Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11442
• Subject: XM_006537852.3
• Aligned Length: 1689
• Identities: 1499
• Gaps: 42

Alignment

Query    1  ATGGACGCTTCCCCCTCACCTTTCTCTCTCCCCAAGAAACTTAATGAATTATCTGCCCGT------CGGGGATC  68
            |||||.|.|           .||.|..|      || |.||||      ||.|.|.|.||      ||||||||
Sbjct    1  ATGGATGGT-----------GTTGTTAC------AG-ATCTTA------TAGCAGTCGGTTTAAAGCGGGGATC  50

Query   69  TGATGAGCTTCTTTCTTCTGGCATCATTAACGGACCTTTTACCATGAATAGTTCTACTCCTTCTACA-------  135
            ||||||||||||.||||||||..|||||||||||||||.|||||||||.||.||.|   |||||.||       
Sbjct   51  TGATGAGCTTCTGTCTTCTGGTGTCATTAACGGACCTTCTACCATGAACAGCTCGA---CTTCTGCAGGTGTGT  121

Query  136  --GCTAATGGGAATGACAGCAAGAAATTTAAACGAGATAGACCTCCCTGTTCGCCTTCCCGTGTTCTCCATCTT  207
              ||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  122  ATGCTAATGGGAATGACAACAAGAAATTTAAAGGAGATAGACCTCCCTGTTCGCCTTCCCGTGTTCTCCATCTT  195

Query  208  CGAAAAATTCCATGTGATGTCACCGAAGCAGAGATCATATCATTAGGTCTACCATTTGGCAAAGTAACTAATCT  281
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  196  CGAAAAATTCCATGTGATGTCACCGAAGCAGAGGTCATATCATTAGGTCTACCATTTGGCAAAGTAACTAATCT  269

Query  282  TTTGATGTTGAAAGGAAAAAGCCAGGCTTTCTTAGAAATGGCTTCTGAGGAAGCTGCCGTTACTATGGTGAATT  355
            |||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||.|.||||
Sbjct  270  TTTGATGTTGAAAGGAAAAAGCCAGGCCTTTTTAGAAATGGCTTCTGAAGAAGCTGCTGTTACTATGATAAATT  343

Query  356  ATTACACTCCTATTACTCCTCACCTTCGAAGCCAGCCTGTTTATATTCAGTATTCCAATCACAGAGAACTTAAG  429
            |||||||||||.||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  344  ATTACACTCCTGTTACTCCTCATCTTCGAAGTCAGCCTGTTTATATCCAGTATTCCAATCACCGAGAACTTAAG  417

Query  430  ACTGACAATCTACCTAATCAAGCTCGAGCCCAAGCTGCACTGCAGGCTGTCAGTGCCGTCCAATCAGGAAGCCT  503
            |||||||||||.||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||.|.|
Sbjct  418  ACTGACAATCTGCCTAATCAGGCTAGAGCCCAAGCTGCACTGCAGGCTGTCAGTGCAGTCCAGTCAGGAAACTT  491

Query  504  GGCCCTTTCTGGAGGTCCTTCCAATGAAGGCACAGTCCTACCTGGGCAGAGCCCTGTGCTTCGAATAATTATTG  577
            |.|||||.||||||.|.||.|.||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct  492  GTCCCTTCCTGGAGCTACTGCAAATGAAGGCACATTGCTACCTGGGCAGAGCCCTGTGCTCCGGATAATTATTG  565

Query  578  AAAACCTCTTTTACCCTGTTACCCTGGAAGTTCTTCATCAGATATTTTCTAAATTTGGCACAGTCTTGAAGATT  651
            |||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct  566  AAAACCTATTTTACCCTGTCACTCTGGAAGTTCTCCATCAGATATTTTCTAAATTTGGCACGGTGTTGAAGATT  639

Query  652  ATCACCTTTACAAAGAATAATCAGTTTCAAGCCTTGCTTCAGTATGCTGACCCAGTAAATGCACATTATGCCAA  725
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||
Sbjct  640  ATCACCTTTACAAAGAATAATCAGTTTCAAGCCTTGCTTCAGTATGCCGACCCAGTGAATGCGCAGTATGCCAA  713

Query  726  AATGGCTCTGGATGGCCAGAATATCTATAATGCATGCTGCACTCTGCGCATTGACTTCTCCAAGCTCACCAGCC  799
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  714  AATGGCTCTGGATGGCCAGAATATCTACAATGCGTGCTGCACTCTCCGTATTGACTTCTCCAAGCTCACCAGCC  787

