Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11428
• Subject: XM_030244156.1
• Aligned Length: 2697
• Identities: 1602
• Gaps: 927

Alignment

Query    1  ATGTCGGGACGAACGCTCACGGATCGGATCGCCGCCGCTCAGTACAGCGTTACAGGCTCTGCTGTAGCAAGAGC  74
            ||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCGGGCCAAACGCTCACGGATCGGATCGCCGCCGCTCAGTACAGCGTGACTGGCTCTGCTGTAGCAAGAGC  74

Query   75  GGTCTGCAAAGCCACTACTCATGAAGTAATGGGCCCCAAGAAAAAGCACCTGGACTATTTGATCCAGGCTACCA  148
            .||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGTCTGCAAAGCCACCACTCATGAGGTGATGGGCCCCAAGAAGAAGCACCTGGACTATTTGATCCAGGCTACCA  148

Query  149  ACGAGACCAATGTTAATATTCCTCAGATGGCCGACACTCTCTTTGAGCGGGCAACAAACAGTAGCTGGGTGGTT  222
            |.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  149  ATGAGACCAATGTCAATATCCCTCAGATGGCCGACACCCTCTTTGAGCGGGCGACAAACAGTAGCTGGGTGGTG  222

Query  223  GTGTTTAAGGCTTTAGTGACAACACATCATCTCATGGTGCATGGAAATGAGAGATTTATTCAATATTTGGCTTC  296
            ||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct  223  GTATTTAAAGCTTTAGTGACCACACACCATCTCATGGTGCATGGAAATGAGAGATTTATTCAGTATTTGGCCTC  296

Query  297  TAGAAATACACTATTCAATCTCAGCAATTTTTTGGACAAAAGTGGATCCCATGGTTATGATATGTCTACCTTCA  370
            |||.|||||.|||||||||||||||||.|||.|.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct  297  TAGGAATACGCTATTCAATCTCAGCAACTTTCTAGATAAAAGTGGATCCCACGGTTATGATATGTCTACGTTCA  370

Query  371  TAAGGCGCTATAGTAGATATTTGAATGAAAAGGCTTTTTCTTACAGACAGATGGCCTTTGATTTTGCCAGGGTG  444
            ||.||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||
Sbjct  371  TACGGCGTTACAGTAGATACTTGAATGAAAAGGCTTTCTCCTACAGACAGATGGCATTTGACTTTGCCAGAGTG  444

Query  445  AAGAAAGGGGCCGATGGTGTAATGAGGACAATGGCTCCCGAAAAGCTGCTAAAGAGTATGCCAATACTACAGGG  518
            |||||||||||.||.|||||.||||||||.||||.|||.||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  445  AAGAAAGGGGCTGACGGTGTCATGAGGACGATGGTTCCTGAAAAGCTCCTGAAGAGTATGCCAATCCTGCAGGG  518

Query  519  ACAAATTGATGCACTGCTTGAATTTGATGTGCATCCAAATGAACTAACAAATGGTGTCATAAATGCAGCATTTA  592
            .||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  519  GCAGATCGATGCACTGCTGGAGTTTGATGTGCATCCAAATGAACTAACCAATGGTGTCATAAATGCTGCATTTA  592

Query  593  TGCTTCTTTTCAAAGATCTTATCAAACTTTTTGCTTGCTACAATGATGGTGTTATTAACTTACTCGAAAAGTTT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||
Sbjct  593  TGCTTCTTTTCAAAGATCTTATCAAACTGTTTGCTTGCTACAATGACGGCGTCATTAACTTACTTGAAAAATTT  666

Query  667  TTTGAAATGAAGAAAGGACAATGTAAAGATGCTCTAGAAATTTACAAACGATTTCTAACTAGAATGACACGAGT  740
            ||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||..|.||
Sbjct  667  TTCGAGATGAAGAAAGGTCAATGCAAAGACGCGCTAGAAATTTACAAGCGATTTCTAACTAGAATGACGAGGGT  740

Query  741  GTCTGAATTTCTCAAGGTTG------------------------------------------CAGAGGCTCCCA  772
            |||||||||.||||||||.|                                          ||.|||||||||
Sbjct  741  GTCTGAATTCCTCAAGGTCGCCGAGCAAGTTGGTATTGATAAAGGTGACATTCCCGACCTCACACAGGCTCCCA  814

Query  773  GCAGTCTTATGGAGACGCTTGAACAGCATCTAAATACATTAGAAGGAAAGAAACCTGGAAACAAATCTGGTGCT  846
            ||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCAGTCTTATGGAGACCCTTGAACAACATCTAAATACCCTAGAAGGAAAGAAACCTGGAAACAAATCTGGTGCT  888

