Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11185
• Subject: XM_011241723.1
• Aligned Length: 1249
• Identities: 955
• Gaps: 194

Alignment

Query    1  ATGGAAAGGATGAGTGACTCTGCAGATAAGCCAATTGACAATGATGCAGAAGGGGTCTGGAGCCCCGACATCGA  74
            ||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.||.||.||.||||||||.||.||.||.||
Sbjct    1  ATGGAAAGGATGAGCGACTCGGCAGATAAGCCGATTGACAACGACGCGGAGGGCGTCTGGAGTCCTGATATTGA  74

Query   75  GCAAAGCTTTCAGGAGGCCCTGGCTATCTATCCACCATGTGGGAGGAGGAAAATCATCTTATCAGACGAAGGCA  148
            |||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCAGAGTTTCCAGGAGGCCCTGGCTATCTATCCGCCGTGTGGGAGGAGAAAAATCATCTTATCAGACGAAGGCA  148

Query  149  AAATGTATGGTAGGAATGAATTGATAGCCAGATACATCAAACTCAGGACAGGCAAGACGAGGACCAGAAAACAG  222
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||
Sbjct  149  AAATGTATGGTAGAAATGAATTGATAGCCAGATACATCAAACTCAGGACGGGAAAGACAAGGACCAGGAAGCAG  222

Query  223  GTGTCTAGTCACATTCAGGTTCTT-GCCAGAAGGAAATCTCGTGATTTTCATTCCAAGCTAAAGGTAACAAGCA  295
            |||||||||||.||.|||| |||| ||.||||.||||..|||.||..||||..||  ||             ||
Sbjct  223  GTGTCTAGTCATATACAGG-TCTTAGCAAGAAAGAAAGTTCGAGAAATTCAAGCC--GC-------------CA  280

Query  296  T---GGATCAGACTGCAAAGGATAAGGCCCTGCAGCACATGGCGGCCATGTCCTCAGCCCAGATCGTCTCGGCC  366
            |   ||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  281  TTAAGGATCAGACTGCCAAGGACAAGGCCCTGCAGCACATGGCTGCCATGTCATCAGCCCAGATCGTCTCGGCT  354

Query  367  ACTGCCATTCATAACAAGCTGGGGCTGCCTGGGATTCCACGCCCGACCTTCCCAGGGGCGCCGGGGTTCTGGCC  440
            ||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||..||||||||||||||
Sbjct  355  ACTGCCATCCACAACAAGCTGGGGCTGCCTGGGATTCCACGCCCCACCTTCCCGGGGGGTCCGGGGTTCTGGCC  428

Query  441  GGGAATGATTCAAACAGGGCAGCCAGGATCCTCACAAGACGTCAAGCCTTTTGTGCAGCAGGCCTACCCCATCC  514
            .||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  429  TGGGATGATACAGACAGGACAGCCAGGATCCTCACAAGACGTCAAGCCCTTTGTGCAGCAGGCCTACCCCATCC  502

Query  515  AGCCAGCGGTCACAGCCCCCATTCCAGGGTTTGAGCCTGCATCGGCCCCAGCTCCCTCAGTCCCTGCCTGGCAA  588
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct  503  AGCCAGCAGTCACAGCCCCCATTCCAGGGTTTGAGCCTACGTCAGCCCCAGCCCCCTCAGTTCCTGCCTGGCAG  576

Query  589  GGTCGCTCCATTGGCACAACCAAGCTTCGCCTGGTGGAATTTTCAGCTTTTCTCGAGCAGCAGCGAGACCCAGA  662
            ||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||||||.||||||||||
Sbjct  577  GGCCGATCCATTGGCACAACCAAGCTTCGCCTGGTGGAATTCTCCGCTTTCCTTGAACAGCAGAGAGACCCAGA  650

Query  663  CTC-----------------------------------------------------------------------  665
            |||                                                                       
Sbjct  651  CTCGTACAACAAACACCTCTTCGTGCACATCGGGCATGCCAACCATTCTTACAGTGACCCGTTGCTCGAATCTG  724

Query  666  --------------------------------------------------------------------------  665
                                                                                      
Sbjct  725  TGGACATTCGTCAGATATATGACAAATTTCCTGAAAAGAAAGGTGGCTTGAAGGAGCTGTTTGGAAAGGGCCCT  798

Query  666  -----------------------------GGCTGATTTAAACTGCAATATTCAAGATGATGCTGGGGCTTTTTA  710
                                         |||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.|||||
Sbjct  799  CAAAACGCCTTCTTCCTCGTCAAATTCTGGGCGGACTTAAACTGCAATATCCAAGACGACGCCGGGGCCTTTTA  872

Query  711  TGGTGTAACCAGTCAGTACGAGAGTTCTGAAAATATGACAGTCACCTGTTCCACCAAAGTTTGCTCCTTTGGGA  784
            ||||||.|.|||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  873  TGGTGTGAGCAGTCAGTATGAGAGTTCTGAGAACATGACAGTTACCTGTTCCACCAAAGTGTGCTCCTTTGGGA  946

Query  785  AGCAAGTAGTAGAAAAAGTAGAGACGGAGTATGCAAGGTTTGAGAATGGCCGATTTGTATACCGAATAAACCGC  858
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||
Sbjct  947  AACAAGTAGTAGAAAAAGTAGAGACGGAGTATGCGAGGTTCGAGAATGGTCGATTCGTGTACCGAATAAACCGC  1020

Query  859  TCCCCAATGTGTGAATATATGATCAACTTCATCCACAAGCTCAAACACTTACCAGAGAAATATATGATGAACAG  932
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021  TCGCCAATGTGTGAATATATGATCAACTTCATCCACAAGCTCAAACACCTACCAGAGAAATATATGATGAACAG  1094

Query  933  TGTTTTGGAAAACTTCACAATTTTATTGGTGGTAACAAACAGGGATACACAAGAAACTCTACTCTGCATGGCCT  1006
            ||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1095  TGTTTTGGAAAACTTCACCATATTATTGGTGGTAACAAACAGGGATACACAAGAAACTCTGCTCTGCATGGCCT  1168

Query 1007  GTGTGTTTGAAGTTTCAAATAGTGAACACGGAGCACAACATCATATTTACAGGCTTGTAAAGGAC  1071
            ||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1169  GTGTATTTGAAGTCTCGAATAGCGAACACGGAGCACAGCACCATATCTACAGGCTTGTGAAGGAC  1233