Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_11249
- Subject:
- NR_161420.1
- Aligned Length:
- 2229
- Identities:
- 1641
- Gaps:
- 588
Alignment
Query 1 ----------------------------------------ATGGCTGAAGCGGCCACGGGCTTTCTGGAGCAGC 34
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 AGACACCAAGAGCCGCGGCAGCAGAGAGGAGCGCTGAAACATGGCTGAAGCGGCCACGGGCTTTCTGGAGCAGC 74
Query 35 TCAAGTCCTGCATAGTTTGGTCTTGGACGTATCTGTGGACCGTGTGGTTCTTCATCGTGCTATTCCTGGTCTAC 108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TCAAGTCCTGCATAGTTTGGTCTTGGACGTATCTGTGGACCGTGTGGTTCTTCATCGTGCTATTCCTGGTCTAC 148
Query 109 ATCCTGCGGGTGCCTTTGAAAATCAACGACAACTTGAGCACAGTGAGCATGTTTTTGAACACATTAACACCGAA 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ATCCTGCGGGTGCCTTTGAAAATCAACGACAACTTGAGCACAGTGAGCATGTTTTTGAACACATTAACACCGAA 222
Query 183 GTTCTACGTGGCCCTAACAGGCACTTCCTCACTAATATCAGGGCTTATTTTGATATTTGAATGGTGGTATTTTC 256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GTTCTACGTGGCCCTAACAGGCACTTCCTCACTAATATCAGGGCTTATTTTGATATTTGAATGGTGGTATTTTC 296
Query 257 GCAAATACGGAACTTCATTCATTGAACAAGTCTCAGTAAGCCACTTGCGCCCCCTTCTGGGAGGGGTTGACAAC 330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GCAAATACGGAACTTCATTCATTGAACAAGTCTCAGTAAGCCACTTGCGCCCCCTTCTGGGAGGGGTTGACAAC 370
Query 331 AACTCTTCCAACA---------------------ACTCAGATTCCAATAGGCAAAGTGTCTCAGAATGCAAAGT 383
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AACTCTTCCAACAATTCTAATTCCAGTAACGGGGACTCAGATTCCAATAGGCAAAGTGTCTCAGAATGCAAAGT 444
Query 384 ATGGCGAAATCCACTAAATTTATTTAGGGGTGCTGAATACAATCGGTATACTTGGGTGACAGGACGAGAGCCTC 457
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ATGGCGAAATCCACTAAATTTATTTAGGGGTGCTGAATACAATCGGTATACTTGGGTGACAGGACGAGAGCCTC 518
Query 458 TTACTTACTATGACATGAATCTCTCTGCCCAAGACCACCAGACATTCTTTACTTGTGACTCGGACCATCTGCGT 531
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TTACTTACTATGACATGAATCTCTCTGCCCAAGACCACCAGACATTCTTTACTTGTGACTCGGACCATCTGCGT 592
Query 532 CCCGCAGATGCAATAATGCAGAAAGCCTGGAGAGAGAGAAACCCCCAAGCTAGGATTTCTGCAGCTCATGAAGC 605
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCCGCAGATGCAATAATGCAGAAAGCCTGGAGAGAGAGAAACCCCCAAGCTAGGATTTCTGCAGCTCATGAAGC 666
Query 606 CTTGGAGATAAATG------------------------------------------------------------ 619
||||||||||||||
Sbjct 667 CTTGGAGATAAATGAAATTAGGTCCAGAGTTGAAGTTCCCCTAATTGCTTCCTCTACCATCTGGGAGATAAAAT 740
Query 620 ---------AGTGTGCAACTGCTTATATTCTCTTGGCTGAAGAGGAAGCAACAACCATTGCTGAAGCAGAAAAA 684
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGTTACCAAAGTGTGCAACTGCTTATATTCTCTTGGCTGAAGAGGAAGCAACAACCATTGCTGAAGCAGAAAAA 814
Query 685 TTATTTAAGCAGGCCCTGAAGGCTGGAGATGGCTGTTACCGACGCTCTCAGCAGCTACAACATCATGGATCCCA 758
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TTATTTAAGCAGGCCCTGAAGGCTGGAGATGGCTGTTACCGACGCTCTCAGCAGCTACAACATCATGGATCCCA 888
Query 759 GTATGAAGCCCAACATAGACGAGACACCAATGTCTTGGTGTACATCAAAAGAAGGCTAGCAATGTGTGCCAGAA 832
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GTATGAAGCCCAACATAGACGAGACACCAATGTCTTGGTGTACATCAAAAGAAGGCTAGCAATGTGTGCCAGAA 962
Query 833 GACTCGGGAGGACCAGGGAAGCAGTGAAAATGATGAGAGATTTAATGAAGGAGTTCCCCCTTCTGAGTATGTTC 906
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GACTCGGGAGGACCAGGGAAGCAGTGAAAATGATGAGAGATTTAATGAAGGAGTTCCCCCTTCTGAGTATGTTC 1036
Query 907 AATATCCATGAAAACCTTTTAGAAGCCCTTCTGGAACTACAAGCATATGCTGATGTTCAGGCAGTCTTAGCAAA 980