Query  800  TTAATGTGAAATATAATAATGACAAAAGCAGAGACTTCACTCGCTTAGACCTTCCTACTGGTGATGGCCAGCCA  873
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  788  TTAATGTGAAATACAATAATGACAAAAGCAGAGACTTCACTCGCTTAGACCTTCCTACTGGTGACGGCCAGCCA  861

Query  874  TCCCTTGAACCCCCTATGGCTGCTGCTTTTGGTGCACCGGGTATAATTTCTTCACCATATGCAGGGGCTGCTGG  947
            ||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct  862  TCTCTTGAACCTCCTATGGCTGCTGCTTTTGGTGCACCGGGTATAATGTCCTCTCCATATGCAGGGGCTGCTGG  935

Query  948  ATTTGCCCCAGCCATTGGATTTCCTCAAGCTACAGGTCTATCAGTTCCAGCTGTTCCTGGAGCTCTTGGTCCTC  1021
            .||||||||||||||.|.||||||||||||..|||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct  936  CTTTGCCCCAGCCATCGCATTTCCTCAAGCAGCAGGTCTGTCTGTCCCAGCTGTTCCCGGAGCCCTTGGTCCTC  1009

Query 1022  TCACAATCACCTCTTCTGCTGTCACTGGAAGGATGGCCATTCCTGGGGCTAGTGGTATACCAGGAAATTCTGTT  1095
            |||||.|.|||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||
Sbjct 1010  TCACACTTACCTCCTCTGCTGTCAGTGGAAGGATGGCCATTCCTGGGGCAAGTGGTATGCCTGGGAATTCTGTT  1083

Query 1096  CTACTCGTCACAAATCTCAATCCTGATCTTATCACACCACATGGGCTTTTTATCCTATTTGGAGTCTATGGTGA  1169
            ||.||.|||||.||.|||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1084  CTGCTGGTCACCAACCTCAATCCTGACTTTATCACACCACATGGGCTTTTTATCCTATTTGGAGTGTATGGTGA  1157

Query 1170  TGTACATCGAGTGAAGATTATGTTTAATAAGAAAGAAAATGCCTTGGTTCAGATGGCGGATGCAAATCAAGCTC  1243
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|.||||||.|
Sbjct 1158  TGTACATCGAGTGAAGATTATGTTTAACAAGAAAGAAAACGCCTTGGTGCAGATGGCGGATGCGAGTCAAGCCC  1231

Query 1244  AGCTAGCAATGAACCATCTAAGTGGTCAGAGACTTTATGGGAAAGTGCTTCGTGCTACACTGTCCAAACATCAA  1317
            ||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1232  AGCTAGCAATGAACCACCTAAGTGGTCAGAGGCTCTATGGAAAAGTACTTCGGGCTACACTGTCCAAACATCAA  1305

Query 1318  GCAGTACAGCTTCCTCGAGAGGGACAAGAAGACCAAGGTCTGACTAAGGATTTCAGCAATAGTCCTTTGCATCG  1391
            ||.||.|||||.|||.||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||..|||||||
Sbjct 1306  GCCGTCCAGCTCCCTAGAGAGGGACAGGAAGACCAAGGTCTGACCAAGGACTTCAGCAATAGTCCCCTGCATCG  1379

Query 1392  CTTTAAAAAGCCGGGCTCTAAAAACTTCCAGAATATCTTTCCACCATCAGCCACTCTGCATCTTTCCAACATTC  1465
            ||||||||||||.|||||.||.||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct 1380  CTTTAAAAAGCCCGGCTCAAAGAATTTCCAAAATATCTTCCCTCCATCAGCCACACTTCATCTTTCCAACATTC  1453

Query 1466  CCCCTTCTGTTACAGTGGATGATCTGAAGAACCTTTTCATAGAAGCTGGATGTTCAGTGAAGGCTTTTAAATTC  1539
            |.||||||||.|||.|||||||.|||||||||||.||||.||||||||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 1454  CTCCTTCTGTCACAATGGATGACCTGAAGAACCTGTTCACAGAAGCTGGATGCTCAGTGAAGGCTTTTAAGTTC  1527

Query 1540  TTTCAGAAAGATCGCAAAATGGCGCTCATTCAATTGGGATCTGTGGAAGAAGCAATTCAGGCCCTCATTGAGCT  1613
            ||.||||||||.||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||
Sbjct 1528  TTCCAGAAAGACCGTAAGATGGCTCTCATTCAGTTGGGATCTGTGGAAGAAGCAATCCAGGCTCTTATTGAGCT  1601

Query 1614  TCATAACCATGACCTTGGAGAAAATCACCACCTCAGAGTTTCCTTCTCAAAATCTACAATC  1674
            |||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1602  TCACAATCATGACCTTGGAGAGAATCACCACCTCAGAGTTTCCTTCTCAAAATCCACCATC  1662