Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_11428
- Subject:
- XM_006510904.4
- Aligned Length:
- 1845
- Identities:
- 1585
- Gaps:
- 81
Alignment
Query 1 ATGTCGGGACGAACGCTCACGGATCGGATCGCCGCCGCTCAGTACAGCGTTACAGGCTCTGCTGTAGCAAGAGC 74
||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCGGGCCAAACGCTCACGGATCGGATCGCCGCCGCTCAGTACAGCGTGACTGGCTCTGCTGTAGCAAGAGC 74
Query 75 GGTCTGCAAAGCCACTACTCATGAAGTAATGGGCCCCAAGAAAAAGCACCTGGACTATTTGATCCAGGCTACCA 148
.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGTCTGCAAAGCCACCACTCATGAGGTGATGGGCCCCAAGAAGAAGCACCTGGACTATTTGATCCAGGCTACCA 148
Query 149 ACGAGACCAATGTTAATATTCCTCAGATGGCCGACACTCTCTTTGAGCGGGCAACAAACAGTAGCTGGGTGGTT 222
|.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 149 ATGAGACCAATGTCAATATCCCTCAGATGGCCGACACCCTCTTTGAGCGGGCGACAAACAGTAGCTGGGTGGTG 222
Query 223 GTGTTTAAGGCTTTAGTGACAACACATCATCTCATGGTGCATGGAAATGAGAGATTTATTCAATATTTGGCTTC 296
||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 223 GTATTTAAAGCTTTAGTGACCACACACCATCTCATGGTGCATGGAAATGAGAGATTTATTCAGTATTTGGCCTC 296
Query 297 TAGAAATACACTATTCAATCTCAGCAATTTTTTGGACAAAAGTGGATCCCATGGTTATGATATGTCTACCTTCA 370
|||.|||||.|||||||||||||||||.|||.|.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 297 TAGGAATACGCTATTCAATCTCAGCAACTTTCTAGATAAAAGTGGATCCCACGGTTATGATATGTCTACGTTCA 370
Query 371 TAAGGCGCTATAGTAGATATTTGAATGAAAAGGCTTTTTCTTACAGACAGATGGCCTTTGATTTTGCCAGGGTG 444
||.||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||
Sbjct 371 TACGGCGTTACAGTAGATACTTGAATGAAAAGGCTTTCTCCTACAGACAGATGGCATTTGACTTTGCCAGAGTG 444
Query 445 AAGAAAGGGGCCGATGGTGTAATGAGGACAATGGCTCCCGAAAAGCTGCTAAAGAGTATGCCAATACTACAGGG 518
|||||||||||.||.|||||.||||||||.||||.|||.||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 445 AAGAAAGGGGCTGACGGTGTCATGAGGACGATGGTTCCTGAAAAGCTCCTGAAGAGTATGCCAATCCTGCAGGG 518
Query 519 ACAAATTGATGCACTGCTTGAATTTGATGTGCATCCAAATGAACTAACAAATGGTGTCATAAATGCAGCATTTA 592
.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 519 GCAGATCGATGCACTGCTGGAGTTTGATGTGCATCCAAATGAACTAACCAATGGTGTCATAAATGCTGCATTTA 592
Query 593 TGCTTCTTTTCAAAGATCTTATCAAACTTTTTGCTTGCTACAATGATGGTGTTATTAACTTACTCGAAAAGTTT 666
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||
Sbjct 593 TGCTTCTTTTCAAAGATCTTATCAAACTGTTTGCTTGCTACAATGACGGCGTCATTAACTTACTTGAAAAATTT 666
Query 667 TTTGAAATGAAGAAAGGACAATGTAAAGATGCTCTAGAAATTTACAAACGATTTCTAACTAGAATGACACGAGT 740
||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||..|.||
Sbjct 667 TTCGAGATGAAGAAAGGTCAATGCAAAGACGCGCTAGAAATTTACAAGCGATTTCTAACTAGAATGACGAGGGT 740
Query 741 GTCTGAATTTCTCAAGGTTG------------------------------------------CAGAGGCTCCCA 772
|||||||||.||||||||.| ||.|||||||||
Sbjct 741 GTCTGAATTCCTCAAGGTCGCCGAGCAAGTTGGTATTGATAAAGGTGACATTCCCGACCTCACACAGGCTCCCA 814
Query 773 GCAGTCTTATGGAGACGCTTGAACAGCATCTAAATACATTAGAAGGAAAGAAACCTGGAAACAAATCTGGTGCT 846
||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GCAGTCTTATGGAGACCCTTGAACAACATCTAAATACCCTAGAAGGAAAGAAACCTGGAAACAAATCTGGTGCT 888
Query 847 CCCTCTCCATTAAGTAAGTCTTCTCCAGCCACAACTGTTACGTCTCCTAATTCTACACCAGCTAAAACTATTGA 920
|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 889 CCCTCTCCACTAAGTAAGTCTTCTCCAGCCACAACTGTTACATCTCCTAATTCTACACCAGCTAAAACTATCGA 962
Query 921 CACATCCCCACCGGTTGATTTATTTGCAACTGCATCTGCGGCTGTCCCAGTCAGCACTTCTAAACCATCTAGTG 994
|||||||||.||.|||||..||||||||||.|||||.|||||||.||||||||||.||.||||.|||||.||.|
Sbjct 963 CACATCCCCGCCAGTTGACATATTTGCAACAGCATCCGCGGCTGCCCCAGTCAGCTCTGCTAAGCCATCAAGCG 1036
Query 995 ATCTCCTGGACCTCCAGCCAGACTTTTCCTCTGGAGGGGCAGCAGCAGCCGCAGCACCAGCACC---ACCACCA 1065
|||||||.||.||.|||||.||||| |||||| ||||||.||.|..|||.||||||| |...||.
