Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11255
• Subject: XM_006510778.2
• Aligned Length: 776
• Identities: 607
• Gaps: 88

Alignment

Query   1  ATGG---AGAT------GGGCAGACG--GATTCATTTAGAGCTGC-----GG----AACA--------GGACGC  46
           ||||   ||||      |||.||..|  |||       |.|||||     ||    ||||        ||    
Sbjct   1  ATGGAAAAGATGATCGAGGGGAGGAGAAGAT-------GGGCTGCCTCCTGGATTAAACAACAAAAAGGG----  63

Query  47  CCTCTGATGTGAAAGAACTTGTCCTGGACAACAGTCGGTCGAATGAAGGCAAACTCGAAGGCCTCACAGATGAA  120
                   ||||||||.||.||||||||.|||.||..|||.|.||||||||||.|||||||||||||.|||||.
Sbjct  64  --------GTGAAAGAGCTGGTCCTGGATAACTGTAAGTCAATTGAAGGCAAAATCGAAGGCCTCACGGATGAG  129

Query 121  TTTGAAGAACTGGAATTCTTAAGTACAATCAACGTAGGCCTCACCTCAATCGCAAACTTACCAAAGTTAAACAA  194
           ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||..|.||||||||||||||||||||
Sbjct 130  TTTGAAGAACTGGAATTCCTAAGTACAATCAACGTAGGCCTCACCTCCATTTCCAACTTACCAAAGTTAAACAA  203

Query 195  ACTTAAGAAGCTTGAACTAAGCGATAACAGAGTCTCAGGGGGCCTGGAAGTATTGGCAGAAAAGTGTCCGAACC  268
           |||.||||||||||||.|||||||.||||||.|||||||||.||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 204  ACTCAAGAAGCTTGAATTAAGCGAAAACAGAATCTCAGGGGACCTGGAAGTATTGGCAGAGAAATGTCCGAACC  277

Query 269  TCACGCATCTAAATTTAAGTGGCAACAAAATTAAAGACCTCAGCACAATAGAGCCACTGAAAAAGTTAGAAAAC  342
           |.|.|||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.
Sbjct 278  TTAAGCATCTAAATTTAAGTGGCAACAAAATAAAAGATCTCAGCACAATAGAGCCGCTGAAGAAGTTAGAGAAT  351

Query 343  CTCAAGAGCTTAGACCTTTTCAATTGCGAGGTAACCAACCTGAACGACTACCGAGAAAATGTGTTCAAGCTCCT  416
           |||||||||.|||||||.||.||.||.|||||.|||||||||||.|.||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 352  CTCAAGAGCCTAGACCTGTTTAACTGTGAGGTGACCAACCTGAATGCCTACCGAGAAAACGTGTTCAAGCTCCT  425

Query 417  CCCGCAACTCACATATCTCGACGGCTATGACCGGGACGACAAGGAGGCCCCTGACTCGGATGCTGAGGGCTACG  490
           .||.||..|||..||.|||||.|||||||||.|||||.|||||||||||||.|||||.||||.|||||||||||
Sbjct 426  GCCCCAGGTCATGTACCTCGATGGCTATGACAGGGACAACAAGGAGGCCCCCGACTCCGATGTTGAGGGCTACG  499

Query 491  TGGAGGGCCTGGATGATGAGGAGGAGGATGAGGATGAGGAGGAGTATGATGAAGATGCTCAGGTAGTGGAAGAC  564
           ||||      ||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||.|||.||||||||||.
Sbjct 500  TGGA------GGATGACGACGAGGAAGATGAGGATGAGGAGGAGTATGATGAATATGCCCAGCTAGTGGAAGAT  567

Query 565  GAGGAGGACGAGGATGAGGAGGAGGAAGGTGAAGAGGAGGACGTGAGTGGAGAGGAGGAGGAGGATGAAGAAGG  638
           ||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 568  GAAGAGGAAGAGGATGAGGAGGAAGAAGGGGAGGAAGAGGATGTGAGTGGAGAGGAGGAGGAGGATGAGGAAGG  641

Query 639  TTATAACGATGGAGAGGTAGATGACGAGGAAGATGAAGAAG-AGCTTGGTGAAGAAGAAAGGGGTCAGAAGCGA  711
           |||.||.||.||.||.||.||||||||||||||.||||||| ||| |||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 642  TTACAATGACGGGGAAGTGGATGACGAGGAAGACGAAGAAGAAGC-TGGTGAAGAAGAAGGGAGTCAGAAGCGA  714

Query 712  AAA---------------------------------  714
           |||                                 
Sbjct 715  AAACGAGAACCGGACGATGAGGGCGAAGAGGATGAC  750