Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11442
• Subject: XM_006537851.3
• Aligned Length: 1696
• Identities: 1499
• Gaps: 50

Alignment

Query    1  ATGGACGCTTCCCCCTCACCT-------TTCTCTCTCCCCAAGAAACTTAATGAATTATCTGCCCGT------C  61
            |||            |||..|       ||.|..|      || |.||||      ||.|.|.|.||      |
Sbjct    1  ATG------------TCAGATATTGTTGTTGTTAC------AG-ATCTTA------TAGCAGTCGGTTTAAAGC  49

Query   62  GGGGATCTGATGAGCTTCTTTCTTCTGGCATCATTAACGGACCTTTTACCATGAATAGTTCTACTCCTTCTACA  135
            |||||||||||||||||||.||||||||..|||||||||||||||.|||||||||.||.||.|   |||||.||
Sbjct   50  GGGGATCTGATGAGCTTCTGTCTTCTGGTGTCATTAACGGACCTTCTACCATGAACAGCTCGA---CTTCTGCA  120

Query  136  ---------GCTAATGGGAATGACAGCAAGAAATTTAAACGAGATAGACCTCCCTGTTCGCCTTCCCGTGTTCT  200
                     ||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  GGTGTGTATGCTAATGGGAATGACAACAAGAAATTTAAAGGAGATAGACCTCCCTGTTCGCCTTCCCGTGTTCT  194

Query  201  CCATCTTCGAAAAATTCCATGTGATGTCACCGAAGCAGAGATCATATCATTAGGTCTACCATTTGGCAAAGTAA  274
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  195  CCATCTTCGAAAAATTCCATGTGATGTCACCGAAGCAGAGGTCATATCATTAGGTCTACCATTTGGCAAAGTAA  268

Query  275  CTAATCTTTTGATGTTGAAAGGAAAAAGCCAGGCTTTCTTAGAAATGGCTTCTGAGGAAGCTGCCGTTACTATG  348
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  269  CTAATCTTTTGATGTTGAAAGGAAAAAGCCAGGCCTTTTTAGAAATGGCTTCTGAAGAAGCTGCTGTTACTATG  342

Query  349  GTGAATTATTACACTCCTATTACTCCTCACCTTCGAAGCCAGCCTGTTTATATTCAGTATTCCAATCACAGAGA  422
            .|.|||||||||||||||.||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||.||||
Sbjct  343  ATAAATTATTACACTCCTGTTACTCCTCATCTTCGAAGTCAGCCTGTTTATATCCAGTATTCCAATCACCGAGA  416

Query  423  ACTTAAGACTGACAATCTACCTAATCAAGCTCGAGCCCAAGCTGCACTGCAGGCTGTCAGTGCCGTCCAATCAG  496
            ||||||||||||||||||.||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct  417  ACTTAAGACTGACAATCTGCCTAATCAGGCTAGAGCCCAAGCTGCACTGCAGGCTGTCAGTGCAGTCCAGTCAG  490

Query  497  GAAGCCTGGCCCTTTCTGGAGGTCCTTCCAATGAAGGCACAGTCCTACCTGGGCAGAGCCCTGTGCTTCGAATA  570
            |||.|.||.|||||.||||||.|.||.|.||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct  491  GAAACTTGTCCCTTCCTGGAGCTACTGCAAATGAAGGCACATTGCTACCTGGGCAGAGCCCTGTGCTCCGGATA  564

Query  571  ATTATTGAAAACCTCTTTTACCCTGTTACCCTGGAAGTTCTTCATCAGATATTTTCTAAATTTGGCACAGTCTT  644
            ||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct  565  ATTATTGAAAACCTATTTTACCCTGTCACTCTGGAAGTTCTCCATCAGATATTTTCTAAATTTGGCACGGTGTT  638

Query  645  GAAGATTATCACCTTTACAAAGAATAATCAGTTTCAAGCCTTGCTTCAGTATGCTGACCCAGTAAATGCACATT  718
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|
Sbjct  639  GAAGATTATCACCTTTACAAAGAATAATCAGTTTCAAGCCTTGCTTCAGTATGCCGACCCAGTGAATGCGCAGT  712

Query  719  ATGCCAAAATGGCTCTGGATGGCCAGAATATCTATAATGCATGCTGCACTCTGCGCATTGACTTCTCCAAGCTC  792
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct  713  ATGCCAAAATGGCTCTGGATGGCCAGAATATCTACAATGCGTGCTGCACTCTCCGTATTGACTTCTCCAAGCTC  786

Query  793  ACCAGCCTTAATGTGAAATATAATAATGACAAAAGCAGAGACTTCACTCGCTTAGACCTTCCTACTGGTGATGG  866
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  787  ACCAGCCTTAATGTGAAATACAATAATGACAAAAGCAGAGACTTCACTCGCTTAGACCTTCCTACTGGTGACGG  860

