Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_11342
- Subject:
- XM_006498641.1
- Aligned Length:
- 1853
- Identities:
- 1449
- Gaps:
- 226
Alignment
Query 1 ATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTCGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCTGCATTGGCCTCCCA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 ACGTGCTGGGATTACAGTTGGTCCTGAGAAAAGGGTGCCAGCGATGCCTGGATCGCCTGTGGAAGTGAAGATAC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AGTCCAGATCCTCACCTCCCACCATGCCACCCCTCCCACCAATAAAT----------CCTGGAG-GACCGAGGC 211
|| ||||||| |.|||
Sbjct 1 ---------------------------------------------ATGGTGGGCGTCCCTGGAGCGGCCG---- 25
Query 212 CAGTGTCCTTCACTCCTACTGCATTAAGCAATGGCATCAACCATTCTCCTCCTACCCTGAATGGTGCCCCATCA 285
||| |||.|| ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 26 ------CCT----TCCAAC-----TAAGCAATGGCATCAACCATTCCCCTCCTACCCTGAATGGTGCCCCATCG 84
Query 286 CCGCCACAGAGATTCAGCAATGGTCCTGCCTCCTCCACATCATCTGCACTCACAAATCAGCAATTGCCAGCCAC 359
||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||..||||.||.||
Sbjct 85 CCACCACAGAGATTCAGCAATGGGCCTGCCTCCTCCACATCGTCAGCACTAACGAATCAACAGCTGCCGGCTAC 158
Query 360 TTGTGGTGCTCGACAACTCAGCAAGTTGAAACGCTTTCTTACCACTCTGCAACAGTTTGGCAATGACATCTCCC 433
||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 159 TTGTGGTGCTCGGCAGCTCAGCAAGTTGAAACGCTTCCTCACCACTCTGCAGCAGTTTGGCAATGATATCTCAC 232
Query 434 CTGAGATTGGGGAGAAGGTGCGGACTCTTGTTCTTGCACTGGTGAACTCAACAGTGACAATTGAGGAATTCCAC 507
|||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||..||||||||||||||||.||||||||.||||||||.
Sbjct 233 CTGAGATCGGCGAGAAGGTTCGGACTCTCGTTCTAGCCTTGGTGAACTCAACAGTAACAATTGAAGAATTCCAT 306
Query 508 TGTAAGCTCCAAGAAGCCACAAACTTTCCCCTTCGTCCTTTTGTGATTCCATTTCTCAAGGCCAACCTGCCCCT 581
||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 307 TGCAAGCTCCAGGAGGCCACAAACTTTCCTCTTCGTCCATTTGTGATTCCATTTCTCAAGGCCAACCTGCCCCT 380
Query 582 GCTGCAGCGGGAACTGCTGCACTGCGCTCGGGCGGCCAAGCAGACCCCATCCCAGTACCTGGCTCAGCACGAAC 655
|||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct 381 GCTGCAGCGAGAACTGCTGCACTGTGCCCGGGCTGCCAAGCAGACCCCGTCCCAGTACCTGGCCCAGCATGAGC 454
Query 656 ACCTTCTGCTCAACACAAGCATTGCATCGCCTGCTGACTCGTCAGAGTTGCTCATGGAGGTGCACGGAAATGGG 729
||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||.||..|||||||||||||.||.||||||||.
Sbjct 455 ACCTTCTGCTCAACACCAGTATCGCATCTCCTGCTGACTCTTCTGAACTGCTCATGGAGGTTCATGGAAATGGA 528
Query 730 AAGAGGCCCAGTCCAGAGAGGAGAGAAGAGAATAGTTTTGATAGAGACACAATTGCTCCTGAGCCTCCTGCCAA 803
||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||.||||||.|||||.|||.||.|||||||.||.||||||||
Sbjct 529 AAGAGGCCCAGTCCGGAAAGGAGGGACGAGAATAATTTTGAAAGAGATACAGTTCCTCCTGAACCGCCTGCCAA 602
Query 804 GAGAGTATGTACCATCAGCCCTGCTCCTCGGCACAGTCCTGCTCTCACTGTGCCCCTCATGAATCCTGGGGGCC 877
||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 603 GAGAGTGTGTACTATCAGCCCTGCTCCTCGGCACAGTCCCGCCCTCACTGTTCCCCTTATGAATCCTGGGGGCC 676
Query 878 AATTCCATCCTACCCCTCCACCTCTTCAGCATTACACCTTAGAGGATATTGCAACTTCTCACCTGTATCGGGAA 951
|.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.||..||||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 677 AGTTCCATCCTACTCCACCACCTCTTCAGCACTATACACTAGAAGACATTGCAACTTCTCACCTGTATCGGGAA 750
