Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11185
• Subject: XM_006507565.2
• Aligned Length: 1245
• Identities: 907
• Gaps: 249

Alignment

Query    1  ATGGAAAGGATGAGTGACTCTGCAGATAAGCCAATTGACAATGATGCAGAAGGGGTCTGGAGCCCCGACATCGA  74
            ||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.||.||.||.||||||||.||.||.||.||
Sbjct    1  ATGGAAAGGATGAGCGACTCGGCAGATAAGCCGATTGACAACGACGCGGAGGGCGTCTGGAGTCCTGATATTGA  74

Query   75  GCAAAGCTTTCAGGAGGCCCTGGCTATCTATCCACCATGTGGGAGGAGGAAAATCATCTTATCAGACGAAGGCA  148
            |||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCAGAGTTTCCAGGAGGCCCTGGCTATCTATCCGCCGTGTGGGAGGAGAAAAATCATCTTATCAGACGAAGGCA  148

Query  149  AAATGTATGGTAGGAATGAATTGATAGCCAGATACATCAAACTCAGGACAGGCAAGACGAGGACCAGAAAACAG  222
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.|| 
Sbjct  149  AAATGTATGGTAGAAATGAATTGATAGCCAGATACATCAAACTCAGGACGGGAAAGACAAGGACCAGGAAGCA-  221

Query  223  GTGTCTAGTCACATTCAGGTTCTTGCCAGAAGGAAATCTCGTGATTTTCATTCCAAGCTAAAGGTAACAAGCAT  296
                                                                                      
Sbjct  222  --------------------------------------------------------------------------  221

Query  297  GGATCAGACTGCAAAGGATAAGGCCCTGCAGCACATGGCGGCCATGTCCTCAGCCCAGATCGTCTCGGCCACTG  370
            ||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  222  GGATCAGACTGCCAAGGACAAGGCCCTGCAGCACATGGCTGCCATGTCATCAGCCCAGATCGTCTCGGCTACTG  295

Query  371  CCATTCATAACAAGCTGGGGCTGCCTGGGATTCCACGCCCGACCTTCCCAGGGGCGCCGGGGTTCTGGCCGGGA  444
            ||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||..||||||||||||||.||.
Sbjct  296  CCATCCACAACAAGCTGGGGCTGCCTGGGATTCCACGCCCCACCTTCCCGGGGGGTCCGGGGTTCTGGCCTGGG  369

Query  445  ATGATTCAAACAGGGCAGCCAGGATCCTCACAAGACGTCAAGCCTTTTGTGCAGCAGGCCTACCCCATCCAGCC  518
            |||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  370  ATGATACAGACAGGACAGCCAGGATCCTCACAAGACGTCAAGCCCTTTGTGCAGCAGGCCTACCCCATCCAGCC  443

Query  519  AGCGGTCACAGCCCCCATTCCAGGGTTTGAGCCTGCATCGGCCCCAGCTCCCTCAGTCCCTGCCTGGCAAGGTC  592
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|
Sbjct  444  AGCAGTCACAGCCCCCATTCCAGGGTTTGAGCCTACGTCAGCCCCAGCCCCCTCAGTTCCTGCCTGGCAGGGCC  517

Query  593  GCTCCATTGGCACAACCAAGCTTCGCCTGGTGGAATTTTCAGCTTTTCTCGAGCAGCAGCGAGACCCAGACTC-  665
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||||||.||||||||||||| 
Sbjct  518  GATCCATTGGCACAACCAAGCTTCGCCTGGTGGAATTCTCCGCTTTCCTTGAACAGCAGAGAGACCCAGACTCG  591

Query  666  --------------------------------------------------------------------------  665
                                                                                      
Sbjct  592  TACAACAAACACCTCTTCGTGCACATCGGGCATGCCAACCATTCTTACAGTGACCCGTTGCTCGAATCTGTGGA  665

Query  666  --------------------------------------------------------------------------  665
                                                                                      
Sbjct  666  CATTCGTCAGATATATGACAAATTTCCTGAAAAGAAAGGTGGCTTGAAGGAGCTGTTTGGAAAGGGCCCTCAAA  739

Query  666  -------------------------GGCTGATTTAAACTGCAATATTCAAGATGATGCTGGGGCTTTTTATGGT  714
                                     |||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.|||||||||
Sbjct  740  ACGCCTTCTTCCTCGTCAAATTCTGGGCGGACTTAAACTGCAATATCCAAGACGACGCCGGGGCCTTTTATGGT  813

Query  715  GTAACCAGTCAGTACGAGAGTTCTGAAAATATGACAGTCACCTGTTCCACCAAAGTTTGCTCCTTTGGGAAGCA  788
            ||.|.|||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct  814  GTGAGCAGTCAGTATGAGAGTTCTGAGAACATGACAGTTACCTGTTCCACCAAAGTGTGCTCCTTTGGGAAACA  887

Query  789  AGTAGTAGAAAAAGTAGAGACGGAGTATGCAAGGTTTGAGAATGGCCGATTTGTATACCGAATAAACCGCTCCC  862
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  888  AGTAGTAGAAAAAGTAGAGACGGAGTATGCGAGGTTCGAGAATGGTCGATTCGTGTACCGAATAAACCGCTCGC  961

Query  863  CAATGTGTGAATATATGATCAACTTCATCCACAAGCTCAAACACTTACCAGAGAAATATATGATGAACAGTGTT  936
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  CAATGTGTGAATATATGATCAACTTCATCCACAAGCTCAAACACCTACCAGAGAAATATATGATGAACAGTGTT  1035

Query  937  TTGGAAAACTTCACAATTTTATTGGTGGTAACAAACAGGGATACACAAGAAACTCTACTCTGCATGGCCTGTGT  1010
            ||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1036  TTGGAAAACTTCACCATATTATTGGTGGTAACAAACAGGGATACACAAGAAACTCTGCTCTGCATGGCCTGTGT  1109

Query 1011  GTTTGAAGTTTCAAATAGTGAACACGGAGCACAACATCATATTTACAGGCTTGTAAAGGAC  1071
            .||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1110  ATTTGAAGTCTCGAATAGCGAACACGGAGCACAGCACCATATCTACAGGCTTGTGAAGGAC  1170