Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_11482
- Subject:
- XM_011243707.2
- Aligned Length:
- 1515
- Identities:
- 1219
- Gaps:
- 129
Alignment
Query 1 ATGGATGCTGATGAGGGTCAAGACATGTCCCAAGTTTCAGGGAAGGAAAGCCCCCCTGTAAGCGATACTCCAGA 74
|||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||.||.||||||||
Sbjct 1 ATGGATGTCGATGAGGGTCAAGACATGTCCCAAGTTTCAGGAAAGGAGAGCCCCCCAGTCAGTGACACTCCAGA 74
Query 75 TGAGGGCGATGAGCCCATGCCGATCCCCGAGGACCTCTCCACCACCTCGGGAGGACAGCAAAGCTCCAAGAGTG 148
|||.||.||||||||||||||..||||.||||||||.|||||.|||||.||||.||||||.|.|||||||||||
Sbjct 75 TGAAGGGGATGAGCCCATGCCTGTCCCTGAGGACCTGTCCACTACCTCTGGAGCACAGCAGAACTCCAAGAGTG 148
Query 149 ACAGAGTCGTGG------------------------------------------------------------CC 162
|..|||.|.||| ||
Sbjct 149 ATCGAGGCATGGTTGCATATGGGGCTGATGGCTTTAGGGATTTTCATGCAATAATTCCCAAATCTTTCTCTCCC 222
Query 163 AGTAATGTTAAAGTAGAGACTCAGAGTGATGAAGAGAATGGGCGTGCCTGTGAAATGAATGGGGAAGAATGTGC 236
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AGTAATGTTAAAGTAGAGACTCAGAGTGATGAAGAGAATGGGCGTGCCTGTGAAATGAATGGGGAAGAATGTGC 296
Query 237 GGAGGATTTACGAATGCTTGATGCCTCGGGAGAGAAAATGAATGGCTCCCACAGGGACCAAGGCAGCTCGGCTT 310
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGAGGATTTACGAATGCTTGATGCCTCGGGAGAGAAAATGAATGGCTCCCACAGGGACCAAGGCAGCTCGGCTT 370
Query 311 TGTCGGGAGTTGGAGGCATTCGACTTCCTAACGGAAAACTAAAGTGTGATATCTGTGGGATCATTTGCATCGGG 384
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 371 TGTCAGGAGTTGGAGGCATTCGACTTCCTAACGGAAAACTAAAGTGTGATATCTGTGGGATCGTTTGCATCGGG 444
Query 385 CCCAATGTGCTCATGGTTCACAAAAGAAGCCACACTGGAGAACGGCCCTTCCAGTGCAATCAGTGCGGGGCCTC 458
|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 445 CCCAATGTGCTCATGGTTCACAAAAGAAGTCATACTGGTGAACGGCCTTTCCAGTGCAACCAGTGTGGGGCCTC 518
Query 459 ATTCACCCAGAAGGGCAACCTGCTCCGGCACATCAAGCTGCATTCCGGGGAGAAGCCCTTCAAATGCCACCTCT 532
.||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 519 CTTTACCCAGAAAGGCAACCTCCTGCGGCACATCAAGCTGCACTCGGGTGAGAAGCCCTTCAAATGCCATCTTT 592
Query 533 GCAACTACGCCTGCCGCCGGAGGGACGCCCTCACTGGCCACCTGAGGACGCACTCCGTCATTAAAGAAGAAACT 606
|||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||...||| .
