Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11339
• Subject: NM_004697.4
• Aligned Length: 1566
• Identities: 1563
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGGCTTCCTCGCGAGCCTCTTCCAC---GGCAACCAAAACTAAAGCACCCGACGACTTAGTTGCTCCGGTCGT  71
            ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTTCCTCGCGAGCCTCTTCCACGCAGGCAACCAAAACTAAAGCACCCGACGACTTAGTTGCTCCGGTCGT  74

Query   72  GAAGAAACCACACATCTATTATGGAAGTTTGGAAGAGAAGGAGAGGGAGCGTCTGGCCAAAGGAGAGTCTGGGA  145
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAAGAAACCACACATCTATTATGGAAGTTTGGAAGAGAAGGAGAGGGAGCGTCTGGCCAAAGGAGAGTCTGGGA  148

Query  146  TTTTGGGGAAAGACGGACTTAAAGCAGGGATCGAAGCTGGAAATATTAATATAACCTCTGGAGAAGTGTTTGAA  219
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTTTGGGGAAAGACGGACTTAAAGCAGGGATCGAAGCTGGAAATATTAATATAACCTCTGGAGAAGTGTTTGAA  222

Query  220  ATTGAAGAGCATATCAGCGAGCGACAGGCAGAAGTATTGGCTGAGTTTGAGAGAAGGAAGCGAGCCCGGCAGAT  293
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATTGAAGAGCATATCAGCGAGCGACAGGCAGAAGTATTGGCTGAGTTTGAGAGAAGGAAGCGAGCCCGGCAGAT  296

Query  294  CAATGTTTCCACAGATGACTCAGAGGTCAAAGCTTGCCTTAGAGCCTTGGGGGAACCCATCACACTTTTTGGAG  367
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAATGTTTCCACAGATGACTCAGAGGTCAAAGCTTGCCTTAGAGCCTTGGGGGAACCCATCACACTTTTTGGAG  370

Query  368  AGGGTCCTGCTGAAAGAAGAGAAAGGTTAAGAAATATCCTCTCAGTTGTCGGTACTGATGCCTTGAAAAAGACC  441
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGGTCCTGCTGAAAGAAGAGAAAGGTTAAGAAATATCCTCTCAGTTGTCGGTACTGATGCCTTGAAAAAGACC  444

Query  442  AAAAAGGATGATGAGAAGTCTAAAAAGTCCAAAGAAGAGTATCAGCAAACCTGGTATCATGAAGGACCAAATAG  515
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAAAAGGATGATGAGAAGTCTAAAAAGTCCAAAGAAGAGTATCAGCAAACCTGGTATCATGAAGGACCAAATAG  518

Query  516  CTTGAAGGTGGCAAGACTATGGATTGCTAATTATTCGTTGCCCAGGGCAATGAAACGCTTGGAAGAGGCCCGAC  589
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTTGAAGGTGGCAAGACTATGGATTGCTAATTATTCGTTGCCCAGGGCAATGAAACGCTTGGAAGAGGCCCGAC  592

Query  590  TCCATAAGGAGATTCCTGAGACAACAAGGACCTCCCAGATGCAAGAGCTGCACAAGTCTCTCCGGTCTTTGAAT  663
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCCATAAGGAGATTCCTGAGACAACAAGGACCTCCCAGATGCAAGAGCTGCACAAGTCTCTCCGGTCTTTGAAT  666

Query  664  AATTTTTGCAGTCAGATTGGGGATGATCGGCCTATCTCCTACTGTCACTTTAGTCCCAATTCCAAGATGCTGGC  737
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AATTTTTGCAGTCAGATTGGGGATGATCGGCCTATCTCCTACTGTCACTTTAGTCCCAATTCCAAGATGCTGGC  740

Query  738  CACAGCTTGTTGGAGTGGGCTTTGCAAGCTCTGGTCTGTTCCTGATTGCAACCTCCTTCACACTCTTCGAGGGC  811
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CACAGCTTGTTGGAGTGGGCTTTGCAAGCTCTGGTCTGTTCCTGATTGCAACCTCCTTCACACTCTTCGAGGGC  814

