Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_11428
Subject:
NM_001357770.1
Aligned Length:
907
Identities:
564
Gaps:
318

Alignment

Query   1  MSGRTLTDRIAAAQYSVTGSAVARAVCKATTHEVMGPKKKHLDYLIQATNETNVNIPQMADTLFERATNSSWVV  74
           |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  MSGQTLTDRIAAAQYSVTGSAVARAVCKATTHEVMGPKKKHLDYLIQATNETNVNIPQMADTLFERATNSSWVV  74

Query  75  VFKALVTTHHLMVHGNERFIQYLASRNTLFNLSNFLDKSGSHGYDMSTFIRRYSRYLNEKAFSYRQMAFDFARV  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  VFKALVTTHHLMVHGNERFIQYLASRNTLFNLSNFLDKSGSHGYDMSTFIRRYSRYLNEKAFSYRQMAFDFARV  148

Query 149  KKGADGVMRTMAPEKLLKSMPILQGQIDALLEFDVHPNELTNGVINAAFMLLFKDLIKLFACYNDGVINLLEKF  222
           |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  KKGADGVMRTMVPEKLLKSMPILQGQIDALLEFDVHPNELTNGVINAAFMLLFKDLIKLFACYNDGVINLLEKF  222

Query 223  FEMKKGQCKDALEIYKRFLTRMTRVSEFLKVAE--------------APSSLMETLEQHLNTLEGKKPGNK--S  280
           |||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||.  |
Sbjct 223  FEMKKGQCKDALEIYKRFLTRMTRVSEFLKVAEQVGIDKGDIPDLTQAPSSLMETLEQHLNTLEGKKPGNNEGS  296

Query 281  GAPSPLSKSSPATTVTSPNSTPAKTIDTSPPVDLFATASAAVPVSTSKPSSDLLDLQPDFSSGGAAAAAAPAPP  354
           |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||..||||||||||||| ||.||.||||. .
Sbjct 297  GAPSPLSKSSPATTVTSPNSTPAKTIDTSPPVDIFATASAAAPVSSAKPSSDLLDLQPDF-SGAAAGAAAPV-V  368

Query 355  PPAGGATAWG----------------------------------------------------------------  364
           ||.|||||||                                                                
Sbjct 369  PPSGGATAWGDLLGEDSLAALSSVPCEAPISDPFAPEPSPPTTTTEPASASASTTTAVTAVTTEVDLFGDAFAA  442

Query 365  --------------------------------------------------------------------------  364
                                                                                     
Sbjct 443  SPGEAPAASEGATAPATPAPVAAALDACSGNDPFAPSEGSAEAAPELDLFAMKPPETSAPVVTPTASTAPPVPA  516

Query 365  --------------------------------------------------------------------------  364
                                                                                     
Sbjct 517  TAPSPAPTAVAATAATTTAAAAATTTATTSAAAATTAAAPPALDIFGDLFDSAPEVAAAPKPDAAPSIDLFGTD  590

Query 365  --------------------------------------------------------------------------  364
                                                                                     
Sbjct 591  AFSSPPRGASPVPESSLTADLLSVDAFAAPSPASTASPAKAESSGVIDLFGDAFGSGASETQPAPQAVSSSSAS  664

Query 365  -----GFGGSFMAPSPSPVTPAQNNLLQPNFEAAFGTTPSTSSSSSFDPSVFDGLGDLLMPTMAPAGQPAPVSM  433
                ||||||||||..||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 665  ADLLAGFGGSFMAPSTTPVTPAQNNLLQPSFEAAFGTTPSTSSSSSFDPSVFDGLGDLLMPTMAPSGQPAPVSM  738

Query 434  VPPSPAMAASKALGSDLDSSLASLVGNLGISGTTTKKGDLQWNAGEKKLTGGANWQPKVAPATWSAGVPPSAPL  507
           |||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||    
Sbjct 739  VPPSPAMAASKGLGSDLDSSLASLVGNLGISGTTSKKGDLQWNAGEKKLTGGANWQPKVTPATWSAGVPP----  808

Query 508  QGAVPPTSSVPPVAGAPSVGQPGAGFGMPPAGTGMPMMPQQPVMFAQPMMRPPFGAAAVPGTQLSPSPTPASQS  581
           ||.|||||||||.|||||||||||||||||.||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 809  QGTVPPTSSVPPGAGAPSVGQPGAGFGMPPSGTGMTMMSQQPVMFAQPMMRPPFGAAAVPGTQLSPSPTPATQS  882

Query 582  PKKPPAKDPLADLN-----  595
           ||||||||||||||     
Sbjct 883  PKKPPAKDPLADLNIKDFL  901