Sbjct 593 GCAACTATGCCTGCCGCCGGAGGGACGCCCTCACCGGCCACCTGAGGACGCACTCCGTTGGTAA---------G 657
Query 607 AATCACA---GTGAA----ATGGCAGAAGACCTGTGCAAGATAGGATCAGAG-AGATCTCTCGTGCTGGACAGA 672
..||||| |||.| .||||.| ||.|| ||| |.|||.| ||.|||.| |||
Sbjct 658 CCTCACAAATGTGGATATTGTGGCCG--GAGCT-------ATA--AACAGCGAAGCTCTTT----------AGA 710
Query 673 CTAGCAAGTAA----CGTCGCCA-AACGTA-----AGAGCTCTAT--GCCT--CAGAAATTT--CTTGGGGACA 730
..|||| ||| ||..|||| ||| || |.||| || |||| |.|..||.| |..||.||||
Sbjct 711 GGAGCA--TAAAGAGCGATGCCACAAC-TACTTGGAAAGC---ATGGGCCTTCCGGGCATGTACCCAGGAGACA 778
Query 731 AGGGCCTGTCCGACACGCCCTACGACAGCAGCGCCAGCTACGAGAAGGAGAACGAAATGATGAAGTCCCACGTG 804
||.|||||||.||||.||||||.|| |||.||||.|||.||||||||| ||.|||||||..|||||||||
Sbjct 779 AGTGCCTGTCAGACATGCCCTATGA---CAGTGCCAACTATGAGAAGGAG---GATATGATGACATCCCACGTG 846
Query 805 ATGGACCAAGCCATCAACAACGCCATCAACTACCTGGGGGCCGAGTCCCTGCGCCCGCTGGTGCAGACGCCCCC 878
||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||..||||||||||.|||||
Sbjct 847 ATGGACCAGGCCATCAACAATGCCATCAACTACCTGGGGGCTGAGTCCCTGCGCCCATTGGTGCAGACACCCCC 920
Query 879 GGGCGGTTCCGAGGTGGTCCCGGTCATCAGCCCGATGTACCAGCTGCACAAGCCGCTCGCGGAGGGCACCCCGC 952
.||..|.|||||||||||.||.|||||||||.|.||||||||||||||||||||.|.|.|.||.|||.||||.|
Sbjct 921 CGGTAGCTCCGAGGTGGTGCCAGTCATCAGCTCCATGTACCAGCTGCACAAGCCCCCCTCAGATGGCCCCCCAC 994
Query 953 GCTCCAACCACTCGGCCCAGGACAGCGCCGTGGAGAACCTGCTGCTGCTCTCCAAGGCCAAGTTGGTGCCCTCG 1026
|.||||||||.||.||.||||| |||||||||.|||.||||||||||.|||||||||||||..|||.|.|||
Sbjct 995 GGTCCAACCATTCAGCACAGGA---CGCCGTGGATAACTTGCTGCTGCTGTCCAAGGCCAAGTCTGTGTCATCG 1065
Query 1027 GAGCGCGAGGCGTCCCCGAGCAACAGCTGCCAAGACTCCACGGACACCGAGAGCAACAACGAGGAGCAGCGCAG 1100
|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||...|||||.||||||||
Sbjct 1066 GAGCGAGAGGCCTCCCCGAGCAACAGCTGCCAAGACTCCACAGATACAGAGAGCAACGCGGAGGAACAGCGCAG 1139
Query 1101 CGGTCTCATCTACCTGACCAACCACATCGCCCCGCACGCGCGCAACGGGCTGTCGCTCAAGGAGGAGCACCGCG 1174
|||.||.||||||||.||||||||||||..||||||.||.|||||.||||||.|.||||||||||||||.||||
Sbjct 1140 CGGCCTTATCTACCTAACCAACCACATCAACCCGCATGCACGCAATGGGCTGGCTCTCAAGGAGGAGCAGCGCG 1213
Query 1175 CCTACGACCTGCTGCGCGCCGCCTCCGAGAACTCGCAGGACGCGCTCCGCGTGGTCAGCACCAGCGGGGAGCAG 1248
|||||||..|||||.|.||.|||||.||||||||||||||.||..||||.|||||||||||.||.||.||||||
Sbjct 1214 CCTACGAGGTGCTGAGGGCGGCCTCAGAGAACTCGCAGGATGCCTTCCGTGTGGTCAGCACGAGTGGCGAGCAG 1287
Query 1249 ATGAAGGTGTACAAGTGCGAACACTGCCGGGTGCTCTTCCTGGATCACGTCATGTACACCATCCACATGGGCTG 1322
.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1288 CTGAAGGTGTACAAGTGCGAACACTGCCGCGTGCTCTTCCTGGATCACGTCATGTATACCATTCACATGGGCTG 1361
Query 1323 CCACGGCTTCCGTGATCCTTTTGAGTGCAACATGTGCGGCTACCACAGCCAGGACCGGTACGAGTTCTCGTCGC 1396
|||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||.|||||||||||||.||.|
Sbjct 1362 CCATGGCTTTCGGGATCCCTTTGAGTGTAACATGTGTGGTTATCACAGCCAGGACAGGTACGAGTTCTCATCCC 1435
Query 1397 ACATAACGCGAGGGGAGCACCGCTTCCACATGAGC 1431
|.||.|||||.||||||||.||.|.||||.|||||
Sbjct 1436 ATATCACGCGGGGGGAGCATCGTTACCACCTGAGC 1470