Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11482
• Subject: XM_011243704.1
• Aligned Length: 1662
• Identities: 1266
• Gaps: 240

Alignment

Query    1  ------------------------------------------------ATGGATGCTGATGAGGGTCAAGACAT  26
                                                            |||||||..|||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGGAGCCAGCCACAGGCCTGCAAAGCAGGAGATAACCTGAAGACAATGGATGTCGATGAGGGTCAAGACAT  74

Query   27  GTCCCAAGTTTCAGGGAAGGAAAGCCCCCCTGTAAGCGATACTCCAGATGAGGGCGATGAGCCCATGCCGATCC  100
            |||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||..|||
Sbjct   75  GTCCCAAGTTTCAGGAAAGGAGAGCCCCCCAGTCAGTGACACTCCAGATGAAGGGGATGAGCCCATGCCTGTCC  148

Query  101  CCGAGGACCTCTCCACCACCTCGGGAGGACAGCAAAGCTCCAAGAGTGACAGAGTCGTGG--------------  160
            |.||||||||.|||||.|||||.||||.||||||.|.||||||||||||..|||.|.|||              
Sbjct  149  CTGAGGACCTGTCCACTACCTCTGGAGCACAGCAGAACTCCAAGAGTGATCGAGGCATGGTTGCATATGGGGCT  222

Query  161  ----------------------------------------------CCAGTAATGTTAAAGTAGAGACTCAGAG  188
                                                          ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GATGGCTTTAGGGATTTTCATGCAATAATTCCCAAATCTTTCTCTCCCAGTAATGTTAAAGTAGAGACTCAGAG  296

Query  189  TGATGAAGAGAATGGGCGTGCCTGTGAAATGAATGGGGAAGAATGTGCGGAGGATTTACGAATGCTTGATGCCT  262
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGATGAAGAGAATGGGCGTGCCTGTGAAATGAATGGGGAAGAATGTGCAGAGGATTTACGAATGCTTGATGCCT  370

Query  263  CGGGAGAGAAAATGAATGGCTCCCACAGGGACCAAGGCAGCTCGGCTTTGTCGGGAGTTGGAGGCATTCGACTT  336
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CGGGAGAGAAAATGAATGGCTCCCACAGGGACCAAGGCAGCTCGGCTTTGTCAGGAGTTGGAGGCATTCGACTT  444

Query  337  CCTAACGGAAAACTAAAGTGTGATATCTGTGGGATCATTTGCATCGGGCCCAATGTGCTCATGGTTCACAAAAG  410
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCTAACGGAAAACTAAAGTGTGATATCTGTGGGATCGTTTGCATCGGGCCCAATGTGCTCATGGTTCACAAAAG  518

Query  411  AAGCCACACTGGAGAACGGCCCTTCCAGTGCAATCAGTGCGGGGCCTCATTCACCCAGAAGGGCAACCTGCTCC  484
            |||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||.|
Sbjct  519  AAGTCATACTGGTGAACGGCCTTTCCAGTGCAACCAGTGTGGGGCCTCCTTTACCCAGAAAGGCAACCTCCTGC  592

Query  485  GGCACATCAAGCTGCATTCCGGGGAGAAGCCCTTCAAATGCCACCTCTGCAACTACGCCTGCCGCCGGAGGGAC  558
            ||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGCACATCAAGCTGCACTCGGGTGAGAAGCCCTTCAAATGCCATCTTTGCAACTATGCCTGCCGCCGGAGGGAC  666

Query  559  GCCCTCACTGGCCACCTGAGGACGCACTCC--------------------------------------------  588
            ||||||||.|||||||||||||||||||||                                            
Sbjct  667  GCCCTCACCGGCCACCTGAGGACGCACTCCGTTGGTAAGCCTCACAAATGTGGATATTGTGGCCGGAGCTATAA  740

Query  589  --------------------------------------------------------------------------  588
                                                                                      
Sbjct  741  ACAGCGAAGCTCTTTAGAGGAGCATAAAGAGCGATGCCACAACTACTTGGAAAGCATGGGCCTTCCGGGCATGT  814

Query  589  -----GTCATTAAAGAAGAAACTAATCACAGTGAAATGGCAGAAGACCTGTGCAAGATAGGATCAGAGAGATCT  657
                 ||||||||.|||||||||||.||||..||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||.
Sbjct  815  ACCCAGTCATTAAGGAAGAAACTAACCACAACGAGATGGCAGAAGACCTGTGCAAGATAGGAGCAGAGAGGTCC  888