Query  847  CCCTCTCCATTAAGTAAGTCTTCTCCAGCCACAACTGTTACGTCTCCTAATTCTACACCAGCTAAAACTATTGA  920
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  889  CCCTCTCCACTAAGTAAGTCTTCTCCAGCCACAACTGTTACATCTCCTAATTCTACACCAGCTAAAACTATCGA  962

Query  921  CACATCCCCACCGGTTGATTTATTTGCAACTGCATCTGCGGCTGTCCCAGTCAGCACTTCTAAACCATCTAGTG  994
            |||||||||.||.|||||..||||||||||.|||||.|||||||.||||||||||.||.||||.|||||.||.|
Sbjct  963  CACATCCCCGCCAGTTGACATATTTGCAACAGCATCCGCGGCTGCCCCAGTCAGCTCTGCTAAGCCATCAAGCG  1036

Query  995  ATCTCCTGGACCTCCAGCCAGACTTTTCCTCTGGA---------GGGGCAGCAGCA------------------  1041
            |||||||.||.||.|||||.|||||   |||||||         ||||||||||||                  
Sbjct 1037  ATCTCCTTGATCTTCAGCCCGACTT---CTCTGGAGCAGCTGCGGGGGCAGCAGCACCTGTAGTGCCTCCTTCT  1107

Query 1042  ------------------------------GCCGCA--------------------------------------  1047
                                          ||.|||                                      
Sbjct 1108  GGGGGTGCGACCGCCTGGGGAGATTCCTTGGCTGCACTTTCCTCTGTTCCCTGTGAAGCACCGATTTCAGACCC  1181

Query 1048  ----GCACCAG----------------------------------------------------CACCAC-----  1060
                |||||||                                                    ||||||     
Sbjct 1182  ATTTGCACCAGAGCCTTCCCCTCCTACTACAACCACTGAGCCTGCTTCAGCCTCTGCCTCGACCACCACAGCTG  1255

Query 1061  --------------------------------------------------------------------------  1060
                                                                                      
Sbjct 1256  TGACGGCTGTCACTACGGAAGTGGATCTCTTTGGAGATGCCTTTGCAGCTTCTCCTGGGGAGGCCCCTGCAGCA  1329

Query 1061  ----------------CACCACCT--------------------------------------------------  1068
                            |||||.||                                                  
Sbjct 1330  TCCGAAGGGGCTACCGCACCAGCTACCCCGGCCCCAGTGGCTGCAGCTCTTGATGCATGCTCAGGAAATGACCC  1403

Query 1069  ---------------------------------------GCTGGA-----------------------------  1074
                                                   ||||||                             
Sbjct 1404  TTTTGCCCCATCTGAAGGTAGCGCAGAGGCTGCACCTGAGCTGGACCTCTTTGCAATGAAGCCACCTGAGACCA  1477

Query 1075  --------------------------------------------------------------------------  1074
                                                                                      
Sbjct 1478  GCGCTCCTGTAGTTACCCCTACAGCTAGCACAGCCCCTCCAGTTCCCGCAACTGCTCCTTCTCCTGCTCCCACG  1551

Query 1075  ------GGAGCCACTGC---------------------------------------------------------  1085
                  |.|||||||||                                                         
Sbjct 1552  GCTGTGGCAGCCACTGCTGCCACCACCACCGCCGCCGCTGCAGCTACCACCACTGCCACCACCTCTGCTGCTGC  1625

Query 1086  --------------------------------------------------------------------------  1085
                                                                                      
Sbjct 1626  TGCCACCACCGCCGCTGCTCCTCCTGCTCTAGATATCTTTGGTGATTTGTTTGATTCTGCTCCTGAAGTTGCTG  1699

Query 1086  --------------------------------------------------------------------------  1085
                                                                                      
Sbjct 1700  CAGCACCTAAGCCAGACGCGGCTCCTAGCATAGACCTGTTTGGCACAGATGCTTTCTCCTCCCCGCCACGAGGG  1773

Query 1086  --------------------------------------------------------------------------  1085
                                                                                      
Sbjct 1774  GCCTCTCCGGTGCCTGAGAGTTCTCTCACTGCTGACCTCTTATCTGTGGACGCATTTGCAGCGCCGTCTCCTGC  1847

Query 1086  --------------------------------------------------ATGGGGA-----------------  1092
                                                              .||||||                 
Sbjct 1848  ATCCACTGCCTCTCCTGCAAAGGCGGAGTCCTCGGGTGTCATAGACCTTTTTGGGGATGCGTTTGGAAGTGGTG  1921

