Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11501
• Subject: XM_006531969.3
• Aligned Length: 1608
• Identities: 1259
• Gaps: 165

Alignment

Query    1  ATGTCTTTGTCTCGCTCAGAGGAGATGCACCGGCTCACGGAAAATGTCTATAAGACCATCATGGAGCAGTTCAA  74
            |||||..|.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCGCTTTCACGCTCGGAGGAGATGCACCGGCTCACGGAAAATGTCTACAAGACCATCATGGAGCAGTTCAA  74

Query   75  CCCTAGCCTCCGGAACTTCATCGCCATGGGGAAGAATTACGAGAAGGCACTGGCAGGTGTGACGTATGCAGCCA  148
            |||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||.||.|..||.||||
Sbjct   75  CCCCAGCCTCCGCAACTTCATCGCCATGGGCAAGAACTATGAGAAAGCACTGGCAGGTGTCACCTTCGCTGCCA  148

Query  149  AAGGCTACTTTGACGCCCTGGTGAAGATGGGGGAGCTGGCCAGCGAGAGCCAGGGCTCCAAAGAACTCGGAGAC  222
            |||||||.||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||
Sbjct  149  AAGGCTATTTCGATGCTCTGGTAAAGATGGGGGAGCTGGCCAGCGAGAGCCAGGGCTCTAAGGAACTTGGGGAC  222

Query  223  GTTCTCTTCCAGATGGCTGAAGTCCACAGGCAGATCCAGAATCAGCTGGAAGAAATGCTGAAGTCTTTTCACAA  296
            ||.|||||||||||||||||.||.|||.|||||||||||||.|||.|||||||.|.||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTCCTCTTCCAGATGGCTGAGGTGCACCGGCAGATCCAGAACCAGTTGGAAGAGACGCTGAAGTCTTTTCACAA  296

Query  297  CGAGCTGCTTACGCAGCTGGAGCAGAAGGTGGAGCTGGACTCCAGGTATCTGAGTGCTGCGCTGAAGAAATACC  370
            .||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct  297  TGAGCTGCTCACGCAGCTGGAGCAGAAAGTAGAACTGGACTCCAGGTATCTAAGTGCTGCACTGAAGAAATACC  370

Query  371  AGACTGAGCAAAGGAGCAAAGGCGACGCCCTGGACAAGTGTCAGGCTGAGCTGAAGAAGCTTCGGAAGAAGAGC  444
            |.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct  371  AAACGGAACAGAGGAGCAAAGGGGACGCCCTGGACAAGTGTCAGGCTGAGCTGAAGAAGCTCCGCAAGAAGAGC  444

Query  445  CAGGGCAGCAAGAATCCTCAGAAGTACTCGGACAAGGAGCTGCAGTACATCGACGCCATCAGCAACAAGCAGGG  518
            ||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct  445  CAAGGGAGTAAGAACCCTCAGAAGTACTCAGACAAGGAGCTGCAGTACATCGATGCCATCAGCAATAAGCAGGG  518

Query  519  CGAGCTGGAGAATTACGTGTCCGACGGCTACAAGACCGCACTGACAGAGGAGCGCAGGCGCTTCTGCTTCCTGG  592
            ||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||.|.|||||||||||||
Sbjct  519  CGAGCTGGAGAACTACGTGTCTGACGGCTACAAGACAGCACTCACTGAGGAGCGCAGGAGGTTCTGCTTCCTGG  592

Query  593  TGGAGAAGCAGTGCGCCGTGGCCAAGAACTCCGCGGCCTACCACTCCAAGGGCAAGGAGCTGCTGGCGCAGAAG  666
            ||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||.|||||||.||||||
Sbjct  593  TGGAAAAGCAGTGCGCTGTGGCCAAGAACTCTGCTGCTTACCATTCCAAGGGCAAGGAGTTGCTGGCCCAGAAG  666

Query  667  CTGCCGCTGTGGCAACAGGCCTGTGCCGACCCCAGCAAGATCCCGGAGCGCGCGGTGCAGCTCATGCAGCAGGT  740
            |||||.||||||||.||.||||||||||||||||.|||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||.|||.|
Sbjct  667  CTGCCTCTGTGGCAGCAAGCCTGTGCCGACCCCAACAAGATCCCAGACCGTGCTGTCCAGCTGATGCAACAGAT  740

