Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_11249
- Subject:
- NR_161423.1
- Aligned Length:
- 2024
- Identities:
- 1558
- Gaps:
- 466
Alignment
Query 1 ----------------------------------------ATGGCTGAAGCGGCCACGGGCTTTCTGGAGCAGC 34
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 AGACACCAAGAGCCGCGGCAGCAGAGAGGAGCGCTGAAACATGGCTGAAGCGGCCACGGGCTTTCTGGAGCAGC 74
Query 35 TCAAGTCCTGCATAGTTTGGTCTTGGACGTATCTGTGGACCGTGTGGTTCTTCATCGTGCTATTCCTGGTCTAC 108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TCAAGTCCTGCATAGTTTGGTCTTGGACGTATCTGTGGACCGTGTGGTTCTTCATCGTGCTATTCCTGGTCTAC 148
Query 109 ATCCTGCGGGTGCCTTTGAAAATCAACGACAACTTGAGCACAGTGAGCATGTTTTTGAACACATTAACACCGAA 182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ATCCTGCGGGTGCCTTTGAAAATCAACGACAACTTGAGCACA-------------------------------- 190
Query 183 GTTCTACGTGGCCCTAACAGGCACTTCCTCACTAATATCAGGGCTTATTTTGATATTTGAATGGTGGTATTTTC 256
|||||||||||||||||||||||
Sbjct 191 ---------------------------------------------------GATATTTGAATGGTGGTATTTTC 213
Query 257 GCAAATACGGAACTTCATTCATTGAACAAGTCTCAGTAAGCCACTTGCGCCCCCTTCTGGGAGGGGTTGACAAC 330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 214 GCAAATACGGAACTTCATTCATTGAACAAGTCTCAGTAAGCCACTTGCGCCCCCTTCTGGGAGGGGTTGACAAC 287
Query 331 AACTCTTCCAACA---------------------ACTCAGATTCCAATAGGCAAAGTGTCTCAGAATGCAAAGT 383
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 288 AACTCTTCCAACAATTCTAATTCCAGTAACGGGGACTCAGATTCCAATAGGCAAAGTGTCTCAGAATGCAAAGT 361
Query 384 ATGGCGAAATCCACTAAATTTATTTAGGGGTGCTGAATACAATCGGTATACTTGGGTGACAGGACGAGAGCCTC 457
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 362 ATGGCGAAATCCACTAAATTTATTTAGGGGTGCTGAATACAATCGGTATACTTGGGTGACAGGACGAGAGCCTC 435
Query 458 TTACTTACTATGACATGAATCTCTCTGCCCAAGACCACCAGACATTCTTTACTTGTGACTCGGACCATCTGCGT 531
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 436 TTACTTACTATGACATGAATCTCTCTGCCCAAGACCACCAGACATTCTTTACTTGTGACTCGGACCATCTGCGT 509
Query 532 CCCGCAGATGCAATAATGCAGAAAGCCTGGAGAGAGAGAAACCCCCAAGCTAGGATTTCTGCAGCTCATGAAGC 605
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 510 CCCGCAGATGCAATAATGCAGAAAGCCTGGAGAGAGAGAAACCCCCAAGCTAGGATTTCTGCAGCTCATGAAGC 583
Query 606 CTTGGAGATAAATGAGTGTGCAACTGCTTATATTCTCTTGGCTGAAGAGGAAGCAACAACCATTGCTGAAGCAG 679
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 584 CTTGGAGATAAATGAGTGTGCAACTGCTTATATTCTCTTGGCTGAAGAGGAAGCAACAACCATTGCTGAAGCAG 657
Query 680 AAAAATTATTTAAGCAGGCCCTGAAGGCTGGAGATGGCTGTTACCGACGCTCTCAGCAGCTACAACATCATGGA 753
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 658 AAAAATTATTTAAGCAGGCCCTGAAGGCTGGAGATGGCTGTTACCGACGCTCTCAGCAGCTACAACATCATGGA 731
Query 754 TCCCAGTATGAAGCCCAACATAGACGAGACACCAATGTCTTGGTGTACATCAAAAGAAGGCTAGCAATGTGTGC 827
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 732 TCCCAGTATGAAGCCCAACATAGACGAGACACCAATGTCTTGGTGTACATCAAAAGAAGGCTAGCAATGTGTGC 805
Query 828 CAGAAGACTCGGGAGGACCAGGGAAGCAGTGAAAATGATGAGAGATTTAATGAAGGAGTTCCCCCTTCTGAGTA 901
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 806 CAGAAGACTCGGGAGGACCAGGGAAGCAGTGAAAATGATGAGAGATTTAATGAAGGAGTTCCCCCTTCTGAGTA 879
