Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_11282
Subject:
NM_001286675.2
Aligned Length:
661
Identities:
525
Gaps:
131

Alignment

Query   1  ATGGGATCAGAGCGGATGGAGATGCGGAAGCGGCAGATGCCCGCCGCCCAGGACACACCAGGCGCCGCCCCAGG  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  CCAGCCCGGAGCGGGGAGTCGCGGGTCCAACGCATG--------CTGCTTCTGCTGGTGCTGCTGTTGTAGCTG  140
                                            |||        ||       |.||    ||||||   .|||
Sbjct   1  ---------------------------------ATGAAGGAGACCT-------CAGG----GCTGTT---CCTG  27

Query 141  --CTCGTGTCTCACTGTTAGAAACCAGGAAGATCAGAGGCCCACAATAGCTTCCCACGAACTCAGAGCAGATCT  212
             .||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  28  ATATCAAGTCTCACTGTTAGAAACCAGGAAGATCAGAGGCCCACAATAGCTTCCCACGAACTCAGAGCAGATCT  101

Query 213  TCCAACCTGGGAAGAAAGCCCTGCTCCTACTCTGGAAGAAGTCAACGCCTGGGCTCAGTCATTTGACAAATTAA  286
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 102  TCCAACCTGGGAAGAAAGCCCTGCTCCTACTCTGGAAGAAGTCAACGCCTGGGCTCAGTCATTTGACAAATTAA  175

Query 287  TGGTCACTCCAGCAGGAAGGAATGCATTCCGTGAATTCCTCCGAACAGAATTCAGTGAGGAAAATATGCTCTTC  360
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 176  TGGTCACTCCAGCAGGAAGGAATGCATTCCGTGAATTCCTCCGAACAGAATTCAGTGAGGAAAATATGCTCTTC  249

Query 361  TGGATGGCCTGTGAGGAACTGAAAAAGGAAGCTAATAAAAACATTATTGAAGAGAAAGCAAGGATAATCTATGA  434
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 250  TGGATGGCCTGTGAGGAACTGAAAAAGGAAGCTAATAAAAACATTATTGAAGAGAAAGCAAGGATAATCTATGA  323

Query 435  AGACTACATTTCTATACTTTCTCCTAAGGAGGTGAGCTTAGACTCCCGGGTGAGAGAAGTGATCAACAGAAACA  508
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 324  AGACTACATTTCTATACTTTCTCCTAAGGAGGTGAGCTTAGACTCCCGGGTGAGAGAAGTGATCAACAGAAACA  397

Query 509  TGGTGGAGCCATCCCAACACATATTCGATGATGCTCAACTTCAGATTTACACCCTGATGCACAGAGACTCATAT  582
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 398  TGGTGGAGCCATCCCAACACATATTCGATGATGCTCAACTTCAGATTTACACCCTGATGCACAGAGACTCATAT  471

Query 583  CCTCGATTCATGAACTCTGCTGTCTATAAGGACTTGCTTCAGTCCTTATCGGAGAAATCTATTGAAGCA  651
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 472  CCTCGATTCATGAACTCTGCTGTCTATAAGGACTTGCTTCAGTCCTTATCGGAGAAATCTATTGAAGCA  540