Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11482
• Subject: XM_011243701.2
• Aligned Length: 1614
• Identities: 1236
• Gaps: 222

Alignment

Query    1  ATGGATGCTGATGAGGGTCAAGACATGTCCCAAGTTTCAGGGAAGGAAAGCCCCCCTGTAAGCGATACTCCAGA  74
            |||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||.||.||||||||
Sbjct    1  ATGGATGTCGATGAGGGTCAAGACATGTCCCAAGTTTCAGGAAAGGAGAGCCCCCCAGTCAGTGACACTCCAGA  74

Query   75  TGAGGGCGATGAGCCCATGCCGATCCCCGAGGACCTCTCCACCACCTCGGGAGGACAGCAAAGCTCCAAGAGTG  148
            |||.||.||||||||||||||..||||.||||||||.|||||.|||||.||||.||||||.|.|||||||||||
Sbjct   75  TGAAGGGGATGAGCCCATGCCTGTCCCTGAGGACCTGTCCACTACCTCTGGAGCACAGCAGAACTCCAAGAGTG  148

Query  149  ACAGAGTCGTGG------------------------------------------------------------CC  162
            |..|||.|.|||                                                            ||
Sbjct  149  ATCGAGGCATGGTTGCATATGGGGCTGATGGCTTTAGGGATTTTCATGCAATAATTCCCAAATCTTTCTCTCCC  222

Query  163  AGTAATGTTAAAGTAGAGACTCAGAGTGATGAAGAGAATGGGCGTGCCTGTGAAATGAATGGGGAAGAATGTGC  236
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGTAATGTTAAAGTAGAGACTCAGAGTGATGAAGAGAATGGGCGTGCCTGTGAAATGAATGGGGAAGAATGTGC  296

Query  237  GGAGGATTTACGAATGCTTGATGCCTCGGGAGAGAAAATGAATGGCTCCCACAGGGACCAAGGCAGCTCGGCTT  310
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGAGGATTTACGAATGCTTGATGCCTCGGGAGAGAAAATGAATGGCTCCCACAGGGACCAAGGCAGCTCGGCTT  370

Query  311  TGTCGGGAGTTGGAGGCATTCGACTTCCTAACGGAAAACTAAAGTGTGATATCTGTGGGATCATTTGCATCGGG  384
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  371  TGTCAGGAGTTGGAGGCATTCGACTTCCTAACGGAAAACTAAAGTGTGATATCTGTGGGATCGTTTGCATCGGG  444

Query  385  CCCAATGTGCTCATGGTTCACAAAAGAAGCCACACTGGAGAACGGCCCTTCCAGTGCAATCAGTGCGGGGCCTC  458
            |||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct  445  CCCAATGTGCTCATGGTTCACAAAAGAAGTCATACTGGTGAACGGCCTTTCCAGTGCAACCAGTGTGGGGCCTC  518

Query  459  ATTCACCCAGAAGGGCAACCTGCTCCGGCACATCAAGCTGCATTCCGGGGAGAAGCCCTTCAAATGCCACCTCT  532
            .||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct  519  CTTTACCCAGAAAGGCAACCTCCTGCGGCACATCAAGCTGCACTCGGGTGAGAAGCCCTTCAAATGCCATCTTT  592

Query  533  GCAACTACGCCTGCCGCCGGAGGGACGCCCTCACTGGCCACCTGAGGACGCACTCC------------------  588
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||                  
Sbjct  593  GCAACTATGCCTGCCGCCGGAGGGACGCCCTCACCGGCCACCTGAGGACGCACTCCGTTGGTAAGCCTCACAAA  666

Query  589  --------------------------------------------------------------------------  588
                                                                                      
Sbjct  667  TGTGGATATTGTGGCCGGAGCTATAAACAGCGAAGCTCTTTAGAGGAGCATAAAGAGCGATGCCACAACTACTT  740

Query  589  -------------------------------GTCATTAAAGAAGAAACTAATCACAGTGAAATGGCAGAAGACC  631
                                           ||||||||.|||||||||||.||||..||.|||||||||||||
Sbjct  741  GGAAAGCATGGGCCTTCCGGGCATGTACCCAGTCATTAAGGAAGAAACTAACCACAACGAGATGGCAGAAGACC  814

Query  632  TGTGCAAGATAGGATCAGAGAGATCTCTCGTGCTGGACAGACTAGCAAGTAACGTCGCCAAACGTAAGAGCTCT  705
            ||||||||||||||.|||||||.||.||.||.||||||||.||.|||||.||.||||||||||           
Sbjct  815  TGTGCAAGATAGGAGCAGAGAGGTCCCTTGTCCTGGACAGGCTGGCAAGCAATGTCGCCAAAC-----------  877

