Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11185
• Subject: XM_006507564.2
• Aligned Length: 1245
• Identities: 919
• Gaps: 237

Alignment

Query    1  ATGGAAAGGATGAGTGACTCTGCAGATAAGCCAATTGACAATGATGCAGAAGGGGTCTGGAGCCCCGACATCGA  74
            ||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.||.||.||.||||||||.||.||.||.||
Sbjct    1  ATGGAAAGGATGAGCGACTCGGCAGATAAGCCGATTGACAACGACGCGGAGGGCGTCTGGAGTCCTGATATTGA  74

Query   75  GCAAAGCTTTCAGGAGGCCCTGGCTATCTATCCACCATGTGGGAGGAGGAAAATCATCTTATCAGACGAAGGCA  148
            |||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCAGAGTTTCCAGGAGGCCCTGGCTATCTATCCGCCGTGTGGGAGGAGAAAAATCATCTTATCAGACGAAGGCA  148

Query  149  AAATGTATGGTAGGAATGAATTGATAGCCAGATACATCAAACTCAGGACAGGCAAGACGAGGACCAGAAAACAG  222
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.|  
Sbjct  149  AAATGTATGGTAGAAATGAATTGATAGCCAGATACATCAAACTCAGGACGGGAAAGACAAGGACCAGGAAGC--  220

Query  223  GTGTCTAGTCACATTCAGGTTCTTGCCAGAAGGAAATCTCGTGATTTTCATTCCAAGCTAAAGGTAACAAGCAT  296
                                                                         |||||||||||||
Sbjct  221  -------------------------------------------------------------AGGTAACAAGCAT  233

Query  297  GGATCAGACTGCAAAGGATAAGGCCCTGCAGCACATGGCGGCCATGTCCTCAGCCCAGATCGTCTCGGCCACTG  370
            ||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  234  GGATCAGACTGCCAAGGACAAGGCCCTGCAGCACATGGCTGCCATGTCATCAGCCCAGATCGTCTCGGCTACTG  307

Query  371  CCATTCATAACAAGCTGGGGCTGCCTGGGATTCCACGCCCGACCTTCCCAGGGGCGCCGGGGTTCTGGCCGGGA  444
            ||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||..||||||||||||||.||.
Sbjct  308  CCATCCACAACAAGCTGGGGCTGCCTGGGATTCCACGCCCCACCTTCCCGGGGGGTCCGGGGTTCTGGCCTGGG  381

Query  445  ATGATTCAAACAGGGCAGCCAGGATCCTCACAAGACGTCAAGCCTTTTGTGCAGCAGGCCTACCCCATCCAGCC  518
            |||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  382  ATGATACAGACAGGACAGCCAGGATCCTCACAAGACGTCAAGCCCTTTGTGCAGCAGGCCTACCCCATCCAGCC  455

Query  519  AGCGGTCACAGCCCCCATTCCAGGGTTTGAGCCTGCATCGGCCCCAGCTCCCTCAGTCCCTGCCTGGCAAGGTC  592
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|
Sbjct  456  AGCAGTCACAGCCCCCATTCCAGGGTTTGAGCCTACGTCAGCCCCAGCCCCCTCAGTTCCTGCCTGGCAGGGCC  529

Query  593  GCTCCATTGGCACAACCAAGCTTCGCCTGGTGGAATTTTCAGCTTTTCTCGAGCAGCAGCGAGACCCAGACTC-  665
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||||||.||||||||||||| 
Sbjct  530  GATCCATTGGCACAACCAAGCTTCGCCTGGTGGAATTCTCCGCTTTCCTTGAACAGCAGAGAGACCCAGACTCG  603

Query  666  --------------------------------------------------------------------------  665
                                                                                      
Sbjct  604  TACAACAAACACCTCTTCGTGCACATCGGGCATGCCAACCATTCTTACAGTGACCCGTTGCTCGAATCTGTGGA  677

Query  666  --------------------------------------------------------------------------  665
                                                                                      
Sbjct  678  CATTCGTCAGATATATGACAAATTTCCTGAAAAGAAAGGTGGCTTGAAGGAGCTGTTTGGAAAGGGCCCTCAAA  751

Query  666  -------------------------GGCTGATTTAAACTGCAATATTCAAGATGATGCTGGGGCTTTTTATGGT  714
                                     |||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.|||||||||
Sbjct  752  ACGCCTTCTTCCTCGTCAAATTCTGGGCGGACTTAAACTGCAATATCCAAGACGACGCCGGGGCCTTTTATGGT  825

Query  715  GTAACCAGTCAGTACGAGAGTTCTGAAAATATGACAGTCACCTGTTCCACCAAAGTTTGCTCCTTTGGGAAGCA  788
            ||.|.|||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct  826  GTGAGCAGTCAGTATGAGAGTTCTGAGAACATGACAGTTACCTGTTCCACCAAAGTGTGCTCCTTTGGGAAACA  899

Query  789  AGTAGTAGAAAAAGTAGAGACGGAGTATGCAAGGTTTGAGAATGGCCGATTTGTATACCGAATAAACCGCTCCC  862
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  900  AGTAGTAGAAAAAGTAGAGACGGAGTATGCGAGGTTCGAGAATGGTCGATTCGTGTACCGAATAAACCGCTCGC  973

Query  863  CAATGTGTGAATATATGATCAACTTCATCCACAAGCTCAAACACTTACCAGAGAAATATATGATGAACAGTGTT  936
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  974  CAATGTGTGAATATATGATCAACTTCATCCACAAGCTCAAACACCTACCAGAGAAATATATGATGAACAGTGTT  1047

Query  937  TTGGAAAACTTCACAATTTTATTGGTGGTAACAAACAGGGATACACAAGAAACTCTACTCTGCATGGCCTGTGT  1010
            ||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1048  TTGGAAAACTTCACCATATTATTGGTGGTAACAAACAGGGATACACAAGAAACTCTGCTCTGCATGGCCTGTGT  1121

Query 1011  GTTTGAAGTTTCAAATAGTGAACACGGAGCACAACATCATATTTACAGGCTTGTAAAGGAC  1071
            .||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1122  ATTTGAAGTCTCGAATAGCGAACACGGAGCACAGCACCATATCTACAGGCTTGTGAAGGAC  1182