Sbjct 1037 ATCTCCTTGATCTTCAGCCCGACTT---CTCTGG------AGCAGCTGCGGGGGCAGCAGCACCTGTAGTGCCT 1101
Query 1066 CCTGCTGGAGGAGCCACTGCATGGGGAGGATTTGGGGGTTCTTTCATGGCGCCTTCCCCATCTCCAGTGACTCC 1139
|||.||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||..||.|.|||||||||||
Sbjct 1102 CCTTCTGGGGGTGCGACCGCCTGGGGAGGATTTGGGGGTTCTTTCATGGCCCCTTCTACAACGCCAGTGACTCC 1175
Query 1140 AGCTCAGAATAACCTGCTACAGCCCAATTTTGAGGCAGCTTTTGGGACAACGCCTTCAACTTCCAGCAGCAGCT 1213
||||||||||||||||||.||.||||.|||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1176 AGCTCAGAATAACCTGCTGCAACCCAGTTTCGAGGCAGCTTTTGGAACGACGCCTTCGACTTCAAGCAGCAGCT 1249
Query 1214 CCTTTGATCCATCAGTGTTTGATGGTCTAGGTGATCTTTTGATGCCAACCATGGCACCAGCTGGGCAGCCTGCA 1287
|.|||||.||||||||||||||||||.||||.||||||.||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.
Sbjct 1250 CTTTTGACCCATCAGTGTTTGATGGTTTAGGCGATCTTCTGATGCCAACCATGGCACCATCCGGGCAGCCTGCC 1323
Query 1288 CCTGTCTCAATGGTACCACCCAGTCCTGCAATGGCAGCCAGCAAAGCCCTTGGAAGTGATCTTGATTCATCTCT 1361
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||.|||||.||.|||||
Sbjct 1324 CCTGTCTCAATGGTCCCACCCAGTCCTGCAATGGCAGCCAGCAAAGGCCTCGGAAGTGACCTTGACTCGTCTCT 1397
Query 1362 TGCCAGCTTAGTAGGCAATCTTGGAATTTCTGGTACCACAACAAAAAAGGGAGATCTTCAGTGGAATGCTGGAG 1435
.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1398 GGCCAGTTTAGTAGGCAATCTTGGGATTTCTGGTACCACATCAAAAAAGGGAGATCTCCAGTGGAATGCTGGGG 1471
Query 1436 AGAAAAAGTTGACTGGTGGAGCCAACTGGCAGCCTAAAGTAGCTCCAGCAACCTGGTCAGCAGGCGTTCCACCA 1509
||||||||.||||||||||||||||||||||.||.|||||..|||||||.||.||||||||.||.|||||.||
Sbjct 1472 AGAAAAAGCTGACTGGTGGAGCCAACTGGCAACCGAAAGTCACTCCAGCCACATGGTCAGCGGGTGTTCCCCC- 1544
Query 1510 AGTGCACCTTTGCAAGGAGCTGTACCTCCAACCAGTTCAGTTCCTCCTGTTGCCGGGGCCCCATCGGTTGGACA 1583
||||||..||||.||.||||||||.|||||.|||||.|.||||||||||||.||.|||||.||
Sbjct 1545 -----------GCAAGGCACTGTTCCACCAACCAGCTCAGTCCCTCCGGGTGCCGGGGCCCCGTCCGTTGGGCA 1607
Query 1584 ACCTGGAGCAGGATTTGGAATGCCTCCTGCTGGGACAGGCATGCCCATGATGCCTCAGCAGCCGGTCATGTTTG 1657
||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||.||||||||.||||||||||.||||||||||
Sbjct 1608 ACCTGGAGCAGGATTTGGAATGCCTCCTTCAGGGACAGGCATGACCATGATGTCTCAGCAGCCAGTCATGTTTG 1681
Query 1658 CACAGCCCATGATGAGGCCCCCCTTTGGAGCTGCCGCTGTACCTGGCACGCAGCTTTCTCCAAGCCCTACACCT 1731
|||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1682 CACAGCCCATGATGAGGCCACCCTTTGGAGCTGCAGCTGTGCCCGGCACACAGCTTTCTCCAAGCCCTACACCT 1755
Query 1732 GCCAGTCAGAGTCCCAAGAAACCTCCAGCAAAGGACCCATTAGCGGATCTTAAC--------------- 1785
||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1756 GCCACTCAGAGTCCCAAGAAACCTCCAGCCAAGGACCCGTTAGCGGATCTTAACATCAAGGATTTCTTG 1824