Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_11442
Subject:
NM_001163788.3
Aligned Length:
561
Identities:
521
Gaps:
40

Alignment

Query   1  MDASPSPFSLPKKLNELSARRGSDELLSSGIINGPFTMNSSTPST---ANGNDSKKFKRDRPPCSPSRVLHLRK  71
                                                ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  -------------------------------------MNSSTPSTGVYANGNDSKKFKRDRPPCSPSRVLHLRK  37

Query  72  IPCDVTEAEIISLGLPFGKVTNLLMLKGKSQAFLEMASEEAAVTMVNYYTPITPHLRSQPVYIQYSNHRELKTD  145
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  38  IPCDVTEAEIISLGLPFGKVTNLLMLKGKSQAFLEMASEEAAVTMVNYYTPITPHLRSQPVYIQYSNHRELKTD  111

Query 146  NLPNQARAQAALQAVSAVQSGSLALSGGPSNEGTVLPGQSPVLRIIIENLFYPVTLEVLHQIFSKFGTVLKIIT  219
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 112  NLPNQARAQAALQAVSAVQSGSLALSGGPSNEGTVLPGQSPVLRIIIENLFYPVTLEVLHQIFSKFGTVLKIIT  185

Query 220  FTKNNQFQALLQYADPVNAHYAKMALDGQNIYNACCTLRIDFSKLTSLNVKYNNDKSRDFTRLDLPTGDGQPSL  293
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 186  FTKNNQFQALLQYADPVNAHYAKMALDGQNIYNACCTLRIDFSKLTSLNVKYNNDKSRDFTRLDLPTGDGQPSL  259

Query 294  EPPMAAAFGAPGIISSPYAGAAGFAPAIGFPQATGLSVPAVPGALGPLTITSSAVTGRMAIPGASGIPGNSVLL  367
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 260  EPPMAAAFGAPGIISSPYAGAAGFAPAIGFPQATGLSVPAVPGALGPLTITSSAVTGRMAIPGASGIPGNSVLL  333

Query 368  VTNLNPDLITPHGLFILFGVYGDVHRVKIMFNKKENALVQMADANQAQLAMNHLSGQRLYGKVLRATLSKHQAV  441
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 334  VTNLNPDLITPHGLFILFGVYGDVHRVKIMFNKKENALVQMADANQAQLAMNHLSGQRLYGKVLRATLSKHQAV  407

Query 442  QLPREGQEDQGLTKDFSNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSATLHLSNIPPSVTVDDLKNLFIEAGCSVKAFKFFQ  515
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 408  QLPREGQEDQGLTKDFSNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSATLHLSNIPPSVTVDDLKNLFIEAGCSVKAFKFFQ  481

Query 516  KDRKMALIQLGSVEEAIQALIELHNHDLGENHHLRVSFSKSTI  558
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 482  KDRKMALIQLGSVEEAIQALIELHNHDLGENHHLRVSFSKSTI  524