Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11442
• Subject: NM_144904.2
• Aligned Length: 1680
• Identities: 1499
• Gaps: 33

Alignment

Query    1  ATGGACGCTTCCCCCTCACCTTTCTCTCTCCCCAAGAAACTTAATGAATTATCTGCCCGT------CGGGGATC  68
            |||||.|.|           .||.|..|      || |.||||      ||.|.|.|.||      ||||||||
Sbjct    1  ATGGATGGT-----------GTTGTTAC------AG-ATCTTA------TAGCAGTCGGTTTAAAGCGGGGATC  50

Query   69  TGATGAGCTTCTTTCTTCTGGCATCATTAACGGACCTTTTACCATGAATAGTTCTACTCCTTCTACAGCTAATG  142
            ||||||||||||.||||||||..|||||||||||||||.|||||||||.||.||.|   |||||.|||||||||
Sbjct   51  TGATGAGCTTCTGTCTTCTGGTGTCATTAACGGACCTTCTACCATGAACAGCTCGA---CTTCTGCAGCTAATG  121

Query  143  GGAATGACAGCAAGAAATTTAAACGAGATAGACCTCCCTGTTCGCCTTCCCGTGTTCTCCATCTTCGAAAAATT  216
            |||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  122  GGAATGACAACAAGAAATTTAAAGGAGATAGACCTCCCTGTTCGCCTTCCCGTGTTCTCCATCTTCGAAAAATT  195

Query  217  CCATGTGATGTCACCGAAGCAGAGATCATATCATTAGGTCTACCATTTGGCAAAGTAACTAATCTTTTGATGTT  290
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  196  CCATGTGATGTCACCGAAGCAGAGGTCATATCATTAGGTCTACCATTTGGCAAAGTAACTAATCTTTTGATGTT  269

Query  291  GAAAGGAAAAAGCCAGGCTTTCTTAGAAATGGCTTCTGAGGAAGCTGCCGTTACTATGGTGAATTATTACACTC  364
            ||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||.|.|||||||||||||
Sbjct  270  GAAAGGAAAAAGCCAGGCCTTTTTAGAAATGGCTTCTGAAGAAGCTGCTGTTACTATGATAAATTATTACACTC  343

Query  365  CTATTACTCCTCACCTTCGAAGCCAGCCTGTTTATATTCAGTATTCCAATCACAGAGAACTTAAGACTGACAAT  438
            ||.||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  344  CTGTTACTCCTCATCTTCGAAGTCAGCCTGTTTATATCCAGTATTCCAATCACCGAGAACTTAAGACTGACAAT  417

Query  439  CTACCTAATCAAGCTCGAGCCCAAGCTGCACTGCAGGCTGTCAGTGCCGTCCAATCAGGAAGCCTGGCCCTTTC  512
            ||.||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||.|.||.|||||.|
Sbjct  418  CTGCCTAATCAGGCTAGAGCCCAAGCTGCACTGCAGGCTGTCAGTGCAGTCCAGTCAGGAAACTTGTCCCTTCC  491

Query  513  TGGAGGTCCTTCCAATGAAGGCACAGTCCTACCTGGGCAGAGCCCTGTGCTTCGAATAATTATTGAAAACCTCT  586
            |||||.|.||.|.||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  492  TGGAGCTACTGCAAATGAAGGCACATTGCTACCTGGGCAGAGCCCTGTGCTCCGGATAATTATTGAAAACCTAT  565

Query  587  TTTACCCTGTTACCCTGGAAGTTCTTCATCAGATATTTTCTAAATTTGGCACAGTCTTGAAGATTATCACCTTT  660
            ||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct  566  TTTACCCTGTCACTCTGGAAGTTCTCCATCAGATATTTTCTAAATTTGGCACGGTGTTGAAGATTATCACCTTT  639

Query  661  ACAAAGAATAATCAGTTTCAAGCCTTGCTTCAGTATGCTGACCCAGTAAATGCACATTATGCCAAAATGGCTCT  734
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  640  ACAAAGAATAATCAGTTTCAAGCCTTGCTTCAGTATGCCGACCCAGTGAATGCGCAGTATGCCAAAATGGCTCT  713

Query  735  GGATGGCCAGAATATCTATAATGCATGCTGCACTCTGCGCATTGACTTCTCCAAGCTCACCAGCCTTAATGTGA  808
            ||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  714  GGATGGCCAGAATATCTACAATGCGTGCTGCACTCTCCGTATTGACTTCTCCAAGCTCACCAGCCTTAATGTGA  787