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AATATCCATGAAAACCTTTTAGAAGCCCTTCTGGAACTACAAGCATATGCTGATGTTCAGGCAGTCTTAGCAAA 1110
Query 981 GTATGATGATATAAGCTTACCAAAGTCAGCAACAATATGCTACACAGCTGCTTTGCTCAAAGCAAGAGCTGTCT 1054
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GTATGATGATATAAGCTTACCAAAGTCAGCAACAATATGCTACACAGCTGCTTTGCTCAAAGCAAGAGCTGTCT 1184
Query 1055 CTGACAA------------------------------------------------------------------- 1061
|||||||
Sbjct 1185 CTGACAAATCGCCAGTACCTACTGCAACATCTTTTCTCCCTACACAGCGACTCCAGCTTGGGAGGGCAGGGCCA 1258
Query 1062 ---------------------------------------------------------------------ATTCT 1066
|||||
Sbjct 1259 GGGTTGTCACAGCTTCCCCTGTGGTGTCTGCCTGCCAAGCACAGCTCTGGAGTTAGCCCTGGGTGTGAGATTCT 1332
Query 1067 CTCCTGAGGCTGCATCTCGGCGGGGGCTGAGCACAGCAGAGATGAATGCAGTAGAGGCCATTCATAGAGCTGTG 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CTCCTGAGGCTGCATCTCGGCGGGGGCTGAGCACAGCAGAGATGAATGCAGTAGAGGCCATTCATAGAGCTGTG 1406
Query 1141 GAATTCAATCCTCATGTGCCAAAATACCTACTAGAAATGAAAAGCTTAATCCTACCCCCAGAACATATCCTGAA 1214
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GAATTCAATCCTCATGTGCCAAAATACCTACTAGAAATGAAAAGCTTAATCCTACCCCCAGAACATATCCTGAA 1480
Query 1215 GAGAGGAGACAGTGAAGCAATAGCATATGCATTCTTTCATCTTGCACACTGGAAGAGAGTGGAAGGGGCTTTGA 1288
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 GAGAGGAGACAGTGAAGCAATAGCATATGCATTCTTTCATCTTGCACACTGGAAGAGAGTGGAAGGGGCTTTGA 1554
Query 1289 ATCTTTTGCATTGTACGTGGGAAGGCACTTTTCGGATGATCCCTTATCCCTTGGAAAAGGGGCACCTATTTTAT 1362
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 ATCTTTTGCATTGTACGTGGGAAGGCACTTTTCGGATGATCCCTTATCCCTTGGAAAAGGGGCACCTATTTTAT 1628
Query 1363 CCTTACCCAATCTGTACAGAAACAGCAGACCGAGAGCTGCTTCCATCTTTCCATGAAGTCTCAGTTTACCCAAA 1436
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CCTTACCCAATCTGTACAGAAACAGCAGACCGAGAGCTGCTTCCATCTTTCCATGAAGTCTCAGTTTACCCAAA 1702
Query 1437 GAAGGAGCTTCCCTTCTTTATTCTCTTTACTGCTGGATTATGTTCCTTCACAGCCATGCTGGCCCTCCTGACAC 1510
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GAAGGAGCTTCCCTTCTTTATTCTCTTTACTGCTGGATTATGTTCCTTCACAGCCATGCTGGCCCTCCTGACAC 1776
Query 1511 ATCAGTTCCCGGAACTTATGGGGGTCTTCGCAAAAGCTTTCCTCAGCACTTTGTTTGCCCCCTTAAACTTTGTC 1584
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 ATCAGTTCCCGGAACTTATGGGGGTCTTCGCAAAAGCTTTCCTCAGCACTTTGTTTGCCCCCTTAAACTTTGTC 1850
Query 1585 ATGGAGAAAGTGGAGAGCATCCTCCCATCCAGTCTGTGGCACCAGCTAACACGGATC----------------- 1641
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 ATGGAGAAAGTGGAGAGCATCCTCCCATCCAGTCTGTGGCACCAGCTAACACGGATCTGAGAGAAGCCCTGTCC 1924
Query 1642 -------------------------------------------------------------------------- 1641
Sbjct 1925 TCCACTCACCTCACCCGCCGCTGCCACCATCTCCTCTGTGCCAACTCCTTGTGGACCGCAAGAAAGCATGACTT 1998
Query 1642 -------------------------------------------------------------------------- 1641
Sbjct 1999 TGAAAAAGGGAAGCCATTCCGAGATTTTAAAATGTTCATGGACTATTCCATATTAAAAGCTGTTTTTGTTGTAC 2072
Query 1642 -------------------------------------------------------------------------- 1641
Sbjct 2073 AAAATTCACTGATGTTCAGTTCTATTTTATTTTGCCTTCAGAAAAGAAGAAAGTCAAAAATAAAACTTTTGTGT 2146
Query 1642 -------------------------------------------------------------------------- 1641
Sbjct 2147 ATTACAGCAATCATTTGTATCCTCCTGTGTCTTCCAACCCTAAAATTGTTGATGTCCCAAATAAACCTTTGGAT 2220
Query 1642 --------- 1641
Sbjct 2221 TTACCTTGA 2229