Query  867  CCAGCCATCCCTTGAACCCCCTATGGCTGCTGCTTTTGGTGCACCGGGTATAATTTCTTCACCATATGCAGGGG  940
            |||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||
Sbjct  861  CCAGCCATCTCTTGAACCTCCTATGGCTGCTGCTTTTGGTGCACCGGGTATAATGTCCTCTCCATATGCAGGGG  934

Query  941  CTGCTGGATTTGCCCCAGCCATTGGATTTCCTCAAGCTACAGGTCTATCAGTTCCAGCTGTTCCTGGAGCTCTT  1014
            |||||||.||||||||||||||.|.||||||||||||..|||||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||
Sbjct  935  CTGCTGGCTTTGCCCCAGCCATCGCATTTCCTCAAGCAGCAGGTCTGTCTGTCCCAGCTGTTCCCGGAGCCCTT  1008

Query 1015  GGTCCTCTCACAATCACCTCTTCTGCTGTCACTGGAAGGATGGCCATTCCTGGGGCTAGTGGTATACCAGGAAA  1088
            ||||||||||||.|.|||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||
Sbjct 1009  GGTCCTCTCACACTTACCTCCTCTGCTGTCAGTGGAAGGATGGCCATTCCTGGGGCAAGTGGTATGCCTGGGAA  1082

Query 1089  TTCTGTTCTACTCGTCACAAATCTCAATCCTGATCTTATCACACCACATGGGCTTTTTATCCTATTTGGAGTCT  1162
            |||||||||.||.|||||.||.|||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1083  TTCTGTTCTGCTGGTCACCAACCTCAATCCTGACTTTATCACACCACATGGGCTTTTTATCCTATTTGGAGTGT  1156

Query 1163  ATGGTGATGTACATCGAGTGAAGATTATGTTTAATAAGAAAGAAAATGCCTTGGTTCAGATGGCGGATGCAAAT  1236
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|.|
Sbjct 1157  ATGGTGATGTACATCGAGTGAAGATTATGTTTAACAAGAAAGAAAACGCCTTGGTGCAGATGGCGGATGCGAGT  1230

Query 1237  CAAGCTCAGCTAGCAATGAACCATCTAAGTGGTCAGAGACTTTATGGGAAAGTGCTTCGTGCTACACTGTCCAA  1310
            |||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 1231  CAAGCCCAGCTAGCAATGAACCACCTAAGTGGTCAGAGGCTCTATGGAAAAGTACTTCGGGCTACACTGTCCAA  1304

Query 1311  ACATCAAGCAGTACAGCTTCCTCGAGAGGGACAAGAAGACCAAGGTCTGACTAAGGATTTCAGCAATAGTCCTT  1384
            |||||||||.||.|||||.|||.||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||..
Sbjct 1305  ACATCAAGCCGTCCAGCTCCCTAGAGAGGGACAGGAAGACCAAGGTCTGACCAAGGACTTCAGCAATAGTCCCC  1378

Query 1385  TGCATCGCTTTAAAAAGCCGGGCTCTAAAAACTTCCAGAATATCTTTCCACCATCAGCCACTCTGCATCTTTCC  1458
            |||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1379  TGCATCGCTTTAAAAAGCCCGGCTCAAAGAATTTCCAAAATATCTTCCCTCCATCAGCCACACTTCATCTTTCC  1452

Query 1459  AACATTCCCCCTTCTGTTACAGTGGATGATCTGAAGAACCTTTTCATAGAAGCTGGATGTTCAGTGAAGGCTTT  1532
            ||||||||.||||||||.|||.|||||||.|||||||||||.||||.||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1453  AACATTCCTCCTTCTGTCACAATGGATGACCTGAAGAACCTGTTCACAGAAGCTGGATGCTCAGTGAAGGCTTT  1526

Query 1533  TAAATTCTTTCAGAAAGATCGCAAAATGGCGCTCATTCAATTGGGATCTGTGGAAGAAGCAATTCAGGCCCTCA  1606
            |||.|||||.||||||||.||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct 1527  TAAGTTCTTCCAGAAAGACCGTAAGATGGCTCTCATTCAGTTGGGATCTGTGGAAGAAGCAATCCAGGCTCTTA  1600

Query 1607  TTGAGCTTCATAACCATGACCTTGGAGAAAATCACCACCTCAGAGTTTCCTTCTCAAAATCTACAATC  1674
            ||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1601  TTGAGCTTCACAATCATGACCTTGGAGAGAATCACCACCTCAGAGTTTCCTTCTCAAAATCCACCATC  1668