Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11249
• Subject: NM_001289626.1
• Aligned Length: 1662
• Identities: 1506
• Gaps: 21

Alignment

Query    1  ATGGCTGAAGCGGCCACGGGCTTTCTGGAGCAGCTCAAGTCCTGCATAGTTTGGTCTTGGACGTATCTGTGGAC  74
            |||||.||.||||.|.|||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCGAGGCGGGCGCGGGCTTCCTGGAGCAGCTCAAGTCCTGCATCGTGTGGTCGTGGACCTATCTGTGGAC  74

Query   75  CGTGTGGTTCTTCATCGTGCTATTCCTGGTCTACATCCTGCGGGTGCCTTTGAAAATCAACGACAACTTGAGCA  148
            |||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||.|||||||..|||..||||||||||||.||||||
Sbjct   75  CGTGTGGTTCTTCCTCGTGCTCTTCCTGGTCTACATCCTGAGGGTGCCCCTGAGGATCAACGACAACCTGAGCA  148

Query  149  CAGTGAGCATGTTTTTGAACACATTAACACCGAAGTTCTACGTGGCCCTAACAGGCACTTCCTCACTAATATCA  222
            ||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.
Sbjct  149  CAGTGAGCATGTTTTTGAACACGTTAACCCCAAAGTTCTACGTGGCCCTGACAGGCACTTCCTCGCTAATATCG  222

Query  223  GGGCTTATTTTGATATTTGAATGGTGGTATTTTCGCAAATACGGAACTTCATTCATTGAACAAGTCTCAGTAAG  296
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct  223  GGACTTATTTTGATATTTGAATGGTGGTATTTTCGCAAGTATGGAACATCTTTCATTGAACAAGTCTCCGTAAG  296

Query  297  CCACTTGCGCCCCCTTCTGGGAGGGGTTGACAACAACTCTTCCAACA---------------------ACTCAG  349
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|                     ||||||
Sbjct  297  CCACTTGCGCCCCCTTCTGGGAGGGGTTGACAACAACTCTTCCAATAATTCTAATTCCAGTAATGGAGACTCAG  370

Query  350  ATTCCAATAGGCAAAGTGTCTCAGAATGCAAAGTATGGCGAAATCCACTAAATTTATTTAGGGGTGCTGAATAC  423
            |||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|.|||||||||||.|||||.
Sbjct  371  ATTCCAACAGACAAAGTGTCTCAGAATGCAAAGTATGGCGAAATCCACTGAATCTGTTTAGGGGTGCGGAATAT  444

Query  424  AATCGGTATACTTGGGTGACAGGACGAGAGCCTCTTACTTACTATGACATGAATCTCTCTGCCCAAGACCACCA  497
            ||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct  445  AATCGGTACACTTGGGTCACAGGACGAGAGCCTCTGACCTACTATGACATGAACCTCTCTGCCCAGGACCACCA  518

Query  498  GACATTCTTTACTTGTGACTCGGACCATCTGCGTCCCGCAGATGCAATAATGCAGAAAGCCTGGAGAGAGAGAA  571
            ||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|
Sbjct  519  GACATTCTTTACTTGTGATTCAGATCATCTTCGCCCTGCAGATGCAATAATGCAAAAAGCTTGGAGAGAAAGGA  592

Query  572  ACCCCCAAGCTAGGATTTCTGCAGCTCATGAAGCCTTGGAGATAAATGAGTGTGCAACTGCTTATATTCTCTTG  645
            ||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct  593  ACCCTCAAGCCAGGATTTCTGCAGCTCATGAAGCCTTGGAGATAAACGAGTGTGCAACTGCGTACATTCTCTTG  666

Query  646  GCTGAAGAGGAAGCAACAACCATTGCTGAAGCAGAAAAATTATTTAAGCAGGCCCTGAAGGCTGGAGATGGCTG  719
            ||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  667  GCGGAAGAAGAAGCGACAACTATTGCTGAAGCAGAAAAACTCTTTAAGCAGGCCCTGAAGGCTGGAGATGGTTG  740

Query  720  TTACCGACGCTCTCAGCAGCTACAACATCATGGATCCCAGTATGAAGCCCAACATAGACGAGACACCAATGTCT  793
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  741  TTACCGGCGCTCTCAGCAGCTACAACATCATGGGTCCCAGTATGAAGCTCAACACAGACGAGACACCAATGTCT  814