Query 952 CCCAACAAGATGCTAGAGCATCGAGAAGTTCGTGATAGACACCACAGTCTTGGTCTAAATGGAGGCTATCAAGA 1025
||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||||.||||.||||.|||||||||||||||||
Sbjct 751 CCAAACAAGATGCTAGAACACCGAGAAGTTCGTGAGAGGCACCACAATCTTAGTCTCAATGGAGGCTATCAAGA 824
Query 1026 TGAGTTGGTAGATCATCGTTTGACAGAAAGGGAATGGGCTGATGAATGGAAACATCTTGACCATGCGCTGAATT 1099
||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 825 TGAGTTGGTAGACCACCGTTTGACAGAAAGGGAGTGGGCTGATGAATGGAAACACCTTGACCATGCACTGAATT 898
Query 1100 GCATTATGGAAATGGTAGAGAAAACAAGGCGCTCTATGGCAGTTCTGCGGCGCTGTCAGGAATCAGATCGTGAA 1173
|||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 899 GCATTATGGAAATGGTAGAGAAAACTAGGCGCTCCATGGCAGTTCTGAGGCGCTGTCAGGAATCTGACCGTGAA 972
Query 1174 GAACTCAACTACTGGAAAAGACGGTACAATGAAAACACAGAGCTGAGGAAAACGGGGACCGAGTTGGTCTCCAG 1247
|||||||||||.||||||.|.||||..||||||||.||||||.||||||||||.|||||.|||||||||||.||
Sbjct 973 GAACTCAACTATTGGAAACGGCGGTTTAATGAAAATACAGAGTTGAGGAAAACTGGGACTGAGTTGGTCTCTAG 1046
Query 1248 GCAGCACAGCCCTGGGAGTGCAGATTCTCTCAGCAATGATTCTCAGAGAGAGTTCAACAGCAGGCCAGGTACAG 1321
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||.|.||.||.|.|||.||.||||..||||
Sbjct 1047 GCAGCACAGCCCTGGGAGTACAGATTCTCTCAGCAACGATTCTCAGCGGGAATTTACCAGTAGACCAGCAACAG 1120
Query 1322 GATACGTACCTGTGGAGTTTTGGAAAAAAACAGAAGAAGCTGTGAATAAGGTGAAAATTCAGGCCATGTCAGAA 1395
||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1121 GATATGTGCCTGTGGAGTTTTGGAAGAAAACAGAAGAAGCCGTGAATAAGGTGAAAATTCAGGCCATGTCAGAG 1194
Query 1396 GTACAGAAGGCCGTCGCTGAGGCAGAGCAGAAAGCCTTTGAAGTGATTGCAACAGAGAGAGCACGAATGGAGCA 1469
|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1195 GTACAGAAGGCTGTAGCTGAGGCAGAGCAAAAAGCCTTTGAAGTGATTGCAACGGAGAGAGCTCGAATGGAGCA 1268
Query 1470 AACCATAGCGGATGTCAAGCGGCAGGCCGCAGAGGATGCTTTCCTCGTCATCAATGAGCAAGAGGAGTCCACGG 1543
.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 1269 GACCATAGCGGATGTCAAACGGCAGGCTGCAGAAGATGCTTTCCTGGTCATCAATGAGCAAGAAGAGTCCACAG 1342
Query 1544 AGAACTGCTGGAACTGTGGCCGCAAAGCCAGCGAGACATGCAGTGGCTGCAATATCGCGCGATACTGTGGCTCT 1617
||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.
Sbjct 1343 AGAACTGCTGGAACTGTGGCCGAAAAGCCAGTGAGACGTGCAGTGGCTGCAACATTGCTCGCTACTGCGGCTCC 1416
Query 1618 TTCTGCCAGCACAAGGACTGGGAGCGGCACCACCGCCTCTGTGGTCAGAACCTGCATGGCCAGAGCCCCCACGG 1691
|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||..||.||||||||.||.||||||.|
Sbjct 1417 TTCTGCCAGCATAAGGACTGGGAGCGGCACCACCGCCTCTGTGGCCAGAGTCTACATGGCCACAGTCCCCACAG 1490
Query 1692 CCAGGGCCGGCCGCTGCTTCCTGTAGGCAGGGGCTCCTCTGCCAGGTCCGCCGACTGCAGCGTGCCCAGCCCAG 1765
||||.||.||||.|||||.||||.|||..|||| |||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1491 CCAGAGCAGGCCACTGCTCCCTGGAGGGCGGGG---CTCAGCCAGGTCTGCTGACTGCAGTGTGCCCAGCCCAG 1561
Query 1766 CCCTCGACAAGACCTCGGCAACCACATCGCGTTCCTCAACACCTGCTTCTGTGACAGCTATCGACACCAACGGA 1839
||||.|||||||||||.||.|||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||..|||||||.
Sbjct 1562 CCCTGGACAAGACCTCAGCTACCACCTCACGGTCCTCAACACCTGCCTCTGTGACAGCCATTGATGCCAACGGG 1635
Query 1840 CTC 1842
|||
Sbjct 1636 CTC 1638