Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_11501
- Subject:
- NM_001037754.3
- Aligned Length:
- 1569
- Identities:
- 1270
- Gaps:
- 126
Alignment
Query 1 ATGTCTTTGTCTCGCTCAGAGGAGATGCACCGGCTCACGGAAAATGTCTATAAGACCATCATGGAGCAGTTCAA 74
|||||..|.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCGCTTTCACGCTCGGAGGAGATGCACCGGCTCACGGAAAATGTCTACAAGACCATCATGGAGCAGTTCAA 74
Query 75 CCCTAGCCTCCGGAACTTCATCGCCATGGGGAAGAATTACGAGAAGGCACTGGCAGGTGTGACGTATGCAGCCA 148
|||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||.||.|..||.||||
Sbjct 75 CCCCAGCCTCCGCAACTTCATCGCCATGGGCAAGAACTATGAGAAAGCACTGGCAGGTGTCACCTTCGCTGCCA 148
Query 149 AAGGCTACTTTGACGCCCTGGTGAAGATGGGGGAGCTGGCCAGCGAGAGCCAGGGCTCCAAAGAACTCGGAGAC 222
|||||||.||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||
Sbjct 149 AAGGCTATTTCGATGCTCTGGTAAAGATGGGGGAGCTGGCCAGCGAGAGCCAGGGCTCTAAGGAACTTGGGGAC 222
Query 223 GTTCTCTTCCAGATGGCTGAAGTCCACAGGCAGATCCAGAATCAGCTGGAAGAAATGCTGAAGTCTTTTCACAA 296
||.|||||||||||||||||.||.|||.|||||||||||||.|||.|||||||.|.||||||||||||||||||
Sbjct 223 GTCCTCTTCCAGATGGCTGAGGTGCACCGGCAGATCCAGAACCAGTTGGAAGAGACGCTGAAGTCTTTTCACAA 296
Query 297 CGAGCTGCTTACGCAGCTGGAGCAGAAGGTGGAGCTGGACTCCAGGTATCTGAGTGCTGCGCTGAAGAAATACC 370
.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 297 TGAGCTGCTCACGCAGCTGGAGCAGAAAGTAGAACTGGACTCCAGGTATCTAAGTGCTGCACTGAAGAAATACC 370
Query 371 AGACTGAGCAAAGGAGCAAAGGCGACGCCCTGGACAAGTGTCAGGCTGAGCTGAAGAAGCTTCGGAAGAAGAGC 444
|.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 371 AAACGGAACAGAGGAGCAAAGGGGACGCCCTGGACAAGTGTCAGGCTGAGCTGAAGAAGCTCCGCAAGAAGAGC 444
Query 445 CAGGGCAGCAAGAATCCTCAGAAGTACTCGGACAAGGAGCTGCAGTACATCGACGCCATCAGCAACAAGCAGGG 518
||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 445 CAAGGGAGTAAGAACCCTCAGAAGTACTCAGACAAGGAGCTGCAGTACATCGATGCCATCAGCAATAAGCAGGG 518
Query 519 CGAGCTGGAGAATTACGTGTCCGACGGCTACAAGACCGCACTGACAGAGGAGCGCAGGCGCTTCTGCTTCCTGG 592
||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||.|.|||||||||||||
Sbjct 519 CGAGCTGGAGAACTACGTGTCTGACGGCTACAAGACAGCACTCACTGAGGAGCGCAGGAGGTTCTGCTTCCTGG 592
Query 593 TGGAGAAGCAGTGCGCCGTGGCCAAGAACTCCGCGGCCTACCACTCCAAGGGCAAGGAGCTGCTGGCGCAGAAG 666
||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||.|||||||.||||||
Sbjct 593 TGGAAAAGCAGTGCGCTGTGGCCAAGAACTCTGCTGCTTACCATTCCAAGGGCAAGGAGTTGCTGGCCCAGAAG 666
Query 667 CTGCCGCTGTGGCAACAGGCCTGTGCCGACCCCAGCAAGATCCCGGAGCGCGCGGTGCAGCTCATGCAGCAGGT 740
|||||.||||||||.||.||||||||||||||||.|||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||.|||.|
Sbjct 667 CTGCCTCTGTGGCAGCAAGCCTGTGCCGACCCCAACAAGATCCCAGACCGTGCTGTCCAGCTGATGCAACAGAT 740
Query 741 GGCC---AGCAACGGCGCCACCCTCCCCAGCGCCCTGTCGGCCTCCAAGTCCAACCTGGTCATTTCCGACCCCA 811
