Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11442
• Subject: XM_006537854.3
• Aligned Length: 1674
• Identities: 1427
• Gaps: 114

Alignment

Query    1  ATGGACGCTTCCCCCTCACCTTTCTCTCTCCCCAAGAAACTTAATGAATTATCTGCCCGTCGGGGATCTGATGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GCTTCTTTCTTCTGGCATCATTAACGGACCTTTTACCATGAATAGTTCTACTCCTTCTACAGCTAATGGGAATG  148
                                                 |||||.||.||.|   |||||.|||||||||||||||
Sbjct    1  -------------------------------------ATGAACAGCTCGA---CTTCTGCAGCTAATGGGAATG  34

Query  149  ACAGCAAGAAATTTAAACGAGATAGACCTCCCTGTTCGCCTTCCCGTGTTCTCCATCTTCGAAAAATTCCATGT  222
            |||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   35  ACAACAAGAAATTTAAAGGAGATAGACCTCCCTGTTCGCCTTCCCGTGTTCTCCATCTTCGAAAAATTCCATGT  108

Query  223  GATGTCACCGAAGCAGAGATCATATCATTAGGTCTACCATTTGGCAAAGTAACTAATCTTTTGATGTTGAAAGG  296
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  109  GATGTCACCGAAGCAGAGGTCATATCATTAGGTCTACCATTTGGCAAAGTAACTAATCTTTTGATGTTGAAAGG  182

Query  297  AAAAAGCCAGGCTTTCTTAGAAATGGCTTCTGAGGAAGCTGCCGTTACTATGGTGAATTATTACACTCCTATTA  370
            ||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||.|.|||||||||||||||.|||
Sbjct  183  AAAAAGCCAGGCCTTTTTAGAAATGGCTTCTGAAGAAGCTGCTGTTACTATGATAAATTATTACACTCCTGTTA  256

Query  371  CTCCTCACCTTCGAAGCCAGCCTGTTTATATTCAGTATTCCAATCACAGAGAACTTAAGACTGACAATCTACCT  444
            |||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  257  CTCCTCATCTTCGAAGTCAGCCTGTTTATATCCAGTATTCCAATCACCGAGAACTTAAGACTGACAATCTGCCT  330

Query  445  AATCAAGCTCGAGCCCAAGCTGCACTGCAGGCTGTCAGTGCCGTCCAATCAGGAAGCCTGGCCCTTTCTGGAGG  518
            |||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||.|.||.|||||.||||||.
Sbjct  331  AATCAGGCTAGAGCCCAAGCTGCACTGCAGGCTGTCAGTGCAGTCCAGTCAGGAAACTTGTCCCTTCCTGGAGC  404

Query  519  TCCTTCCAATGAAGGCACAGTCCTACCTGGGCAGAGCCCTGTGCTTCGAATAATTATTGAAAACCTCTTTTACC  592
            |.||.|.||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  405  TACTGCAAATGAAGGCACATTGCTACCTGGGCAGAGCCCTGTGCTCCGGATAATTATTGAAAACCTATTTTACC  478

Query  593  CTGTTACCCTGGAAGTTCTTCATCAGATATTTTCTAAATTTGGCACAGTCTTGAAGATTATCACCTTTACAAAG  666
            ||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  479  CTGTCACTCTGGAAGTTCTCCATCAGATATTTTCTAAATTTGGCACGGTGTTGAAGATTATCACCTTTACAAAG  552

Query  667  AATAATCAGTTTCAAGCCTTGCTTCAGTATGCTGACCCAGTAAATGCACATTATGCCAAAATGGCTCTGGATGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  553  AATAATCAGTTTCAAGCCTTGCTTCAGTATGCCGACCCAGTGAATGCGCAGTATGCCAAAATGGCTCTGGATGG  626

Query  741  CCAGAATATCTATAATGCATGCTGCACTCTGCGCATTGACTTCTCCAAGCTCACCAGCCTTAATGTGAAATATA  814
            ||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  627  CCAGAATATCTACAATGCGTGCTGCACTCTCCGTATTGACTTCTCCAAGCTCACCAGCCTTAATGTGAAATACA  700

Query  815  ATAATGACAAAAGCAGAGACTTCACTCGCTTAGACCTTCCTACTGGTGATGGCCAGCCATCCCTTGAACCCCCT  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  701  ATAATGACAAAAGCAGAGACTTCACTCGCTTAGACCTTCCTACTGGTGACGGCCAGCCATCTCTTGAACCTCCT  774

