Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11428
• Subject: XM_006510903.4
• Aligned Length: 1851
• Identities: 1585
• Gaps: 87

Alignment

Query    1  ATGTCGGGACGAACGCTCACGGATCGGATCGCCGCCGCTCAGTACAGCGTTACAGGCTCTGCTGTAGCAAGAGC  74
            ||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCGGGCCAAACGCTCACGGATCGGATCGCCGCCGCTCAGTACAGCGTGACTGGCTCTGCTGTAGCAAGAGC  74

Query   75  GGTCTGCAAAGCCACTACTCATGAAGTAATGGGCCCCAAGAAAAAGCACCTGGACTATTTGATCCAGGCTACCA  148
            .||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGTCTGCAAAGCCACCACTCATGAGGTGATGGGCCCCAAGAAGAAGCACCTGGACTATTTGATCCAGGCTACCA  148

Query  149  ACGAGACCAATGTTAATATTCCTCAGATGGCCGACACTCTCTTTGAGCGGGCAACAAACAGTAGCTGGGTGGTT  222
            |.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  149  ATGAGACCAATGTCAATATCCCTCAGATGGCCGACACCCTCTTTGAGCGGGCGACAAACAGTAGCTGGGTGGTG  222

Query  223  GTGTTTAAGGCTTTAGTGACAACACATCATCTCATGGTGCATGGAAATGAGAGATTTATTCAATATTTGGCTTC  296
            ||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct  223  GTATTTAAAGCTTTAGTGACCACACACCATCTCATGGTGCATGGAAATGAGAGATTTATTCAGTATTTGGCCTC  296

Query  297  TAGAAATACACTATTCAATCTCAGCAATTTTTTGGACAAAAGTGGATCCCATGGTTATGATATGTCTACCTTCA  370
            |||.|||||.|||||||||||||||||.|||.|.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct  297  TAGGAATACGCTATTCAATCTCAGCAACTTTCTAGATAAAAGTGGATCCCACGGTTATGATATGTCTACGTTCA  370

Query  371  TAAGGCGCTATAGTAGATATTTGAATGAAAAGGCTTTTTCTTACAGACAGATGGCCTTTGATTTTGCCAGGGTG  444
            ||.||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||
Sbjct  371  TACGGCGTTACAGTAGATACTTGAATGAAAAGGCTTTCTCCTACAGACAGATGGCATTTGACTTTGCCAGAGTG  444

Query  445  AAGAAAGGGGCCGATGGTGTAATGAGGACAATGGCTCCCGAAAAGCTGCTAAAGAGTATGCCAATACTACAGGG  518
            |||||||||||.||.|||||.||||||||.||||.|||.||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  445  AAGAAAGGGGCTGACGGTGTCATGAGGACGATGGTTCCTGAAAAGCTCCTGAAGAGTATGCCAATCCTGCAGGG  518

Query  519  ACAAATTGATGCACTGCTTGAATTTGATGTGCATCCAAATGAACTAACAAATGGTGTCATAAATGCAGCATTTA  592
            .||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  519  GCAGATCGATGCACTGCTGGAGTTTGATGTGCATCCAAATGAACTAACCAATGGTGTCATAAATGCTGCATTTA  592

Query  593  TGCTTCTTTTCAAAGATCTTATCAAACTTTTTGCTTGCTACAATGATGGTGTTATTAACTTACTCGAAAAGTTT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||
Sbjct  593  TGCTTCTTTTCAAAGATCTTATCAAACTGTTTGCTTGCTACAATGACGGCGTCATTAACTTACTTGAAAAATTT  666

Query  667  TTTGAAATGAAGAAAGGACAATGTAAAGATGCTCTAGAAATTTACAAACGATTTCTAACTAGAATGACACGAGT  740
            ||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||..|.||
Sbjct  667  TTCGAGATGAAGAAAGGTCAATGCAAAGACGCGCTAGAAATTTACAAGCGATTTCTAACTAGAATGACGAGGGT  740

Query  741  GTCTGAATTTCTCAAGGTTG------------------------------------------CAGAGGCTCCCA  772
            |||||||||.||||||||.|                                          ||.|||||||||
Sbjct  741  GTCTGAATTCCTCAAGGTCGCCGAGCAAGTTGGTATTGATAAAGGTGACATTCCCGACCTCACACAGGCTCCCA  814

Query  773  GCAGTCTTATGGAGACGCTTGAACAGCATCTAAATACATTAGAAGGAAAGAAACCTGGAAACAA------ATCT  840
            ||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||..|||||||||||||||||||||||||      ||||
Sbjct  815  GCAGTCTTATGGAGACCCTTGAACAACATCTAAATACCCTAGAAGGAAAGAAACCTGGAAACAATGAAGGATCT  888

Query  841  GGTGCTCCCTCTCCATTAAGTAAGTCTTCTCCAGCCACAACTGTTACGTCTCCTAATTCTACACCAGCTAAAAC  914
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGTGCTCCCTCTCCACTAAGTAAGTCTTCTCCAGCCACAACTGTTACATCTCCTAATTCTACACCAGCTAAAAC  962