|||| |||||.|||.|||.|||.||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||.||||
Sbjct 741 GGCCAATAGCAATGGCTCCATCCTTCCAAGTGCCCTGTCAGCTTCCAAGTCCAACCTGGTCATCTCAGATCCCA 814
Query 812 TTCCGGGGGCCAAGCCCCTGCCGGTGCCCCCCGAGCTGGCACCGTTCGTGGGGCGGATGTCTGCCCAGGAGAGC 885
||||.||.|||||||||.||||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct 815 TTCCTGGAGCCAAGCCCTTGCCAGTGCCACCTGAGCTGGCACCATTTGTGGG---------------------- 866
Query 886 ACACCCATCATGAACGGCGTCACAGGCCCGGATGGCGAGGACTACAGCCCGTGGGCTGACCGCAAGGCTGCCCA 959
Sbjct 867 -------------------------------------------------------------------------- 866
Query 960 GCCCAAATCCCTGTCTCCTCCGCAGTCTCAGAGCAAGCTCAGCGACTCCTACTCCAACACACTCCCCGTGCGCA 1033
||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 867 ------------------------GTCTCAAAGCAAGCTGAGCGACTCGTACTCCAACACACTCCCCGTGCGCA 916
Query 1034 AGAGCGTGACCCCAAAAAACAGCTATGCCACCACAGCCGAGAACAAGACTCTGCCTCGCTCGAGCTCCATGGCA 1107
||||||||||.||.||.|||||||||||||||| |.|||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||
Sbjct 917 AGAGCGTGACGCCGAAGAACAGCTATGCCACCA---CTGAGAACAAGACACTGCCACGTTCAAGCTCCATGGCA 987
Query 1108 GCCGGCCTGGAGCGCAATGGCCGTATGCGGGTGAAGGCCATCTTCTCCCACGCTGCTGGGGACAACAGCACCCT 1181
||.|||||.||.||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||.||
Sbjct 988 GCTGGCCTAGAACGTAATGGCCGCATGCGGGTCAAGGCCATTTTCTCCCACGCGGCCGGTGACAATAGCACTCT 1061
Query 1182 CCTGAGCTTCAAGGAGGGTGACCTCATTACCCTGCTGGTGCCTGAGGCCCGCGATGGCTGGCACTACGGAGAGA 1255
.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 1062 GCTGAGCTTCAAGGAGGGCGACCTCATCACGCTGCTAGTGCCTGAGGCCCGTGACGGCTGGCACTATGGGGAGA 1135
Query 1256 GTGAGAAGACCAAGATGCGGGGCTGGTTTCCCTTCTCCTACACCCGGGTCTTGGACAGCGATGGCAGTGACAGG 1329
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||.||.||.||||||||.
Sbjct 1136 GTGAGAAGACCAAGATGCGGGGCTGGTTCCCCTTCTCCTACACCCGGGTCCTGGACAGTGACGGAAGTGACAGA 1209
Query 1330 CTGCACATGAGCCTGCAGCAAGGGAAGAGCAGCAGCACGGGCAACCTCCTGGACAAGGACGACCTGGCCATCCC 1403
.||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||.||||
Sbjct 1210 TTGCATATGAGCCTGCAGCAGGGCAAGAGCAGCAGCACAGGCAACCTCCTAGACAAGGATGACCTGGCCCTCCC 1283
Query 1404 ACCCCCCGATTACGGCGCCGCCTCCCGGGCCTTCCCCGCCCAGACGGCCAGCGGCTTCAAGCAGAGGCCCTACA 1477
.||.||.||.||||||.|..||||||||||.||||||.|||||||.|||.||...|||||||||||.|||||||
Sbjct 1284 CCCTCCTGACTACGGCACGTCCTCCCGGGCATTCCCCACCCAGACAGCCGGCACATTCAAGCAGAGACCCTACA 1357
Query 1478 GTGTGGCCGTGCCCGCCTTCTCCCAGGGCCTGGATGACTATGGAGCGCGGTCCATGAGCAGTGGCAGCGGCACG 1551
|.||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.|||||..|||||||||||||.||||||
Sbjct 1358 GCGTGGCCGTTCCTGCCTTCTCTCAGGGTCTGGATGACTACGGGGCACGGTCTGTGAGCAGTGGCAGTGGCACG 1431
Query 1552 CTGGTGTCCACAGTG 1566
|||||||||||||||
Sbjct 1432 CTGGTGTCCACAGTG 1446