Query  889  ATGGCTGCTGCTTTTGGTGCACCGGGTATAATTTCTTCACCATATGCAGGGGCTGCTGGATTTGCCCCAGCCAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  775  ATGGCTGCTGCTTTTGGTGCACCGGGTATAATGTCCTCTCCATATGCAGGGGCTGCTGGCTTTGCCCCAGCCAT  848

Query  963  TGGATTTCCTCAAGCTACAGGTCTATCAGTTCCAGCTGTTCCTGGAGCTCTTGGTCCTCTCACAATCACCTCTT  1036
            .|.||||||||||||..|||||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||.|.|||||.|
Sbjct  849  CGCATTTCCTCAAGCAGCAGGTCTGTCTGTCCCAGCTGTTCCCGGAGCCCTTGGTCCTCTCACACTTACCTCCT  922

Query 1037  CTGCTGTCACTGGAAGGATGGCCATTCCTGGGGCTAGTGGTATACCAGGAAATTCTGTTCTACTCGTCACAAAT  1110
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||.||.|||||.||.
Sbjct  923  CTGCTGTCAGTGGAAGGATGGCCATTCCTGGGGCAAGTGGTATGCCTGGGAATTCTGTTCTGCTGGTCACCAAC  996

Query 1111  CTCAATCCTGATCTTATCACACCACATGGGCTTTTTATCCTATTTGGAGTCTATGGTGATGTACATCGAGTGAA  1184
            |||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  997  CTCAATCCTGACTTTATCACACCACATGGGCTTTTTATCCTATTTGGAGTGTATGGTGATGTACATCGAGTGAA  1070

Query 1185  GATTATGTTTAATAAGAAAGAAAATGCCTTGGTTCAGATGGCGGATGCAAATCAAGCTCAGCTAGCAATGAACC  1258
            ||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|.||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1071  GATTATGTTTAACAAGAAAGAAAACGCCTTGGTGCAGATGGCGGATGCGAGTCAAGCCCAGCTAGCAATGAACC  1144

Query 1259  ATCTAAGTGGTCAGAGACTTTATGGGAAAGTGCTTCGTGCTACACTGTCCAAACATCAAGCAGTACAGCTTCCT  1332
            |.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||
Sbjct 1145  ACCTAAGTGGTCAGAGGCTCTATGGAAAAGTACTTCGGGCTACACTGTCCAAACATCAAGCCGTCCAGCTCCCT  1218

Query 1333  CGAGAGGGACAAGAAGACCAAGGTCTGACTAAGGATTTCAGCAATAGTCCTTTGCATCGCTTTAAAAAGCCGGG  1406
            .||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||..|||||||||||||||||||.||
Sbjct 1219  AGAGAGGGACAGGAAGACCAAGGTCTGACCAAGGACTTCAGCAATAGTCCCCTGCATCGCTTTAAAAAGCCCGG  1292

Query 1407  CTCTAAAAACTTCCAGAATATCTTTCCACCATCAGCCACTCTGCATCTTTCCAACATTCCCCCTTCTGTTACAG  1480
            |||.||.||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||.
Sbjct 1293  CTCAAAGAATTTCCAAAATATCTTCCCTCCATCAGCCACACTTCATCTTTCCAACATTCCTCCTTCTGTCACAA  1366

Query 1481  TGGATGATCTGAAGAACCTTTTCATAGAAGCTGGATGTTCAGTGAAGGCTTTTAAATTCTTTCAGAAAGATCGC  1554
            |||||||.|||||||||||.||||.||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.
Sbjct 1367  TGGATGACCTGAAGAACCTGTTCACAGAAGCTGGATGCTCAGTGAAGGCTTTTAAGTTCTTCCAGAAAGACCGT  1440

Query 1555  AAAATGGCGCTCATTCAATTGGGATCTGTGGAAGAAGCAATTCAGGCCCTCATTGAGCTTCATAACCATGACCT  1628
            ||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||
Sbjct 1441  AAGATGGCTCTCATTCAGTTGGGATCTGTGGAAGAAGCAATCCAGGCTCTTATTGAGCTTCACAATCATGACCT  1514

Query 1629  TGGAGAAAATCACCACCTCAGAGTTTCCTTCTCAAAATCTACAATC  1674
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1515  TGGAGAGAATCACCACCTCAGAGTTTCCTTCTCAAAATCCACCATC  1560