Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_11307
- Subject:
- XM_011512093.1
- Aligned Length:
- 1871
- Identities:
- 1283
- Gaps:
- 577
Alignment
Query 1 ATGACAGGGCTCGTGTCCCTGTCATATTTTCCACTCTCCACGAGGTCCTGCGCGCTTCAATCCT----GCAGCC 70
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1 ATGACAGGGCTCGTGTCCCTGTCATATTTTCCACTCTCCACGAGGTCCTGCGCGCTTCAATCCTGCAGGCAGCC 74
Query 71 CGGTTTGGGGATGTGGTCCTTGCTGCTCTGCGGGTTGTCCATCGCCCTTCCACTGTCTGTCACAGC-------- 136
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CGGTTTGGGGATGTGGTCCTTGCTGCTCTGCGGGTTGTCCATCGCCCTTCCACTGTCTGTCACAGCAGATGGAT 148
Query 137 -------------------------------------------------------------------------- 136
Sbjct 149 GCAAGGACATTTTTATGAAAAATGAGATACTTTCAGCAAGCCAGCCTTTTGCTTTTAATTGTACATTCCCTCCC 222
Query 137 -------------------------------------------------------------------------- 136
Sbjct 223 ATAACATCTGGGGAAGTCAGTGTAACATGGTATAAAAATTCTAGCAAAATCCCAGTGTCCAAAATCATACAGTC 296
Query 137 -------------------------------------------------------------------------- 136
Sbjct 297 TAGAATTCACCAGGACGAGACTTGGATTTTGTTTCTCCCCATGGAATGGGGGGACTCAGGAGTCTACCAATGTG 370
Query 137 -------------------------------------------------------------------------- 136
Sbjct 371 TTATAAAGGGTAGAGACAGCTGTCATAGAATACATGTAAACCTAACTGTTTTTGAAAAACATTGGTGTGACACT 444
Query 137 -------------------------------------------------------------------------- 136
Sbjct 445 TCCATAGGTGGTTTACCAAATTTATCAGATGAGTACAAGCAAATATTACATCTTGGAAAAGATGATAGTCTCAC 518
Query 137 -----------------------------------------------------AGGACTGTAACGAGATTAAAG 157
|||||||||||||||||||||
Sbjct 519 ATGTCATCTGCACTTCCCGAAGAGTTGTGTTTTGGGTCCAATAAAGTGGTATAAGGACTGTAACGAGATTAAAG 592
Query 158 GGGAGCGGTTCACTGTTTTGGAAACCAGGCTTTTGGTGAGCAATGTCTCGGCAGAGGACAGAGGGAACTACGCG 231
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GGGAGCGGTTCACTGTTTTGGAAACCAGGCTTTTGGTGAGCAATGTCTCGGCAGAGGACAGAGGGAACTACGCG 666
Query 232 TGTCAAGCCATACTGACACACTCAGGGAAGCAGTACGAGGTTTTAAATGGCATCACTGTGAGCATTAAAAGAGC 305
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TGTCAAGCCATACTGACACACTCAGGGAAGCAGTACGAGGTTTTAAATGGCATCACTGTGAGCATTA------- 733
Query 306 TGGATATGGAGGAAGTGTCCCTAAAATCATTTATCCAAAAAATCATTCAATTGAAGTACAGCTTGGTACCACTC 379
|||||||||
Sbjct 734 -----------------------------------------------------------------GTACCACTC 742
Query 380 TGATTGTGGACTGCAATGTAACAGACACCAAGGATAATACAAATCTACGATGCTGGAGAGTCAATAACACTTTG 453
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 743 TGATTGTGGACTGCAATGTAACAGACACCAAGGATAATACAAATCTACGATGCTGGAGAGTCAATAACACTTTG 816
Query 454 GTGGATGATTACTATGATGAATCCAAACGAATCAGAGAAGGGGTGGAAACCCATGTCTCTTTTCGGGAACATAA 527
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 817 GTGGATGATTACTATGATGAATCCAAACGAATCAGAGAAGGGGTGGAAACCCATGTCTCTTTTCGGGAACATAA 890
