Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_11323
- Subject:
- XM_006532452.2
- Aligned Length:
- 1672
- Identities:
- 1324
- Gaps:
- 161
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAAGCTCCAGGTGTTGGTGTTGGTGTTGCTGATGTCCTGGTTCGGTGTCCTGAGCTGGGTGCAGGCAGAATT 74
Query 1 -------------------ATGACTGACCTGATTTATGCAGAGAAAGAGCTGGTGCAGTCTCTGAAAGAGTACA 55
|||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 75 CTTCACCTCCATTGGGCACATGACCGATCTGATTTACGCAGAGAAGGACCTGGTACAGTCTCTGAAGGAGTACA 148
Query 56 TCCTTGTGGAGGAAGCCAAGCTTTCCAAGATTAAGAGCTGGGCCAACAAAATGGAAGCCTTGACTAGCAAGTCA 129
||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||.|||.|||||||||.||||.||||..|||
Sbjct 149 TCCTTGTGGAGGAAGCCAAGCTCGCCAAGATTAAGAGCTGGGCCAGCAAGATGGAAGCCCTGACCAGCAGATCA 222
Query 130 GCTGCTGATGCTGAGGGCTACCTGGCTCACCCTGTGAATGCCTACAAACTGGTGAAGCGGCTAAACACAGACTG 203
|||||.||..|.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||.|.|||||||||||
Sbjct 223 GCTGCCGACCCCGAGGGCTACCTGGCTCATCCTGTGAATGCCTACAAGCTGGTGAAGCGGTTGAACACAGACTG 296
Query 204 GCCTGCGCTGGAGGACCTTGTCCTGCAGGACTCAGCTGCAGGTTTTATCGCCAACCTCTCTGTGCAGCGGCAGT 277
||||||.||||.||||||||||||.|||||..|..|.|||||||||.||||.||||||||.||.||||||||.|
Sbjct 297 GCCTGCACTGGGGGACCTTGTCCTTCAGGATGCTTCGGCAGGTTTTGTCGCTAACCTCTCAGTTCAGCGGCAAT 370
Query 278 TCTTCCCCACTGATGAGGACGAGATAGGAGCTGCCAAAGCCCTGATGAGACTTCAGGACACATACAGGCTGGAC 351
|||||||||||||||||||||||...||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||..|||||.
Sbjct 371 TCTTCCCCACTGATGAGGACGAGTCTGGAGCTGCCAGAGCCCTGATGAGACTTCAGGACACGTACAAACTGGAT 444
Query 352 CCAGGCACAATTTCCAGAGGGGAACTTCCAGGAACCAAGTACCAGGCAATGCTGAGTGTGGATGACTGCTTTGG 425
||.|.|||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 445 CCGGACACGATTTCCAGAGGGGAACTTCCAGGCACAAAGTACCAGGCCATGCTGAGTGTGGACGACTGCTTTGG 518
Query 426 GATGGGCCGCTCGGCCTACAATGAAGGGGACTATTATCATACGGTGTTGTGGATGGAGCAGGTGCTAAAGCAGC 499
|.||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||.||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 519 GCTGGGCCGCTCAGCTTACAATGAAGGAGACTATTACCATACTGTGCTGTGGATGGAGCAGGTACTGAAGCAGC 592
Query 500 TTGATGCCGGGGAGGAGGCCACCACAACCAAGTCACAGGTGCTGGACTACCTCAGCTATGCTGTCTTCCAGTTG 573
|.|||||.||||||||||||||....||||||||.|.|||||||||||||||.|||||||||||||||||..||
Sbjct 593 TCGATGCTGGGGAGGAGGCCACTGTTACCAAGTCCCTGGTGCTGGACTACCTGAGCTATGCTGTCTTCCAACTG 666
Query 574 GGTGATCTGCACCGTGCCCTGGAGCTCACCCGCCGCCTGCTCTCCCTTGACCCAAGCCACGAACGAGCTGGAGG 647
|||||.|||||||||||..||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GGTGACCTGCACCGTGCTGTGGAACTCACCCGCCGCCTGCTCTCTCTTGACCCAAGCCACGAACGAGCTGGAGG 740
Query 648 GAATCTGCGGTACTTTGAGCAGTTATTGGAGGAAGAGAGAGAAAAAACGTTAACAAATCAGACAGAAGCTGAGC 721
||||||||||||||||||.|.|||.||.||||||||.||||..|||.|..|..|||||||||||||.||.|..|
Sbjct 741 GAATCTGCGGTACTTTGAACGGTTGTTAGAGGAAGAAAGAGGGAAATCACTGTCAAATCAGACAGACGCCGGAC 814
Query 722 TAGCAACCCCAGAAGGCATCTATGAGAGGCCTGTGGACTACCTGCCTGAGAGGGATGTTTACGAGAGCCTCTGT 795
|.||.||||..|||..|.|.||.||||||||...||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 815 TGGCCACCCAGGAAAACTTGTACGAGAGGCCCACGGACTACCTGCCTGAGAGGGATGTGTACGAGAGCCTGTGT 888
Query 796 CGTGGGGAGGGTGTCAAACTGACACCCCGTAGACAGAAGAGGCTTTTCTGTAGGTACCACCATGGCAACAGGGC 869
||.||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||||.||||||||||||||||||.|||||.|||||.|.
