------------------------------------------------AGGTGTCTAGTCA  233
                                                                         |||||||||||||
Sbjct  223  GTGTCTAGTCATATACAGGTCTTAGCAAGAAAGAAAGTTCGAGAAATTCAAGCCGCCATTAAGGTGTCTAGTCA  296

Query  234  CATTCAGGTTCTTGCCAGAAGGAAATCTCGTGATTTTCATTCCAAGCTAAAGGTAACAAGCATGGATCAGACTG  307
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||            |||||||||||
Sbjct  297  CATTCAGGTTCTTGCCAGAAGGAAATCTCGTGATTTTCATTCCAAGCTGAA------------GGATCAGACTG  358

Query  308  CAAAGGATAAGGCCCTGCAGCACATGGCGGCCATGTCCTCAGCCCAGATCGTCTCGGCCACTGCCATTCATAAC  381
            |.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||
Sbjct  359  CCAAGGACAAGGCCCTGCAGCACATGGCTGCCATGTCATCAGCCCAGATCGTCTCGGCTACTGCCATCCACAAC  432

Query  382  AAGCTGGGGCTGCCTGGGATTCCACGCCCGACCTTCCCAGGGGCGCCGGGGTTCTGGCCGGGAATGATTCAAAC  455
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||..||||||||||||||.||.|||||.||.||
Sbjct  433  AAGCTGGGGCTGCCTGGGATTCCACGCCCCACCTTCCCGGGGGGTCCGGGGTTCTGGCCTGGGATGATACAGAC  506

Query  456  AGGGCAGCCAGGATCCTCACAAGACGTCAAGCCTTTTGTGCAGCAGGCCTACCCCATCCAGCCAGCGGTCACAG  529
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  507  AGGACAGCCAGGATCCTCACAAGACGTCAAGCCCTTTGTGCAGCAGGCCTACCCCATCCAGCCAGCAGTCACAG  580

Query  530  CCCCCATTCCAGGGTTTGAGCCTGCATCGGCCCCAGCTCCCTCAGTCCCTGCCTGGCAAGGTCGCTCCATTGGC  603
            |||||||||||||||||||||||.|.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||
Sbjct  581  CCCCCATTCCAGGGTTTGAGCCTACGTCAGCCCCAGCCCCCTCAGTTCCTGCCTGGCAGGGCCGATCCATTGGC  654

Query  604  ACAACCAAGCTTCGCCTGGTGGAATTTTCAGCTTTTCTCGAGCAGCAGCGAGACCCAGACTC------------  665
            ||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||||||.|||||||||||||            
Sbjct  655  ACAACCAAGCTTCGCCTGGTGGAATTCTCCGCTTTCCTTGAACAGCAGAGAGACCCAGACTCGTACAACAAACA  728

Query  666  --------------------------------------------------------------------------  665
                                                                                      
Sbjct  729  CCTCTTCGTGCACATCGGGCATGCCAACCATTCTTACAGTGACCCGTTGCTCGAATCTGTGGACATTCGTCAGA  802

Query  666  --------------------------------------------------------------------------  665
                                                                                      
Sbjct  803  TATATGACAAATTTCCTGAAAAGAAAGGTGGCTTGAAGGAGCTGTTTGGAAAGGGCCCTCAAAACGCCTTCTTC  876

Query  666  --------------GGCTGATTTAAACTGCAATATTCAAGATGATGCTGGGGCTTTTTATGGTGTAACCAGTCA  725
                          |||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||.|.||||||
Sbjct  877  CTCGTCAAATTCTGGGCGGACTTAAACTGCAATATCCAAGACGACGCCGGGGCCTTTTATGGTGTGAGCAGTCA  950

Query  726  GTACGAGAGTTCTGAAAATATGACAGTCACCTGTTCCACCAAAGTTTGCTCCTTTGGGAAGCAAGTAGTAGAAA  799
            |||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  951  GTATGAGAGTTCTGAGAACATGACAGTTACCTGTTCCACCAAAGTGTGCTCCTTTGGGAAACAAGTAGTAGAAA  1024

Query  800  AAGTAGAGACGGAGTATGCAAGGTTTGAGAATGGCCGATTTGTATACCGAATAAACCGCTCCCCAATGTGTGAA  873
            |||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1025  AAGTAGAGACGGAGTATGCGAGGTTCGAGAATGGTCGATTCGTGTACCGAATAAACCGCTCGCCAATGTGTGAA  1098

Query  874  TATATGATCAACTTCATCCACAAGCTCAAACACTTACCAGAGAAATATATGATGAACAGTGTTTTGGAAAACTT  947
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1099  TATATGATCAACTTCATCCACAAGCTCAAACACCTACCAGAGAAATATATGATGAACAGTGTTTTGGAAAACTT  1172

Query  948  CACAATTTTATTGGTGGTAACAAACAGGGATACACAAGAAACTCTACTCTGCATGGCCTGTGTGTTTGAAGTTT  1021
            |||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 1173  CACCATATTATTGGTGGTAACAAACAGGGATACACAAGAAACTCTGCTCTGCATGGCCTGTGTATTTGAAGTCT  1246

Query 1022  CAAATAGTGAACACGGAGCACAACATCATATTTACAGGCTTGTAAAGGAC  1071
            |.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1247  CGAATAGCGAACACGGAGCACAGCACCATATCTACAGGCTTGTGAAGGAC  1296