Query 528 TTTGTACACAGTAAACATCACCTTCTTGGAAGTGAAAATGGAAGATTATGGCCTTCCTTTCATGTGCCACGCTG 601
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 891 TTTGTACACAGTAAACATCACCTTCTTGGAAGTGAAAATGGAAGATTATGGCCTTCCTTTCATGTGCCACGCTG 964
Query 602 GAGTGTCCACAGCATACATTATATTACAGCTCCCAGCTCCGGATTTTCGAGCTTACTTGATAGGAGGGCTTATC 675
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 965 GAGTGTCCACAGCATACATTATATTACAGCTCCCAGCTCCGGATTTTCGAGCTTACTTGATAGGAGGGCTTATC 1038
Query 676 GCCTTGGTGGCTGTGGCTGTGTCTGTTGTGTACATATACAACATTTTTAAGATCGACATTGTTCTTTGGTATCG 749
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1039 GCCTTGGTGGCTGTGGCTGTGTCTGTTGTGTACATATACAACATTTTTAAGATCGACATTGTTCTTTGGTATCG 1112
Query 750 AAGTGCCTTCCATTCTACAGAGACCATAGTAGATGGGAAGCTGTATGACGCCTATGTCTTATACCCCAAGCCCC 823
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1113 AAGTGCCTTCCATTCTACAGAGACCATAGTAGATGGGAAGCTGTATGACGCCTATGTCTTATACCCCAAGCCCC 1186
Query 824 ACAAGGAAAGCCAGAGGCATGCCGTGGATGCCCTGGTGTTGAATATCCTGCCCGAGGTGTTGGAGAGACAATGT 897
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1187 ACAAGGAAAGCCAGAGGCATGCCGTGGATGCCCTGGTGTTGAATATCCTGCCCGAGGTGTTGGAGAGACAATGT 1260
Query 898 GGATATAAGTTGTTTATATTCGGCAGAGATGAATTCCCTGGACAAGCCGTGGCCAATGTCATCGATGAAAACGT 971
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1261 GGATATAAGTTGTTTATATTCGGCAGAGATGAATTCCCTGGACAAGCCGTGGCCAATGTCATCGATGAAAACGT 1334
Query 972 TAAGCTGTGCAGGAGGCTGATTGTCATTGTGGTCCCCGAATCGCTGGGCTTTGGCCTGTTGAAGAACCTGTCAG 1045
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1335 TAAGCTGTGCAGGAGGCTGATTGTCATTGTGGTCCCCGAATCGCTGGGCTTTGGCCTGTTGAAGAACCTGTCAG 1408
Query 1046 AAGAACAAATCGCGGTCTACAGTGCCCTGATCCAGGACGGGATGAAGGTTATTCTCATTGAGCTGGAGAAAATC 1119
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1409 AAGAACAAATCGCGGTCTACAGTGCCCTGATCCAGGACGGGATGAAGGTTATTCTCATTGAGCTGGAGAAAATC 1482
Query 1120 GAGGACTACACAGTCATGCCAGAGTCAATTCAGTACATCAAACAGAAGCATGGTGCCATCCGGTGGCATGGGGA 1193
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1483 GAGGACTACACAGTCATGCCAGAGTCAATTCAGTACATCAAACAGAAGCATGGTGCCATCCGGTGGCATGGGGA 1556
Query 1194 CTTCACGGAGCAGTCACAGTGTATGAAGACCAAGTTTTGGAAGACAGTGAGATACCACATGCCGCCCAGAAGGT 1267
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1557 CTTCACGGAGCAGTCACAGTGTATGAAGACCAAGTTTTGGAAGACAGTGAGATACCACATGCCGCCCAGAAGGT 1630
Query 1268 GTCGGCCGTTTCCTCCGGTCCAGCTGCTGCAGCACACACCTTGCTACCGCACCGCAGGCCCAGA---------- 1331
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| .||
Sbjct 1631 GTCGGCCGTTTCCTCCGGTCCAGCTGCTGCAGCACACACCTTGCTACCGCACCGCAGG---TGAGCGGGTGGGA 1701
Query 1332 ----ACTAGG---CTCAAGAA--GAAAGAAGTGTACT---------------CTCACGACTGGC---------- 1371
||.||| .|||.|.| | |.|.||.|| || |||||..||||.
Sbjct 1702 GGACACGAGGTTTGTCACGCACTG-ATGGAGGGT-CTATCATTGCGTGGTGGCTCACAGCTGGAGGAGGACACG 1773
Query 1372 --------------------- 1371
Sbjct 1774 TTTCATCGGGGCCGTCTGCTC 1794
