Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11185
• Subject: XM_006507562.2
• Aligned Length: 1251
• Identities: 966
• Gaps: 186

Alignment

Query    1  ATGGAAAGGATGAGTGACTCTGCAGATAAGCCAATTGACAATGATGCAGAAGGGGTCTGGAGCCCCGACATCGA  74
            ||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.||.||.||.||||||||.||.||.||.||
Sbjct    1  ATGGAAAGGATGAGCGACTCGGCAGATAAGCCGATTGACAACGACGCGGAGGGCGTCTGGAGTCCTGATATTGA  74

Query   75  GCAAAGCTTTCAGGAGGCCCTGGCTATCTATCCACCATGTGGGAGGAGGAAAATCATCTTATCAGACGAAGGCA  148
            |||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCAGAGTTTCCAGGAGGCCCTGGCTATCTATCCGCCGTGTGGGAGGAGAAAAATCATCTTATCAGACGAAGGCA  148

Query  149  AAATGTATGGTAGGAATGAATTGATAGCCAGATACATCAAACTCAGGACAGGCAAGACGAGGACCAGAAAACAG  222
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||
Sbjct  149  AAATGTATGGTAGAAATGAATTGATAGCCAGATACATCAAACTCAGGACGGGAAAGACAAGGACCAGGAAGCAG  222

Query  223  GTGTCTAGTCACATTCAGGTTCTT-GCCAGAAGGAAATCTCGTGATTTTCATTCCAAGC-----TAAAGGTAAC  290
            |||||||||||.||.|||| |||| ||.||||.||||..|||.||     |.|.|||||     |.||||||||
Sbjct  223  GTGTCTAGTCATATACAGG-TCTTAGCAAGAAAGAAAGTTCGAGA-----AATTCAAGCCGCCATTAAGGTAAC  290

Query  291  AAGCATGGATCAGACTGCAAAGGATAAGGCCCTGCAGCACATGGCGGCCATGTCCTCAGCCCAGATCGTCTCGG  364
            ||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  291  AAGCATGGATCAGACTGCCAAGGACAAGGCCCTGCAGCACATGGCTGCCATGTCATCAGCCCAGATCGTCTCGG  364

Query  365  CCACTGCCATTCATAACAAGCTGGGGCTGCCTGGGATTCCACGCCCGACCTTCCCAGGGGCGCCGGGGTTCTGG  438
            |.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||..||||||||||||
Sbjct  365  CTACTGCCATCCACAACAAGCTGGGGCTGCCTGGGATTCCACGCCCCACCTTCCCGGGGGGTCCGGGGTTCTGG  438

Query  439  CCGGGAATGATTCAAACAGGGCAGCCAGGATCCTCACAAGACGTCAAGCCTTTTGTGCAGCAGGCCTACCCCAT  512
            ||.||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  439  CCTGGGATGATACAGACAGGACAGCCAGGATCCTCACAAGACGTCAAGCCCTTTGTGCAGCAGGCCTACCCCAT  512

Query  513  CCAGCCAGCGGTCACAGCCCCCATTCCAGGGTTTGAGCCTGCATCGGCCCCAGCTCCCTCAGTCCCTGCCTGGC  586
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct  513  CCAGCCAGCAGTCACAGCCCCCATTCCAGGGTTTGAGCCTACGTCAGCCCCAGCCCCCTCAGTTCCTGCCTGGC  586

Query  587  AAGGTCGCTCCATTGGCACAACCAAGCTTCGCCTGGTGGAATTTTCAGCTTTTCTCGAGCAGCAGCGAGACCCA  660
            |.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||||||.||||||||
Sbjct  587  AGGGCCGATCCATTGGCACAACCAAGCTTCGCCTGGTGGAATTCTCCGCTTTCCTTGAACAGCAGAGAGACCCA  660

Query  661  GACTC---------------------------------------------------------------------  665
            |||||                                                                     
Sbjct  661  GACTCGTACAACAAACACCTCTTCGTGCACATCGGGCATGCCAACCATTCTTACAGTGACCCGTTGCTCGAATC  734

Query  666  --------------------------------------------------------------------------  665
                                                                                      
Sbjct  735  TGTGGACATTCGTCAGATATATGACAAATTTCCTGAAAAGAAAGGTGGCTTGAAGGAGCTGTTTGGAAAGGGCC  808

Query  666  -------------------------------GGCTGATTTAAACTGCAATATTCAAGATGATGCTGGGGCTTTT  708
                                           |||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.|||
Sbjct  809  CTCAAAACGCCTTCTTCCTCGTCAAATTCTGGGCGGACTTAAACTGCAATATCCAAGACGACGCCGGGGCCTTT  882

Query  709  TATGGTGTAACCAGTCAGTACGAGAGTTCTGAAAATATGACAGTCACCTGTTCCACCAAAGTTTGCTCCTTTGG  782
            ||||||||.|.|||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  883  TATGGTGTGAGCAGTCAGTATGAGAGTTCTGAGAACATGACAGTTACCTGTTCCACCAAAGTGTGCTCCTTTGG  956

Query  783  GAAGCAAGTAGTAGAAAAAGTAGAGACGGAGTATGCAAGGTTTGAGAATGGCCGATTTGTATACCGAATAAACC  856
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||
Sbjct  957  GAAACAAGTAGTAGAAAAAGTAGAGACGGAGTATGCGAGGTTCGAGAATGGTCGATTCGTGTACCGAATAAACC  1030

Query  857  GCTCCCCAATGTGTGAATATATGATCAACTTCATCCACAAGCTCAAACACTTACCAGAGAAATATATGATGAAC  930
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1031  GCTCGCCAATGTGTGAATATATGATCAACTTCATCCACAAGCTCAAACACCTACCAGAGAAATATATGATGAAC  1104

Query  931  AGTGTTTTGGAAAACTTCACAATTTTATTGGTGGTAACAAACAGGGATACACAAGAAACTCTACTCTGCATGGC  1004
            ||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1105  AGTGTTTTGGAAAACTTCACCATATTATTGGTGGTAACAAACAGGGATACACAAGAAACTCTGCTCTGCATGGC  1178

Query 1005  CTGTGTGTTTGAAGTTTCAAATAGTGAACACGGAGCACAACATCATATTTACAGGCTTGTAAAGGAC  1071
            ||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1179  CTGTGTATTTGAAGTCTCGAATAGCGAACACGGAGCACAGCACCATATCTACAGGCTTGTGAAGGAC  1245