Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11442
• Subject: XM_006717346.1
• Aligned Length: 1674
• Identities: 1563
• Gaps: 111

Alignment

Query    1  ATGGACGCTTCCCCCTCACCTTTCTCTCTCCCCAAGAAACTTAATGAATTATCTGCCCGTCGGGGATCTGATGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GCTTCTTTCTTCTGGCATCATTAACGGACCTTTTACCATGAATAGTTCTACTCCTTCTACAGCTAATGGGAATG  148
                                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------------------------------ATGAATAGTTCTACTCCTTCTACAGCTAATGGGAATG  37

Query  149  ACAGCAAGAAATTTAAACGAGATAGACCTCCCTGTTCGCCTTCCCGTGTTCTCCATCTTCGAAAAATTCCATGT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   38  ACAGCAAGAAATTTAAACGAGATAGACCTCCCTGTTCGCCTTCCCGTGTTCTCCATCTTCGAAAAATTCCATGT  111

Query  223  GATGTCACCGAAGCAGAGATCATATCATTAGGTCTACCATTTGGCAAAGTAACTAATCTTTTGATGTTGAAAGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  112  GATGTCACCGAAGCAGAGATCATATCATTAGGTCTACCATTTGGCAAAGTAACTAATCTTTTGATGTTGAAAGG  185

Query  297  AAAAAGCCAGGCTTTCTTAGAAATGGCTTCTGAGGAAGCTGCCGTTACTATGGTGAATTATTACACTCCTATTA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  186  AAAAAGCCAGGCTTTCTTAGAAATGGCTTCTGAGGAAGCTGCCGTTACTATGGTGAATTATTACACTCCTATTA  259

Query  371  CTCCTCACCTTCGAAGCCAGCCTGTTTATATTCAGTATTCCAATCACAGAGAACTTAAGACTGACAATCTACCT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  260  CTCCTCACCTTCGAAGCCAGCCTGTTTATATTCAGTATTCCAATCACAGAGAACTTAAGACTGACAATCTACCT  333

Query  445  AATCAAGCTCGAGCCCAAGCTGCACTGCAGGCTGTCAGTGCCGTCCAATCAGGAAGCCTGGCCCTTTCTGGAGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  334  AATCAAGCTCGAGCCCAAGCTGCACTGCAGGCTGTCAGTGCCGTCCAATCAGGAAGCCTGGCCCTTTCTGGAGG  407

Query  519  TCCTTCCAATGAAGGCACAGTCCTACCTGGGCAGAGCCCTGTGCTTCGAATAATTATTGAAAACCTCTTTTACC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  408  TCCTTCCAATGAAGGCACAGTCCTACCTGGGCAGAGCCCTGTGCTTCGAATAATTATTGAAAACCTCTTTTACC  481

Query  593  CTGTTACCCTGGAAGTTCTTCATCAGATATTTTCTAAATTTGGCACAGTCTTGAAGATTATCACCTTTACAAAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  482  CTGTTACCCTGGAAGTTCTTCATCAGATATTTTCTAAATTTGGCACAGTCTTGAAGATTATCACCTTTACAAAG  555

Query  667  AATAATCAGTTTCAAGCCTTGCTTCAGTATGCTGACCCAGTAAATGCACATTATGCCAAAATGGCTCTGGATGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  556  AATAATCAGTTTCAAGCCTTGCTTCAGTATGCTGACCCAGTAAATGCACATTATGCCAAAATGGCTCTGGATGG  629

Query  741  CCAGAATATCTATAATGCATGCTGCACTCTGCGCATTGACTTCTCCAAGCTCACCAGCCTTAATGTGAAATATA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  630  CCAGAATATCTATAATGCATGCTGCACTCTGCGCATTGACTTCTCCAAGCTCACCAGCCTTAATGTGAAATATA  703

Query  815  ATAATGACAAAAGCAGAGACTTCACTCGCTTAGACCTTCCTACTGGTGATGGCCAGCCATCCCTTGAACCCCCT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  704  ATAATGACAAAAGCAGAGACTTCACTCGCTTAGACCTTCCTACTGGTGATGGCCAGCCATCCCTTGAACCCCCT  777