Query  812  ATAACACAAATGTAGGAGCAATTGTATTCCATCCCAAATCCACTGTCTCCTTGGACCCAAAAGATGTCAACCTG  885
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATAACACAAATGTAGGAGCAATTGTATTCCATCCCAAATCCACTGTCTCCTTGGACCCAAAAGATGTCAACCTG  888

Query  886  GCCTCTTGTGCGGCTGATGGCTCTGTGAAGCTTTGGAGTCTCGACAGTGATGAACCAGTGGCAGATATTGAAGG  959
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCCTCTTGTGCGGCTGATGGCTCTGTGAAGCTTTGGAGTCTCGACAGTGATGAACCAGTGGCAGATATTGAAGG  962

Query  960  CCATACAGTGCGTGTGGCGCGGGTAATGTGGCATCCTTCAGGACGTTTCCTGGGCACCACCTGCTATGACCGTT  1033
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCATACAGTGCGTGTGGCGCGGGTAATGTGGCATCCTTCAGGACGTTTCCTGGGCACCACCTGCTATGACCGTT  1036

Query 1034  CATGGCGCTTATGGGATTTGGAGGCTCAAGAGGAGATCCTGCATCAGGAAGGCCATAGCATGGGTGTGTATGAC  1107
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CATGGCGCTTATGGGATTTGGAGGCTCAAGAGGAGATCCTGCATCAGGAAGGCCATAGCATGGGTGTGTATGAC  1110

Query 1108  ATTGCCTTCCATCAAGATGGCTCTTTGGCTGGCACTGGGGGACTGGATGCATTTGGTCGAGTTTGGGACCTACG  1181
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATTGCCTTCCATCAAGATGGCTCTTTGGCTGGCACTGGGGGACTGGATGCATTTGGTCGAGTTTGGGACCTACG  1184

Query 1182  CACAGGACGTTGTATCATGTTCTTAGAAGGCCACCTGAAAGAAATCTATGGAATAAATTTCTCCCCCAATGGCT  1255
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CACAGGACGTTGTATCATGTTCTTAGAAGGCCACCTGAAAGAAATCTATGGAATAAATTTCTCCCCCAATGGCT  1258

Query 1256  ATCACATTGCAACCGGCAGTGGTGACAACACCTGCAAAGTGTGGGACCTCCGACAGCGGCGTTGCGTCTACACC  1329
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATCACATTGCAACCGGCAGTGGTGACAACACCTGCAAAGTGTGGGACCTCCGACAGCGGCGTTGCGTCTACACC  1332

Query 1330  ATCCCTGCTCATCAGAACTTAGTGACTGGTGTCAAGTTTGAGCCTATCCATGGGAACTTCTTGCTTACTGGTGC  1403
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATCCCTGCTCATCAGAACTTAGTGACTGGTGTCAAGTTTGAGCCTATCCATGGGAACTTCTTGCTTACTGGTGC  1406

Query 1404  CTATGATAACACAGCCAAGATCTGGACGCACCCAGGCTGGTCCCCGCTGAAGACTCTGGCTGGCCACGAAGGCA  1477
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CTATGATAACACAGCCAAGATCTGGACGCACCCAGGCTGGTCCCCGCTGAAGACTCTGGCTGGCCACGAAGGCA  1480

Query 1478  AAGTGATGGGCCTAGATATTTCTTCCGATGGGCAGCTCATAGCCACTTGCTCATATGACAGGACCTTCAAGCTG  1551
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AAGTGATGGGCCTAGATATTTCTTCCGATGGGCAGCTCATAGCCACTTGCTCATATGACAGGACCTTCAAGCTG  1554

Query 1552  TGGATGGCTGAA  1563
            ||||||||||||
Sbjct 1555  TGGATGGCTGAA  1566