Query  658  CTCGTGCTGGACAGACTAGCAAGTAACGTCGCCAAACGTAAGAGCTCTATGCCTCAGAAATTTCTTGGGGACAA  731
            ||.||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  889  CTTGTCCTGGACAGGCTGGCAAGCAATGTCGCCAAACGTAAGAGCTCTATGCCTCAGAAATTTCTTGGAGACAA  962

Query  732  GGGCCTGTCCGACACGCCCTACGACAGCAGCGCCAGCTACGAGAAGGAGAACGAAATGATGAAGTCCCACGTGA  805
            |.|||||||.||||.||||||.||   |||.||||.|||.|||||||||   ||.|||||||..||||||||||
Sbjct  963  GTGCCTGTCAGACATGCCCTATGA---CAGTGCCAACTATGAGAAGGAG---GATATGATGACATCCCACGTGA  1030

Query  806  TGGACCAAGCCATCAACAACGCCATCAACTACCTGGGGGCCGAGTCCCTGCGCCCGCTGGTGCAGACGCCCCCG  879
            |||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||..||||||||||.|||||.
Sbjct 1031  TGGACCAGGCCATCAACAATGCCATCAACTACCTGGGGGCTGAGTCCCTGCGCCCATTGGTGCAGACACCCCCC  1104

Query  880  GGCGGTTCCGAGGTGGTCCCGGTCATCAGCCCGATGTACCAGCTGCACAAGCCGCTCGCGGAGGGCACCCCGCG  953
            ||..|.|||||||||||.||.|||||||||.|.||||||||||||||||||||.|.|.|.||.|||.||||.||
Sbjct 1105  GGTAGCTCCGAGGTGGTGCCAGTCATCAGCTCCATGTACCAGCTGCACAAGCCCCCCTCAGATGGCCCCCCACG  1178

Query  954  CTCCAACCACTCGGCCCAGGACAGCGCCGTGGAGAACCTGCTGCTGCTCTCCAAGGCCAAGTTGGTGCCCTCGG  1027
            .||||||||.||.||.|||||   |||||||||.|||.||||||||||.|||||||||||||..|||.|.||||
Sbjct 1179  GTCCAACCATTCAGCACAGGA---CGCCGTGGATAACTTGCTGCTGCTGTCCAAGGCCAAGTCTGTGTCATCGG  1249

Query 1028  AGCGCGAGGCGTCCCCGAGCAACAGCTGCCAAGACTCCACGGACACCGAGAGCAACAACGAGGAGCAGCGCAGC  1101
            ||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||...|||||.|||||||||
Sbjct 1250  AGCGAGAGGCCTCCCCGAGCAACAGCTGCCAAGACTCCACAGATACAGAGAGCAACGCGGAGGAACAGCGCAGC  1323

Query 1102  GGTCTCATCTACCTGACCAACCACATCGCCCCGCACGCGCGCAACGGGCTGTCGCTCAAGGAGGAGCACCGCGC  1175
            ||.||.||||||||.||||||||||||..||||||.||.|||||.||||||.|.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1324  GGCCTTATCTACCTAACCAACCACATCAACCCGCATGCACGCAATGGGCTGGCTCTCAAGGAGGAGCAGCGCGC  1397

Query 1176  CTACGACCTGCTGCGCGCCGCCTCCGAGAACTCGCAGGACGCGCTCCGCGTGGTCAGCACCAGCGGGGAGCAGA  1249
            ||||||..|||||.|.||.|||||.||||||||||||||.||..||||.|||||||||||.||.||.||||||.
Sbjct 1398  CTACGAGGTGCTGAGGGCGGCCTCAGAGAACTCGCAGGATGCCTTCCGTGTGGTCAGCACGAGTGGCGAGCAGC  1471

Query 1250  TGAAGGTGTACAAGTGCGAACACTGCCGGGTGCTCTTCCTGGATCACGTCATGTACACCATCCACATGGGCTGC  1323
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1472  TGAAGGTGTACAAGTGCGAACACTGCCGCGTGCTCTTCCTGGATCACGTCATGTATACCATTCACATGGGCTGC  1545

Query 1324  CACGGCTTCCGTGATCCTTTTGAGTGCAACATGTGCGGCTACCACAGCCAGGACCGGTACGAGTTCTCGTCGCA  1397
            ||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||.|||||||||||||.||.||
Sbjct 1546  CATGGCTTTCGGGATCCCTTTGAGTGTAACATGTGTGGTTATCACAGCCAGGACAGGTACGAGTTCTCATCCCA  1619

Query 1398  CATAACGCGAGGGGAGCACCGCTTCCACATGAGC  1431
            .||.|||||.||||||||.||.|.||||.|||||
Sbjct 1620  TATCACGCGGGGGGAGCATCGTTACCACCTGAGC  1653