Query 1093  -----------------------------------------------------------------GGATTTGGG  1101
                                                                             |||||||||
Sbjct 1922  CTTCTGAAACCCAGCCAGCACCACAGGCTGTTTCTAGTTCATCAGCATCGGCAGATCTACTAGCTGGATTTGGG  1995

Query 1102  GGTTCTTTCATGGCGCCTTCCCCATCTCCAGTGACTCCAGCTCAGAATAACCTGCTACAGCCCAATTTTGAGGC  1175
            ||||||||||||||.|||||..||.|.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||.|||.|||||
Sbjct 1996  GGTTCTTTCATGGCCCCTTCTACAACGCCAGTGACTCCAGCTCAGAATAACCTGCTGCAACCCAGTTTCGAGGC  2069

Query 1176  AGCTTTTGGGACAACGCCTTCAACTTCCAGCAGCAGCTCCTTTGATCCATCAGTGTTTGATGGTCTAGGTGATC  1249
            |||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||.||||.||||
Sbjct 2070  AGCTTTTGGAACGACGCCTTCGACTTCAAGCAGCAGCTCTTTTGACCCATCAGTGTTTGATGGTTTAGGCGATC  2143

Query 1250  TTTTGATGCCAACCATGGCACCAGCTGGGCAGCCTGCACCTGTCTCAATGGTACCACCCAGTCCTGCAATGGCA  1323
            ||.||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 2144  TTCTGATGCCAACCATGGCACCATCCGGGCAGCCTGCCCCTGTCTCAATGGTCCCACCCAGTCCTGCAATGGCA  2217

Query 1324  GCCAGCAAAGCCCTTGGAAGTGATCTTGATTCATCTCTTGCCAGCTTAGTAGGCAATCTTGGAATTTCTGGTAC  1397
            ||||||||||.|||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 2218  GCCAGCAAAGGCCTCGGAAGTGACCTTGACTCGTCTCTGGCCAGTTTAGTAGGCAATCTTGGGATTTCTGGTAC  2291

Query 1398  CACAACAAAAAAGGGAGATCTTCAGTGGAATGCTGGAGAGAAAAAGTTGACTGGTGGAGCCAACTGGCAGCCTA  1471
            ||||.||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 2292  CACATCAAAAAAGGGAGATCTCCAGTGGAATGCTGGGGAGAAAAAGCTGACTGGTGGAGCCAACTGGCAACCGA  2365

Query 1472  AAGTAGCTCCAGCAACCTGGTCAGCAGGCGTTCCACCAAGTGCACCTTTGCAAGGAGCTGTACCTCCAACCAGT  1545
            ||||..|||||||.||.||||||||.||.|||||.||            ||||||..||||.||.||||||||.
Sbjct 2366  AAGTCACTCCAGCCACATGGTCAGCGGGTGTTCCCCC------------GCAAGGCACTGTTCCACCAACCAGC  2427

Query 1546  TCAGTTCCTCCTGTTGCCGGGGCCCCATCGGTTGGACAACCTGGAGCAGGATTTGGAATGCCTCCTGCTGGGAC  1619
            |||||.|||||.|.||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||
Sbjct 2428  TCAGTCCCTCCGGGTGCCGGGGCCCCGTCCGTTGGGCAACCTGGAGCAGGATTTGGAATGCCTCCTTCAGGGAC  2501

Query 1620  AGGCATGCCCATGATGCCTCAGCAGCCGGTCATGTTTGCACAGCCCATGATGAGGCCCCCCTTTGGAGCTGCCG  1693
            |||||||.||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 2502  AGGCATGACCATGATGTCTCAGCAGCCAGTCATGTTTGCACAGCCCATGATGAGGCCACCCTTTGGAGCTGCAG  2575

Query 1694  CTGTACCTGGCACGCAGCTTTCTCCAAGCCCTACACCTGCCAGTCAGAGTCCCAAGAAACCTCCAGCAAAGGAC  1767
            ||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 2576  CTGTGCCCGGCACACAGCTTTCTCCAAGCCCTACACCTGCCACTCAGAGTCCCAAGAAACCTCCAGCCAAGGAC  2649

Query 1768  CCATTAGCGGATCTTAAC---------------  1785
            ||.|||||||||||||||               
Sbjct 2650  CCGTTAGCGGATCTTAACATCAAGGATTTCTTG  2682