Query  809  AATATAATAATGACAAAAGCAGAGACTTCACTCGCTTAGACCTTCCTACTGGTGATGGCCAGCCATCCCTTGAA  882
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct  788  AATACAATAATGACAAAAGCAGAGACTTCACTCGCTTAGACCTTCCTACTGGTGACGGCCAGCCATCTCTTGAA  861

Query  883  CCCCCTATGGCTGCTGCTTTTGGTGCACCGGGTATAATTTCTTCACCATATGCAGGGGCTGCTGGATTTGCCCC  956
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  862  CCTCCTATGGCTGCTGCTTTTGGTGCACCGGGTATAATGTCCTCTCCATATGCAGGGGCTGCTGGCTTTGCCCC  935

Query  957  AGCCATTGGATTTCCTCAAGCTACAGGTCTATCAGTTCCAGCTGTTCCTGGAGCTCTTGGTCCTCTCACAATCA  1030
            ||||||.|.||||||||||||..|||||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||.|.|
Sbjct  936  AGCCATCGCATTTCCTCAAGCAGCAGGTCTGTCTGTCCCAGCTGTTCCCGGAGCCCTTGGTCCTCTCACACTTA  1009

Query 1031  CCTCTTCTGCTGTCACTGGAAGGATGGCCATTCCTGGGGCTAGTGGTATACCAGGAAATTCTGTTCTACTCGTC  1104
            ||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||.||.|||
Sbjct 1010  CCTCCTCTGCTGTCAGTGGAAGGATGGCCATTCCTGGGGCAAGTGGTATGCCTGGGAATTCTGTTCTGCTGGTC  1083

Query 1105  ACAAATCTCAATCCTGATCTTATCACACCACATGGGCTTTTTATCCTATTTGGAGTCTATGGTGATGTACATCG  1178
            ||.||.|||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1084  ACCAACCTCAATCCTGACTTTATCACACCACATGGGCTTTTTATCCTATTTGGAGTGTATGGTGATGTACATCG  1157

Query 1179  AGTGAAGATTATGTTTAATAAGAAAGAAAATGCCTTGGTTCAGATGGCGGATGCAAATCAAGCTCAGCTAGCAA  1252
            ||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|.||||||.||||||||||
Sbjct 1158  AGTGAAGATTATGTTTAACAAGAAAGAAAACGCCTTGGTGCAGATGGCGGATGCGAGTCAAGCCCAGCTAGCAA  1231

Query 1253  TGAACCATCTAAGTGGTCAGAGACTTTATGGGAAAGTGCTTCGTGCTACACTGTCCAAACATCAAGCAGTACAG  1326
            |||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1232  TGAACCACCTAAGTGGTCAGAGGCTCTATGGAAAAGTACTTCGGGCTACACTGTCCAAACATCAAGCCGTCCAG  1305

Query 1327  CTTCCTCGAGAGGGACAAGAAGACCAAGGTCTGACTAAGGATTTCAGCAATAGTCCTTTGCATCGCTTTAAAAA  1400
            ||.|||.||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||..||||||||||||||||
Sbjct 1306  CTCCCTAGAGAGGGACAGGAAGACCAAGGTCTGACCAAGGACTTCAGCAATAGTCCCCTGCATCGCTTTAAAAA  1379

Query 1401  GCCGGGCTCTAAAAACTTCCAGAATATCTTTCCACCATCAGCCACTCTGCATCTTTCCAACATTCCCCCTTCTG  1474
            |||.|||||.||.||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1380  GCCCGGCTCAAAGAATTTCCAAAATATCTTCCCTCCATCAGCCACACTTCATCTTTCCAACATTCCTCCTTCTG  1453

Query 1475  TTACAGTGGATGATCTGAAGAACCTTTTCATAGAAGCTGGATGTTCAGTGAAGGCTTTTAAATTCTTTCAGAAA  1548
            |.|||.|||||||.|||||||||||.||||.||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1454  TCACAATGGATGACCTGAAGAACCTGTTCACAGAAGCTGGATGCTCAGTGAAGGCTTTTAAGTTCTTCCAGAAA  1527

Query 1549  GATCGCAAAATGGCGCTCATTCAATTGGGATCTGTGGAAGAAGCAATTCAGGCCCTCATTGAGCTTCATAACCA  1622
            ||.||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||
Sbjct 1528  GACCGTAAGATGGCTCTCATTCAGTTGGGATCTGTGGAAGAAGCAATCCAGGCTCTTATTGAGCTTCACAATCA  1601

Query 1623  TGACCTTGGAGAAAATCACCACCTCAGAGTTTCCTTCTCAAAATCTACAATC  1674
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1602  TGACCTTGGAGAGAATCACCACCTCAGAGTTTCCTTCTCAAAATCCACCATC  1653