Query  915  TATTGACACATCCCCACCGGTTGATTTATTTGCAACTGCATCTGCGGCTGTCCCAGTCAGCACTTCTAAACCAT  988
            |||.|||||||||||.||.|||||..||||||||||.|||||.|||||||.||||||||||.||.||||.||||
Sbjct  963  TATCGACACATCCCCGCCAGTTGACATATTTGCAACAGCATCCGCGGCTGCCCCAGTCAGCTCTGCTAAGCCAT  1036

Query  989  CTAGTGATCTCCTGGACCTCCAGCCAGACTTTTCCTCTGGAGGGGCAGCAGCAGCCGCAGCACCAGCACC---A  1059
            |.||.||||||||.||.||.|||||.|||||   ||||||      ||||||.||.|..|||.|||||||   |
Sbjct 1037  CAAGCGATCTCCTTGATCTTCAGCCCGACTT---CTCTGG------AGCAGCTGCGGGGGCAGCAGCACCTGTA  1101

Query 1060  CCACCACCTGCTGGAGGAGCCACTGCATGGGGAGGATTTGGGGGTTCTTTCATGGCGCCTTCCCCATCTCCAGT  1133
            ...||.|||.||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||..||.|.|||||
Sbjct 1102  GTGCCTCCTTCTGGGGGTGCGACCGCCTGGGGAGGATTTGGGGGTTCTTTCATGGCCCCTTCTACAACGCCAGT  1175

Query 1134  GACTCCAGCTCAGAATAACCTGCTACAGCCCAATTTTGAGGCAGCTTTTGGGACAACGCCTTCAACTTCCAGCA  1207
            ||||||||||||||||||||||||.||.||||.|||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||
Sbjct 1176  GACTCCAGCTCAGAATAACCTGCTGCAACCCAGTTTCGAGGCAGCTTTTGGAACGACGCCTTCGACTTCAAGCA  1249

Query 1208  GCAGCTCCTTTGATCCATCAGTGTTTGATGGTCTAGGTGATCTTTTGATGCCAACCATGGCACCAGCTGGGCAG  1281
            |||||||.|||||.||||||||||||||||||.||||.||||||.||||||||||||||||||||.|.||||||
Sbjct 1250  GCAGCTCTTTTGACCCATCAGTGTTTGATGGTTTAGGCGATCTTCTGATGCCAACCATGGCACCATCCGGGCAG  1323

Query 1282  CCTGCACCTGTCTCAATGGTACCACCCAGTCCTGCAATGGCAGCCAGCAAAGCCCTTGGAAGTGATCTTGATTC  1355
            |||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||.|||||.||
Sbjct 1324  CCTGCCCCTGTCTCAATGGTCCCACCCAGTCCTGCAATGGCAGCCAGCAAAGGCCTCGGAAGTGACCTTGACTC  1397

Query 1356  ATCTCTTGCCAGCTTAGTAGGCAATCTTGGAATTTCTGGTACCACAACAAAAAAGGGAGATCTTCAGTGGAATG  1429
            .|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1398  GTCTCTGGCCAGTTTAGTAGGCAATCTTGGGATTTCTGGTACCACATCAAAAAAGGGAGATCTCCAGTGGAATG  1471

Query 1430  CTGGAGAGAAAAAGTTGACTGGTGGAGCCAACTGGCAGCCTAAAGTAGCTCCAGCAACCTGGTCAGCAGGCGTT  1503
            ||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||.||.|||||..|||||||.||.||||||||.||.|||
Sbjct 1472  CTGGGGAGAAAAAGCTGACTGGTGGAGCCAACTGGCAACCGAAAGTCACTCCAGCCACATGGTCAGCGGGTGTT  1545

Query 1504  CCACCAAGTGCACCTTTGCAAGGAGCTGTACCTCCAACCAGTTCAGTTCCTCCTGTTGCCGGGGCCCCATCGGT  1577
            ||.||            ||||||..||||.||.||||||||.|||||.|||||.|.||||||||||||.||.||
Sbjct 1546  CCCCC------------GCAAGGCACTGTTCCACCAACCAGCTCAGTCCCTCCGGGTGCCGGGGCCCCGTCCGT  1607

Query 1578  TGGACAACCTGGAGCAGGATTTGGAATGCCTCCTGCTGGGACAGGCATGCCCATGATGCCTCAGCAGCCGGTCA  1651
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||.||||||||.||||||||||.||||
Sbjct 1608  TGGGCAACCTGGAGCAGGATTTGGAATGCCTCCTTCAGGGACAGGCATGACCATGATGTCTCAGCAGCCAGTCA  1681

Query 1652  TGTTTGCACAGCCCATGATGAGGCCCCCCTTTGGAGCTGCCGCTGTACCTGGCACGCAGCTTTCTCCAAGCCCT  1725
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1682  TGTTTGCACAGCCCATGATGAGGCCACCCTTTGGAGCTGCAGCTGTGCCCGGCACACAGCTTTCTCCAAGCCCT  1755

Query 1726  ACACCTGCCAGTCAGAGTCCCAAGAAACCTCCAGCAAAGGACCCATTAGCGGATCTTAAC--------------  1785
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||              
Sbjct 1756  ACACCTGCCACTCAGAGTCCCAAGAAACCTCCAGCCAAGGACCCGTTAGCGGATCTTAACATCAAGGATTTCTT  1829

Query 1786  -  1785
             
Sbjct 1830  G  1830