Query  706  ATGCCTCAGAAATTTCTTGGGGACAAGGGCCTGTCCGACACGCCCTACGACAGCAGCGCCAGCTACGAGAAGGA  779
                               |.||||||.|||||||.||||.||||||.||   |||.||||.|||.||||||||
Sbjct  878  -------------------GAGACAAGTGCCTGTCAGACATGCCCTATGA---CAGTGCCAACTATGAGAAGGA  929

Query  780  GAACGAAATGATGAAGTCCCACGTGATGGACCAAGCCATCAACAACGCCATCAACTACCTGGGGGCCGAGTCCC  853
            |   ||.|||||||..|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  930  G---GATATGATGACATCCCACGTGATGGACCAGGCCATCAACAATGCCATCAACTACCTGGGGGCTGAGTCCC  1000

Query  854  TGCGCCCGCTGGTGCAGACGCCCCCGGGCGGTTCCGAGGTGGTCCCGGTCATCAGCCCGATGTACCAGCTGCAC  927
            |||||||..||||||||||.|||||.||..|.|||||||||||.||.|||||||||.|.|||||||||||||||
Sbjct 1001  TGCGCCCATTGGTGCAGACACCCCCCGGTAGCTCCGAGGTGGTGCCAGTCATCAGCTCCATGTACCAGCTGCAC  1074

Query  928  AAGCCGCTCGCGGAGGGCACCCCGCGCTCCAACCACTCGGCCCAGGACAGCGCCGTGGAGAACCTGCTGCTGCT  1001
            |||||.|.|.|.||.|||.||||.||.||||||||.||.||.|||||   |||||||||.|||.||||||||||
Sbjct 1075  AAGCCCCCCTCAGATGGCCCCCCACGGTCCAACCATTCAGCACAGGA---CGCCGTGGATAACTTGCTGCTGCT  1145

Query 1002  CTCCAAGGCCAAGTTGGTGCCCTCGGAGCGCGAGGCGTCCCCGAGCAACAGCTGCCAAGACTCCACGGACACCG  1075
            .|||||||||||||..|||.|.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|
Sbjct 1146  GTCCAAGGCCAAGTCTGTGTCATCGGAGCGAGAGGCCTCCCCGAGCAACAGCTGCCAAGACTCCACAGATACAG  1219

Query 1076  AGAGCAACAACGAGGAGCAGCGCAGCGGTCTCATCTACCTGACCAACCACATCGCCCCGCACGCGCGCAACGGG  1149
            ||||||||...|||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||..||||||.||.|||||.|||
Sbjct 1220  AGAGCAACGCGGAGGAACAGCGCAGCGGCCTTATCTACCTAACCAACCACATCAACCCGCATGCACGCAATGGG  1293

Query 1150  CTGTCGCTCAAGGAGGAGCACCGCGCCTACGACCTGCTGCGCGCCGCCTCCGAGAACTCGCAGGACGCGCTCCG  1223
            |||.|.||||||||||||||.|||||||||||..|||||.|.||.|||||.||||||||||||||.||..||||
Sbjct 1294  CTGGCTCTCAAGGAGGAGCAGCGCGCCTACGAGGTGCTGAGGGCGGCCTCAGAGAACTCGCAGGATGCCTTCCG  1367

Query 1224  CGTGGTCAGCACCAGCGGGGAGCAGATGAAGGTGTACAAGTGCGAACACTGCCGGGTGCTCTTCCTGGATCACG  1297
            .|||||||||||.||.||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1368  TGTGGTCAGCACGAGTGGCGAGCAGCTGAAGGTGTACAAGTGCGAACACTGCCGCGTGCTCTTCCTGGATCACG  1441

Query 1298  TCATGTACACCATCCACATGGGCTGCCACGGCTTCCGTGATCCTTTTGAGTGCAACATGTGCGGCTACCACAGC  1371
            |||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||
Sbjct 1442  TCATGTATACCATTCACATGGGCTGCCATGGCTTTCGGGATCCCTTTGAGTGTAACATGTGTGGTTATCACAGC  1515

Query 1372  CAGGACCGGTACGAGTTCTCGTCGCACATAACGCGAGGGGAGCACCGCTTCCACATGAGC  1431
            ||||||.|||||||||||||.||.||.||.|||||.||||||||.||.|.||||.|||||
Sbjct 1516  CAGGACAGGTACGAGTTCTCATCCCATATCACGCGGGGGGAGCATCGTTACCACCTGAGC  1575