Query  794  TGGTGTACATCAAAAGAAGGCTAGCAATGTGTGCCAGAAGACTCGGGAGGACCAGGGAAGCAGTGAAAATGATG  867
            |.||.||.||||||||||||||.||.|||||||||.|.|||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct  815  TAGTCTATATCAAAAGAAGGCTGGCGATGTGTGCCCGGAGACTTGGAAGGACCAGAGAAGCAGTGAAGATGATG  888

Query  868  AGAGATTTAATGAAGGAGTTCCCCCTTCTGAGTATGTTCAATATCCATGAAAACCTTTTAGAAGCCCTTCTGGA  941
            ||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||.|||||||.||||||||
Sbjct  889  AGAGATTTAATGAAGGAGTTTCCCCTCCTAAGCATGTTCAATATCCATGAGAACCTTCTAGAAGCTCTTCTGGA  962

Query  942  ACTACAAGCATATGCTGATGTTCAGGCAGTCTTAGCAAAGTATGATGATATAAGCTTACCAAAGTCAGCAACAA  1015
            |||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct  963  ACTCCAAGCTTATGCTGATGTTCAGGCAGTCTTAGCAAAGTATGATGATATAAGCTTACCAAAGTCGGCGACAA  1036

Query 1016  TATGCTACACAGCTGCTTTGCTCAAAGCAAGAGCTGTCTCTGACAAATTCTCTCCTGAGGCTGCATCTCGGCGG  1089
            |||||||||||||.||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||.||
Sbjct 1037  TATGCTACACAGCCGCCCTGCTCAAAGCAAGAGCTGTCTCTGACAAATTCTCTCCAGAGGCTGCGTCTCGGAGG  1110

Query 1090  GGGCTGAGCACAGCAGAGATGAATGCAGTAGAGGCCATTCATAGAGCTGTGGAATTCAATCCTCATGTGCCAAA  1163
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||
Sbjct 1111  GGGCTGAGCACAGCAGAGATGAATGCAGTAGAAGCCATCCACAGAGCTGTGGAATTTAATCCACACGTGCCAAA  1184

Query 1164  ATACCTACTAGAAATGAAAAGCTTAATCCTACCCCCAGAACATATCCTGAAGAGAGGAGACAGTGAAGCAATAG  1237
            |||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1185  ATATCTACTAGAAATGAAAAGCTTAATCCTCCCACCAGAACACATCCTGAAGAGAGGAGACAGTGAAGCGATAG  1258

Query 1238  CATATGCATTCTTTCATCTTGCACACTGGAAGAGAGTGGAAGGGGCTTTGAATCTTTTGCATTGTACGTGGGAA  1311
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CATATGCATTCTTTCATCTTGCACACTGGAAGAGGGTGGAAGGGGCTTTGAATCTCTTGCATTGTACGTGGGAA  1332

Query 1312  GGCACTTTTCGGATGATCCCTTATCCCTTGGAAAAGGGGCACCTATTTTATCCTTACCCAATCTGTACAGAAAC  1385
            ||||||||.|||||||||||.||||||.||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GGCACTTTCCGGATGATCCCGTATCCCCTGGAGAAGGGACACCTATTTTATCCATACCCAATCTGTACAGAAAC  1406

Query 1386  AGCAGACCGAGAGCTGCTTCCATCTTTCCATGAAGTCTCAGTTTACCCAAAGAAGGAGCTTCCCTTCTTTATTC  1459
            |||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|
Sbjct 1407  AGCTGACCGGGAGCTGCTTCCCTCTTTCCATGAAGTCTCAGTTTACCCAAAGAAGGAACTTCCCTTCTTCATCC  1480

Query 1460  TCTTTACTGCTGGATTATGTTCCTTCACAGCCATGCTGGCCCTCCTGACACATCAGTTCCCGGAACTTATGGGG  1533
            ||||.|||||||||.|.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 1481  TCTTCACTGCTGGACTGTGCTCCTTCACAGCCATGCTGGCCCTCCTGACACATCAGTTTCCGGAACTTATGGGA  1554

Query 1534  GTCTTCGCAAAAGCTTTCCTCAGCACTTTGTTTGCCCCCTTAAACTTTGTCATGGAGAAAGTGGAGAGCATCCT  1607
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1555  GTCTTCGCAAAAGCTTTCCTCAGCACTTTGTTTGCCCCCTTGAACTTTGTTATGGAGAAAGTGGAAAGCATCCT  1628

Query 1608  CCCATCCAGTCTGTGGCACCAGCTAACACGGATC  1641
            |||.||||||.|||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 1629  CCCCTCCAGTTTGTGGCATCAGCTGACACGGATC  1662