Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11255
• Subject: NM_009672.3
• Aligned Length: 748
• Identities: 627
• Gaps: 41

Alignment

Query   1  ATGGAGATGGGCAGACGGATTCATTTAGAGCTGCGGAACAGGACGCCCTCTGATGTGAAAGAACTTGTCCTGGA  74
           ||||||||||.||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct   1  ATGGAGATGGACAAACGGATTTATTTAGAGCTGCGGAACAGGACGCCCTCTGATGTGAAAGAGCTGGTCCTGGA  74

Query  75  CAACAGTCGGTCGAATGAAGGCAAACTCGAAGGCCTCACAGATGAATTTGAAGAACTGGAATTCTTAAGTACAA  148
           .|||.||..|||.|.||||||||||.|||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  75  TAACTGTAAGTCAATTGAAGGCAAAATCGAAGGCCTCACGGATGAGTTTGAAGAACTGGAATTCCTAAGTACAA  148

Query 149  TCAACGTAGGCCTCACCTCAATCGCAAACTTACCAAAGTTAAACAAACTTAAGAAGCTTGAACTAAGCGATAAC  222
           |||||||||||||||||||.||..|.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||.|||
Sbjct 149  TCAACGTAGGCCTCACCTCCATTTCCAACTTACCAAAGTTAAACAAACTCAAGAAGCTTGAATTAAGCGAAAAC  222

Query 223  AGAGTCTCAGGGGGCCTGGAAGTATTGGCAGAAAAGTGTCCGAACCTCACGCATCTAAATTTAAGTGGCAACAA  296
           |||.|||||||||.||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  AGAATCTCAGGGGACCTGGAAGTATTGGCAGAGAAATGTCCGAACCTTAAGCATCTAAATTTAAGTGGCAACAA  296

Query 297  AATTAAAGACCTCAGCACAATAGAGCCACTGAAAAAGTTAGAAAACCTCAAGAGCTTAGACCTTTTCAATTGCG  370
           |||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||.|||||||.||.||.||.|
Sbjct 297  AATAAAAGATCTCAGCACAATAGAGCCGCTGAAGAAGTTAGAGAATCTCAAGAGCCTAGACCTGTTTAACTGTG  370

Query 371  AGGTAACCAACCTGAACGACTACCGAGAAAATGTGTTCAAGCTCCTCCCGCAACTCACATATCTCGACGGCTAT  444
           ||||.|||||||||||.|.||||||||||||.||||||||||||||.||.||..|||..||.|||||.||||||
Sbjct 371  AGGTGACCAACCTGAATGCCTACCGAGAAAACGTGTTCAAGCTCCTGCCCCAGGTCATGTACCTCGATGGCTAT  444

Query 445  GACCGGGACGACAAGGAGGCCCCTGACTCGGATGCTGAGGGCTACGTGGAGGGCCTGGATGATGAGGAGGAGGA  518
           |||.|||||.|||||||||||||.|||||.||||.|||||||||||||||      ||||||.||.|||||.||
Sbjct 445  GACAGGGACAACAAGGAGGCCCCCGACTCCGATGTTGAGGGCTACGTGGA------GGATGACGACGAGGAAGA  512

Query 519  TGAGGATGAGGAGGAGTATGATGAAGATGCTCAGGTAGTGGAAGACGAGGAGGACGAGGATGAGGAGGAGGAAG  592
           |||||||||||||||||||||||||.||||.|||.||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 513  TGAGGATGAGGAGGAGTATGATGAATATGCCCAGCTAGTGGAAGATGAAGAGGAAGAGGATGAGGAGGAAGAAG  586

Query 593  GTGAAGAGGAGGACGTGAGTGGAGAGGAGGAGGAGGATGAAGAAGGTTATAACGATGGAGAGGTAGATGACGAG  666
           |.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.||.||.|||||||||
Sbjct 587  GGGAGGAAGAGGATGTGAGTGGAGAGGAGGAGGAGGATGAGGAAGGTTACAATGACGGGGAAGTGGATGACGAG  660

Query 667  GAAGATGAAGAAG-AGCTTGGTGAAGAAGAAAGGGGTCAGAAGCGAAAA-------------------------  714
           |||||.||||||| ||| |||||||||||||.||.||||||||||||||                         
Sbjct 661  GAAGACGAAGAAGAAGC-TGGTGAAGAAGAAGGGAGTCAGAAGCGAAAACGAGAACCGGACGATGAGGGCGAAG  733

Query 715  --------  714
                   
Sbjct 734  AGGATGAC  741