Sbjct 889 CGAGGGGAGGGCGTGAAACTGACACCCCGGAGGCAGAAGAAGCTTTTCTGTAGGTACCATCATGGAAACAGAGT 962
Query 870 CCCACAGCTGCTCATTGCCCCCTTCAAAGAGGAGGACGAGTGGGACAGCCCGCACATCGTCAGGTACTACGATG 943
.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 963 GCCACAGCTCCTCATCGCCCCCTTCAAAGAGGAAGACGAGTGGGACAGCCCACACATCGTCAGGTACTATGATG 1036
Query 944 TCATGTCTGATGAGGAAATCGAGAGGATCAAGGAGATCGCAAAACCTAAACTTGCACGAGCCACCGTTCGTGAT 1017
|.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct 1037 TGATGTCCGACGAAGAAATCGAGAGGATCAAGGAGATTGCTAAGCCCAAACTTGCACGAGCCACTGTGCGTGAC 1110
Query 1018 CCCAAGACAGGAGTCCTCACTGTCGCCAGCTACCGGGTTTCCAAAAGCTCCTGGCTAGAGGAAGATGATGACCC 1091
|||||||||||.|||||||||||.|||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1111 CCCAAGACAGGTGTCCTCACTGTTGCCAGCTACAGAGTTTCCAAAAGCTCCTGGCTAGAGGAGGATGACGACCC 1184
Query 1092 TGTTGTGGCCCGAGTAAATCGTCGGATGCAGCATATCACAGGGTTAACAGTAAAGACTGCAGAATTGTTACAGG 1165
||||||||||||.||.||.||.||||||||.||||||||.|||.||||.||.|||||||||||..|.||.||||
Sbjct 1185 TGTTGTGGCCCGGGTCAACCGGCGGATGCAACATATCACCGGGCTAACGGTGAAGACTGCAGAGCTATTGCAGG 1258
Query 1166 TTGCAAATTATGGAGTGGGAGGACAGTATGAACCGCACTTCGACTTCTCTAGGCGACCTTTTGACAGCGGCCTC 1239
|.|||||.||.|||.||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1259 TCGCAAACTACGGAATGGGGGGACAGTACGAACCACACTTTGACTTCTCAAGGCGACCCTTTGACAGCGGCCTC 1332
Query 1240 AAAACAGAGGGGAATAGGTTAGCGACGTTTCTT----------------------------------------- 1272
|||||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AAAACGGAGGGCAATAGGTTAGCGACGTTTCTTAACTATAGCGATGAGCAAGATGCTTTCAAGCGTTTAGGGAC 1406
Query 1273 -------------------------AACTACATGAGTGATGTAGAAGCTGGTGGTGCCACCGTCTTCCCTGATC 1321
|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||..
Sbjct 1407 TGGGAACCGTGTGGCCACGTTTCTAAACTACATGAGCGATGTCGAAGCTGGTGGTGCCACCGTCTTTCCTGACT 1480
Query 1322 TGGGGGCTGCAATTTGGCCTAAGAAGGGTACAGCTGTGTTCTGGTACAACC-TCTTGCGGAGCGGGGAAGGTGA 1394
||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||| |||| ||.||.|||||||||||
Sbjct 1481 TGGGAGCTGCTATTTGGCCCAAGAAGGGCACAGCTGTATTCTGGTACAACCTTCTT-CGCAGTGGGGAAGGTGA 1553
Query 1395 CTACCGAACAAGACATGCTGCCTGCCCTGTGCTTGTGGGCTGCAAGTGGGTCTCCAATAAGTGGTTCCATGAAC 1468
.||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1554 TTATCGGACGAGACATGCAGCCTGCCCTGTGCTTGTGGGCTGCAAGTGGGTCTCCAACAAGTGGTTCCATGAGC 1627
Query 1469 GAGGACAGGAGTTCTTGAGACCTTGTGGATCAACAGAAGTTGAC 1512
||||||||||||||||.||||||||||||.||||.||||||||.
Sbjct 1628 GAGGACAGGAGTTCTTAAGACCTTGTGGAACAACGGAAGTTGAT 1671