Query  889  ATGGCTGCTGCTTTTGGTGCACCGGGTATAATTTCTTCACCATATGCAGGGGCTGCTGGATTTGCCCCAGCCAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  778  ATGGCTGCTGCTTTTGGTGCACCGGGTATAATTTCTTCACCATATGCAGGGGCTGCTGGATTTGCCCCAGCCAT  851

Query  963  TGGATTTCCTCAAGCTACAGGTCTATCAGTTCCAGCTGTTCCTGGAGCTCTTGGTCCTCTCACAATCACCTCTT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  852  TGGATTTCCTCAAGCTACAGGTCTATCAGTTCCAGCTGTTCCTGGAGCTCTTGGTCCTCTCACAATCACCTCTT  925

Query 1037  CTGCTGTCACTGGAAGGATGGCCATTCCTGGGGCTAGTGGTATACCAGGAAATTCTGTTCTACTCGTCACAAAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  926  CTGCTGTCACTGGAAGGATGGCCATTCCTGGGGCTAGTGGTATACCAGGAAATTCTGTTCTACTCGTCACAAAT  999

Query 1111  CTCAATCCTGATCTTATCACACCACATGGGCTTTTTATCCTATTTGGAGTCTATGGTGATGTACATCGAGTGAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1000  CTCAATCCTGATCTTATCACACCACATGGGCTTTTTATCCTATTTGGAGTCTATGGTGATGTACATCGAGTGAA  1073

Query 1185  GATTATGTTTAATAAGAAAGAAAATGCCTTGGTTCAGATGGCGGATGCAAATCAAGCTCAGCTAGCAATGAACC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1074  GATTATGTTTAATAAGAAAGAAAATGCCTTGGTTCAGATGGCGGATGCAAATCAAGCTCAGCTAGCAATGAACC  1147

Query 1259  ATCTAAGTGGTCAGAGACTTTATGGGAAAGTGCTTCGTGCTACACTGTCCAAACATCAAGCAGTACAGCTTCCT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1148  ATCTAAGTGGTCAGAGACTTTATGGGAAAGTGCTTCGTGCTACACTGTCCAAACATCAAGCAGTACAGCTTCCT  1221

Query 1333  CGAGAGGGACAAGAAGACCAAGGTCTGACTAAGGATTTCAGCAATAGTCCTTTGCATCGCTTTAAAAAGCCGGG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1222  CGAGAGGGACAAGAAGACCAAGGTCTGACTAAGGATTTCAGCAATAGTCCTTTGCATCGCTTTAAAAAGCCGGG  1295

Query 1407  CTCTAAAAACTTCCAGAATATCTTTCCACCATCAGCCACTCTGCATCTTTCCAACATTCCCCCTTCTGTTACAG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1296  CTCTAAAAACTTCCAGAATATCTTTCCACCATCAGCCACTCTGCATCTTTCCAACATTCCCCCTTCTGTTACAG  1369

Query 1481  TGGATGATCTGAAGAACCTTTTCATAGAAGCTGGATGTTCAGTGAAGGCTTTTAAATTCTTTCAGAAAGATCGC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1370  TGGATGATCTGAAGAACCTTTTCATAGAAGCTGGATGTTCAGTGAAGGCTTTTAAATTCTTTCAGAAAGATCGC  1443

Query 1555  AAAATGGCGCTCATTCAATTGGGATCTGTGGAAGAAGCAATTCAGGCCCTCATTGAGCTTCATAACCATGACCT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1444  AAAATGGCGCTCATTCAATTGGGATCTGTGGAAGAAGCAATTCAGGCCCTCATTGAGCTTCATAACCATGACCT  1517

Query 1629  TGGAGAAAATCACCACCTCAGAGTTTCCTTCTCAAAATCTACAATC  1674
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1518  TGGAGAAAATCACCACCTCAGAGTTTCCTTCTCAAAATCTACAATC  1563