Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_11307
- Subject:
- XM_011512092.1
- Aligned Length:
- 1867
- Identities:
- 1352
- Gaps:
- 512
Alignment
Query 1 ATGACAGGGCTCGTGTCCCTGTCATATTTTCCACTCTCCACGAGGTCCTGCGCGCTTCAATCCT----GCAGCC 70
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1 ATGACAGGGCTCGTGTCCCTGTCATATTTTCCACTCTCCACGAGGTCCTGCGCGCTTCAATCCTGCAGGCAGCC 74
Query 71 CGGTTTGGGGATGTGGTCCTTGCTGCTCTGCGGGTTGTCCATCGCCCTTCCACTGTCTGTCACAGC-------- 136
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CGGTTTGGGGATGTGGTCCTTGCTGCTCTGCGGGTTGTCCATCGCCCTTCCACTGTCTGTCACAGCAGATGGAT 148
Query 137 -------------------------------------------------------------------------- 136
Sbjct 149 GCAAGGACATTTTTATGAAAAATGAGATACTTTCAGCAAGCCAGCCTTTTGCTTTTAATTGTACATTCCCTCCC 222
Query 137 -------------------------------------------------------------------------- 136
Sbjct 223 ATAACATCTGGGGAAGTCAGTGTAACATGGTATAAAAATTCTAGCAAAATCCCAGTGTCCAAAATCATACAGTC 296
Query 137 -------------------------------------------------------------------------- 136
Sbjct 297 TAGAATTCACCAGGACGAGACTTGGATTTTGTTTCTCCCCATGGAATGGGGGGACTCAGGAGTCTACCAATGTG 370
Query 137 -------------------------------------------------------------------------- 136
Sbjct 371 TTATAAAGGGTAGAGACAGCTGTCATAGAATACATGTAAACCTAACTGTTTTTGAAAAACATTGGTGTGACACT 444
Query 137 -------------------------------------------------------------------------- 136
Sbjct 445 TCCATAGGTGGTTTACCAAATTTATCAGATGAGTACAAGCAAATATTACATCTTGGAAAAGATGATAGTCTCAC 518
Query 137 -----------------------------------------------------AGGACTGTAACGAGATTAAAG 157
|||||||||||||||||||||
Sbjct 519 ATGTCATCTGCACTTCCCGAAGAGTTGTGTTTTGGGTCCAATAAAGTGGTATAAGGACTGTAACGAGATTAAAG 592
Query 158 GGGAGCGGTTCACTGTTTTGGAAACCAGGCTTTTGGTGAGCAATGTCTCGGCAGAGGACAGAGGGAACTACGCG 231
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GGGAGCGGTTCACTGTTTTGGAAACCAGGCTTTTGGTGAGCAATGTCTCGGCAGAGGACAGAGGGAACTACGCG 666
Query 232 TGTCAAGCCATACTGACACACTCAGGGAAGCAGTACGAGGTTTTAAATGGCATCACTGTGAGCATTA---AAAG 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 667 TGTCAAGCCATACTGACACACTCAGGGAAGCAGTACGAGGTTTTAAATGGCATCACTGTGAGCATTACAGAAAG 740
Query 303 AGCTGGATATGGAGGAAGTGTCCCTAAAATCATTTATCCAAAAAATCATTCAATTGAAGTACAGCTTGGTACCA 376
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGCTGGATATGGAGGAAGTGTCCCTAAAATCATTTATCCAAAAAATCATTCAATTGAAGTACAGCTTGGTACCA 814
Query 377 CTCTGATTGTGGACTGCAATGTAACAGACACCAAGGATAATACAAATCTACGATGCTGGAGAGTCAATAACACT 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CTCTGATTGTGGACTGCAATGTAACAGACACCAAGGATAATACAAATCTACGATGCTGGAGAGTCAATAACACT 888
Query 451 TTGGTGGATGATTACTATGATGAATCCAAACGAATCAGAGAAGGGGTGGAAACCCATGTCTCTTTTCGGGAACA 524
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TTGGTGGATGATTACTATGATGAATCCAAACGAATCAGAGAAGGGGTGGAAACCCATGTCTCTTTTCGGGAACA 962