Query 902 TGTTCAATATCCATGAAAACCTTTTAGAAGCCCTTCTGGAACTACAAGCATATGCTGATGTTCAGGCAGTCTTA 975
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 880 TGTTCAATATCCATGAAAACCTTTTAGAAGCCCTTCTGGAACTACAAGCATATGCTGATGTTCAGGCAGTCTTA 953
Query 976 GCAAAGTATGATGATATAAGCTTACCAAAGTCAGCAACAATATGCTACACAGCTGCTTTGCTCAAAGCAAGAGC 1049
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 954 GCAAAGTATGATGATATAAGCTTACCAAAGTCAGCAACAATATGCTACACAGCTGCTTTGCTCAAAGCAAGAGC 1027
Query 1050 TGTCTCTGACAAATTCTCTCCTGAGGCTGCATCTCGGCGGGGGCTGAGCACAGCAGAGATGAATGCAGTAGAGG 1123
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1028 TGTCTCTGACAAATTCTCTCCTGAGGCTGCATCTCGGCGGGGGCTGAGCACAGCAGAGATGAATGCAGTAGAGG 1101
Query 1124 CCATTCATAGAGCTGTGGAATTCAATCCTCATGTGCCAAAATACCTACTAGAAATGAAAAGCTTAATCCTACCC 1197
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1102 CCATTCATAGAGCTGTGGAATTCAATCCTCATGTGCCAAAATACCTACTAGAAATGAAAAGCTTAATCCTACCC 1175
Query 1198 CCAGAACATATCCTGAAGAGAGGAGACAGTGAAGCAATAGCATATGCATTCTTTCATCTTGCACACTGGAAGAG 1271
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1176 CCAGAACATATCCTGAAGAGAGGAGACAGTGAAGCAATAGCATATGCATTCTTTCATCTTGCACACTGGAAGAG 1249
Query 1272 AGTGGAAGGGGCTTTGAATCTTTTGCATTGTACGTGGGAAGGCACTTTTCGGATGATCCCTTATCCCTTGGAAA 1345
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1250 AGTGGAAGGGGCTTTGAATCTTTTGCATTGTACGTGGGAAGGCACTTTTCGGATGATCCCTTATCCCTTGGAAA 1323
Query 1346 AGGGGCACCTATTTTATCCTTACCCAATCTGTACAGAAACAGCAGACCGAGAGCTGCTTCCATCTTTCCATGAA 1419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1324 AGGGGCACCTATTTTATCCTTACCCAATCTGTACAGAAACAGCAGACCGAGAGCTGCTTCCATCTTTCCATGAA 1397
Query 1420 GTCTCAGTTTACCCAAAGAAGGAGCTTCCCTTCTTTATTCTCTTTACTGCTGGATTATGTTCCTTCACAGCCAT 1493
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1398 GTCTCAGTTTACCCAAAGAAGGAGCTTCCCTTCTTTATTCTCTTTACTGCTGGATTATGTTCCTTCACAGCCAT 1471
Query 1494 GCTGGCCCTCCTGACACATCAGTTCCCGGAACTTATGGGGGTCTTCGCAAAAGCTTTCCTCAGCACTTTGTTTG 1567
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1472 GCTGGCCCTCCTGACACATCAGTTCCCGGAACTTATGGGGGTCTTCGCAAAAGCTTTCCTCAGCACTTTGTTTG 1545
Query 1568 CCCCCTTAAACTTTGTCATGGAGAAAGTGGAGAGCATCCTCCCATCCAGTCTGTGGCACCAGCTAACACGGATC 1641
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1546 CCCCCTTAAACTTTGTCATGGAGAAAGTGGAGAGCATCCTCCCATCCAGTCTGTGGCACCAGCTAACACGGATC 1619
Query 1642 -------------------------------------------------------------------------- 1641
Sbjct 1620 TGAGAGAAGCCCTGTCCTCCACTCACCTCACCCGCCGCTGCCACCATCTCCTCTGTGCCAACTCCTTGTGGACC 1693
Query 1642 -------------------------------------------------------------------------- 1641
Sbjct 1694 GCAAGAAAGCATGACTTTGAAAAAGGGAAGCCATTCCGAGATTTTAAAATGTTCATGGACTATTCCATATTAAA 1767
Query 1642 -------------------------------------------------------------------------- 1641
Sbjct 1768 AGCTGTTTTTGTTGTACAAAATTCACTGATGTTCAGTTCTATTTTATTTTGCCTTCAGAAAAGAAGAAAGTCAA 1841
Query 1642 -------------------------------------------------------------------------- 1641
Sbjct 1842 AAATAAAACTTTTGTGTATTACAGCAATCATTTGTATCCTCCTGTGTCTTCCAACCCTAAAATTGTTGATGTCC 1915
Query 1642 -------------------------- 1641
Sbjct 1916 CAAATAAACCTTTGGATTTACCTTGA 1941