Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_11448
- Subject:
- NM_025662.5
- Aligned Length:
- 1200
- Identities:
- 841
- Gaps:
- 219
Alignment
Query 1 ATGGCCGTCACCGACAGCCTCA----GCCG--GGCTGC---GACTGTCTTGGCAACTGTGTTGCTCTTGTCCTT 65
|||||.|.|.||..|..||||| ||.| ||||.| |.|.|.|||||| |||||||||..|
Sbjct 1 ATGGCGGCCCCCTGCTTCCTCACTCTGCGGGTGGCTACCCTGGCCGCCTTGGC---------GCTCTTGTCTCT 65
Query 66 CGGCAGCGTGGCCGCTAGTCATATCGAGGATCAAGCAGAACAATTCTTTAGAAGTGGCCATACAAACAACTGGG 139
|||||||...||||||.|.||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||
Sbjct 66 CGGCAGCTCTGCCGCTGGACACATCGAGGATCAAGCCGAACAGTTCTTTAGAAGTGGACACACAAATAACTGGG 139
Query 140 CTGTTCTGGTGTGTACATCCCGATTCTGGTTTAATTATCGACATGTTGCAAATACCCTTTCTGTTTATAGAAGT 213
|||||.|||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 140 CTGTTTTGGTGTGCACATCCCGATTCTGGTTTAACTACCGACATGTTGCAAATACTCTTTCTGTTTATAGAAGC 213
Query 214 GTCAAGAGGCTAGGTATTCCTGACAGTCACATTGTCCTAATGCTTGCAGATGATATGGCCTGTAATCCTAGAAA 287
|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||.||.|.||
Sbjct 214 GTCAAGAGGCTAGGTATCCCGGACAGTCACATTGTCCTGATGCTTGCTGATGACATGGCGTGCAATGCTCGGAA 287
Query 288 TCCCAAACCAGCTACAGTGTTTAGTCACAAGAATATGGAACTAAATGTGTATGGAGATGATGTGGAAGTGGATT 361
.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 288 CCCCAAGCCAGCCACAGTGTTCAGCCACAAGAACATGGAGCTCAATGTGTATGGAGACGATGTGGAAGTGGACT 361
Query 362 ATAGAAGTTATGAGGTAACTGTGGAGAATTTTTTACGGGTATTAACTGGGGGGATCCCACCTAGTACTCCTCGG 435
|.|||||.||||||||||||||||||||.||||||.|||||||.||.|||.||.|.|||||.|||||.|||||.
Sbjct 362 ACAGAAGCTATGAGGTAACTGTGGAGAACTTTTTAAGGGTATTGACCGGGAGGGTTCCACCCAGTACCCCTCGC 435
Query 436 TCAAAACGTCTTCTTTCTGATGACAGAAGCAATATTCTAATTTATATGACAGGGCATGGTGGAAATGGTTTCTT 509
|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct 436 TCAAAGCGTCTTCTTTCCGACGACAGAAGCAATATCCTCATTTATATGACAGGTCATGGAGGGAATGGTTTCTT 509
Query 510 AAAATTTCAAGATTCTGAAGAAATTACCAACATAGAACTCGCGGATGCTTTTGAACAAATGTGGCAGAAAAGAC 583
.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 510 GAAATTCCAAGATTCTGAAGAAATCACCAACATAGAACTTGCAGATGCGTTTGAACAGATGTGGCAGAAGAGAC 583
Query 584 GCTACAATGAGCTACTGTTTATTATTGATACTTGCCAAGGAGCATCCATGTATGAACGATTTTATTCTCCTAAC 657
|||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||.||.||.||.|||||||||
Sbjct 584 GCTACAATGAGCTGCTGTTCATTATTGACACTTGCCAGGGCGCGTCCATGTACGAGCGGTTCTACTCTCCTAAC 657
Query 658 ATAATGGCTCTAGCTAGTAGTCAAGTGGGAGAAGATTCACTCTCGCATCAACCTGATCCTGCAATTGGAGTCCA 731
||.|||||..|.||||||||.||.||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||.||
Sbjct 658 ATCATGGCCTTGGCTAGTAGCCAGGTGGGAGAGGATTCGCTGTCGCACCAGCCTGACCCTGCGATTGGAGTTCA 731
Query 732 TCTTATGGATAGATACACATTTTATGTCTTGGAATTTTTGGAAGAAATTAACCCAGCTAGCCAAACTAATATGA 805
||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 732 TCTTATGGATAGGTACACGTTTTATGTCTTGGAATTTTTGGAAGAAATTAATCCAGCTAGCCAAACTAACATGA 805
Query 806 ATGACCTTTTTCAGGTATGTCCCAAAAGTCTGTGTGTGTCTACTCCTGGACATCGCACTGATCTTTTTCAGAGG 879
|.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||.|.
Sbjct 806 ACGACCTTTTTCAAGTGTGTCCCAAAAGTCTCTGTGTGTCGACCCCTGGACATCGCACTGACCTTTTCCAGCGA 879
Query 880 GATCCTAAAAATGTACTGATAACTGATTTCTTTGGAAGTGTACGGAAAGTGGAAATTACAACAGAGACTATTAA 953
|||||.||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||||||||||..||.|.
Sbjct 880 GATCCAAAAAATGTCCTGATCACCGATTTCTTCGGAAGTGTGCGCAAGGTGGAAATCACAACAGAGAAGATCAG 953
Query 954 ATTGCAACAGGATTCAGAAATCATGGAAAGCAGGTATTCATCT------------------------------- 996
.|||||...|||||||.||.||.||||.||||| .|||
Sbjct 954 TTTGCAGTGGGATTCACAAGTCGTGGACAGCAG------TTCTAAAGAAGACGGCACGGCCGAGGAGCGCATGG 1021
Query 997 -------------------------------------------------------------------------- 996
Sbjct 1022 GACCTCTCAAGTATGCTGAGCAGCTCCCGGTGGCTCAGATAATACACCAGAAGCCAAAGCCGAGAGACTGGCAC 1095
Query 997 -------------------------------------------------------------------------- 996
Sbjct 1096 CCTCCCGGAGGCTTCATCCTGGGGCTGTGGGCGCTCATCATCATGGTCTTCTTCAAGACCTATGGGATCAAGCA 1169
Query 997 ---------------- 996
Sbjct 1170 TATGAAGTTCATTTTC 1185