Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_11442
Subject:
NM_001163790.2
Aligned Length:
561
Identities:
541
Gaps:
9

Alignment

Query   1  MDASPSPFSLPKKLNELSARRGSDELLSSGIINGPFTMNSSTPST---ANGNDSKKFKRDRPPCSPSRVLHLRK  71
           ||      .....|......|||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  MD------GVVTDLITVGLKRGSDELLSSGIINGPFTMNSSTPSTGVYANGNDSKKFKRDRPPCSPSRVLHLRK  68

Query  72  IPCDVTEAEIISLGLPFGKVTNLLMLKGKSQAFLEMASEEAAVTMVNYYTPITPHLRSQPVYIQYSNHRELKTD  145
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  69  IPCDVTEAEIISLGLPFGKVTNLLMLKGKSQAFLEMASEEAAVTMVNYYTPITPHLRSQPVYIQYSNHRELKTD  142

Query 146  NLPNQARAQAALQAVSAVQSGSLALSGGPSNEGTVLPGQSPVLRIIIENLFYPVTLEVLHQIFSKFGTVLKIIT  219
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 143  NLPNQARAQAALQAVSAVQSGSLALSGGPSNEGTVLPGQSPVLRIIIENLFYPVTLEVLHQIFSKFGTVLKIIT  216

Query 220  FTKNNQFQALLQYADPVNAHYAKMALDGQNIYNACCTLRIDFSKLTSLNVKYNNDKSRDFTRLDLPTGDGQPSL  293
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 217  FTKNNQFQALLQYADPVNAHYAKMALDGQNIYNACCTLRIDFSKLTSLNVKYNNDKSRDFTRLDLPTGDGQPSL  290

Query 294  EPPMAAAFGAPGIISSPYAGAAGFAPAIGFPQATGLSVPAVPGALGPLTITSSAVTGRMAIPGASGIPGNSVLL  367
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 291  EPPMAAAFGAPGIISSPYAGAAGFAPAIGFPQATGLSVPAVPGALGPLTITSSAVTGRMAIPGASGIPGNSVLL  364

Query 368  VTNLNPDLITPHGLFILFGVYGDVHRVKIMFNKKENALVQMADANQAQLAMNHLSGQRLYGKVLRATLSKHQAV  441
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 365  VTNLNPDLITPHGLFILFGVYGDVHRVKIMFNKKENALVQMADANQAQLAMNHLSGQRLYGKVLRATLSKHQAV  438

Query 442  QLPREGQEDQGLTKDFSNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSATLHLSNIPPSVTVDDLKNLFIEAGCSVKAFKFFQ  515
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 439  QLPREGQEDQGLTKDFSNSPLHRFKKPGSKNFQNIFPPSATLHLSNIPPSVTVDDLKNLFIEAGCSVKAFKFFQ  512

Query 516  KDRKMALIQLGSVEEAIQALIELHNHDLGENHHLRVSFSKSTI  558
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 513  KDRKMALIQLGSVEEAIQALIELHNHDLGENHHLRVSFSKSTI  555