Query 525 TAATTTGTACACAGTAAACATCACCTTCTTGGAAGTGAAAATGGAAGATTATGGCCTTCCTTTCATGTGCCACG 598
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TAATTTGTACACAGTAAACATCACCTTCTTGGAAGTGAAAATGGAAGATTATGGCCTTCCTTTCATGTGCCACG 1036
Query 599 CTGGAGTGTCCACAGCATACATTATATTACAGCTCCCAGCTCCGGATTTTCGAGCTTACTTGATAGGAGGGCTT 672
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CTGGAGTGTCCACAGCATACATTATATTACAGCTCCCAGCTCCGGATTTTCGAGCTTACTTGATAGGAGGGCTT 1110
Query 673 ATCGCCTTGGTGGCTGTGGCTGTGTCTGTTGTGTACATATACAACATTTTTAAGATCGACATTGTTCTTTGGTA 746
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ATCGCCTTGGTGGCTGTGGCTGTGTCTGTTGTGTACATATACAACATTTTTAAGATCGACATTGTTCTTTGGTA 1184
Query 747 TCGAAGTGCCTTCCATTCTACAGAGACCATAGTAGATGGGAAGCTGTATGACGCCTATGTCTTATACCCCAAGC 820
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TCGAAGTGCCTTCCATTCTACAGAGACCATAGTAGATGGGAAGCTGTATGACGCCTATGTCTTATACCCCAAGC 1258
Query 821 CCCACAAGGAAAGCCAGAGGCATGCCGTGGATGCCCTGGTGTTGAATATCCTGCCCGAGGTGTTGGAGAGACAA 894
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CCCACAAGGAAAGCCAGAGGCATGCCGTGGATGCCCTGGTGTTGAATATCCTGCCCGAGGTGTTGGAGAGACAA 1332
Query 895 TGTGGATATAAGTTGTTTATATTCGGCAGAGATGAATTCCCTGGACAAGCCGTGGCCAATGTCATCGATGAAAA 968
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TGTGGATATAAGTTGTTTATATTCGGCAGAGATGAATTCCCTGGACAAGCCGTGGCCAATGTCATCGATGAAAA 1406
Query 969 CGTTAAGCTGTGCAGGAGGCTGATTGTCATTGTGGTCCCCGAATCGCTGGGCTTTGGCCTGTTGAAGAACCTGT 1042
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CGTTAAGCTGTGCAGGAGGCTGATTGTCATTGTGGTCCCCGAATCGCTGGGCTTTGGCCTGTTGAAGAACCTGT 1480
Query 1043 CAGAAGAACAAATCGCGGTCTACAGTGCCCTGATCCAGGACGGGATGAAGGTTATTCTCATTGAGCTGGAGAAA 1116
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CAGAAGAACAAATCGCGGTCTACAGTGCCCTGATCCAGGACGGGATGAAGGTTATTCTCATTGAGCTGGAGAAA 1554
Query 1117 ATCGAGGACTACACAGTCATGCCAGAGTCAATTCAGTACATCAAACAGAAGCATGGTGCCATCCGGTGGCATGG 1190
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 ATCGAGGACTACACAGTCATGCCAGAGTCAATTCAGTACATCAAACAGAAGCATGGTGCCATCCGGTGGCATGG 1628
Query 1191 GGACTTCACGGAGCAGTCACAGTGTATGAAGACCAAGTTTTGGAAGACAGTGAGATACCACATGCCGCCCAGAA 1264
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GGACTTCACGGAGCAGTCACAGTGTATGAAGACCAAGTTTTGGAAGACAGTGAGATACCACATGCCGCCCAGAA 1702
Query 1265 GGTGTCGGCCGTTTCCTCCGGTCCAGCTGCTGCAGCACACACCTTGCTACCGCACCGCAGGC---CC----AGA 1331
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 1703 GGTGTCGGCCGTTTCCTCCGGTCCAGCTGCTGCAGCACACACCTTGCTACCGCACCGCAGGCTGTCCCTGGAGA 1776
Query 1332 ----------ACTAGGCTCAAGAAGAAAGAAGTGTACTCTCACGA---CTGGC--------------------- 1371
|||.| |||||.| .|||| || |||||
Sbjct 1777 GGAGCTCTCCACTTG-----AGAAGGA----------CCTCA-GAGCCCTGGCTCTTGTCATCCAAATTCACCT 1834
Query 1372 ----------------- 1371
Sbjct 1835 TTCCTCTGGGGCTCTTA 1851