Query  741  GGCC---AGCAACGGCGCCACCCTCCCCAGCGCCCTGTCGGCCTCCAAGTCCAACCTGGTCATTTCCGACCCCA  811
            ||||   |||||.|||.|||.|||.||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||.||||
Sbjct  741  GGCCAATAGCAATGGCTCCATCCTTCCAAGTGCCCTGTCAGCTTCCAAGTCCAACCTGGTCATCTCAGATCCCA  814

Query  812  TTCCGGGGGCCAAGCCCCTGCCGGTGCCCCCCGAGCTGGCACCGTTCGTGGGGCGGATGTCTGCCCAGGAGAGC  885
            ||||.||.|||||||||.||||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||                      
Sbjct  815  TTCCTGGAGCCAAGCCCTTGCCAGTGCCACCTGAGCTGGCACCATTTGTGGG----------------------  866

Query  886  ACACCCATCATGAACGGCGTCACAGGCCCGGATGGCGAGGACTACAGCCCGTGGGCTGACCGCAAGGCTGCCCA  959
                                                                                      
Sbjct  867  --------------------------------------------------------------------------  866

Query  960  GCCCAAATCCCTGTCTCCTCCGCAGTCTCAGAGCAAGCTCAGCGACTCCTACTCCAACACACTCCCCGTGCGCA  1033
                                    ||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  867  ------------------------GTCTCAAAGCAAGCTGAGCGACTCGTACTCCAACACACTCCCCGTGCGCA  916

Query 1034  AGAGCGTGACCCCAAAAAACAGCTATGCCACCACAGCCGAGAACAAGACTCTGCCTCGCTCGAGCTCCATGGCA  1107
            ||||||||||.||.||.||||||||||||||||   |.|||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||
Sbjct  917  AGAGCGTGACGCCGAAGAACAGCTATGCCACCA---CTGAGAACAAGACACTGCCACGTTCAAGCTCCATGGCA  987

Query 1108  GCCGGCCTGGAGCGCAATGGCCGTATGCGGGTGAAGGCCATCTTCTCCCACGCTGCTGGGGACAACAGCACCCT  1181
            ||.|||||.||.||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||.||
Sbjct  988  GCTGGCCTAGAACGTAATGGCCGCATGCGGGTCAAGGCCATTTTCTCCCACGCGGCCGGTGACAATAGCACTCT  1061

Query 1182  CCTGAGCTTCAAGGAGGGTGACCTCATTACCCTGCTGGTGCCTGAGGCCCGCGATGGCTGGCACTACGGAGAGA  1255
            .|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 1062  GCTGAGCTTCAAGGAGGGCGACCTCATCACGCTGCTAGTGCCTGAGGCCCGTGACGGCTGGCACTATGGGGAGA  1135

Query 1256  GTGAGAAGACCAAGATGCGGGGCTGGTTTCCCTTCTCCTACACCCGGGTCTTGGACAGCGATGGCAGTGACAGG  1329
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||.||.||.||||||||.
Sbjct 1136  GTGAGAAGACCAAGATGCGGGGCTGGTTCCCCTTCTCCTACACCCGGGTCCTGGACAGTGACGGAAGTGACAGA  1209

Query 1330  CTGCACATGAGCCTGCAGCAAGGGAAGAGCAGCAGCACGGGCAACCTCCTGGACAAGGACGACCTGGCCATCCC  1403
            .||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||.||||
Sbjct 1210  TTGCATATGAGCCTGCAGCAGGGCAAGAGCAGCAGCACAGGCAACCTCCTAGACAAGGATGACCTGGCCCTCCC  1283

Query 1404  ACCCCCCGATTACGGCGCCGCCTCCCGGGCCTTCCCCGCCCAGACGGCCAGCGGCTTCAAGCAGAGGCCCTACA  1477
            .||.||.||.||||||.|..||||||||||.||||||.|||||||.|||.||...|||||||||||.|||||||
Sbjct 1284  CCCTCCTGACTACGGCACGTCCTCCCGGGCATTCCCCACCCAGACAGCCGGCACATTCAAGCAGAGACCCTACA  1357

Query 1478  GTGTGGCCGTGCCCGCCTTCTCCCAGGGCCTGGATGACTATGGAGCGCGGTCCATGAGCAG---------TGGC  1542
            |.||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.|||||..|||||||         .|.|
Sbjct 1358  GCGTGGCCGTTCCTGCCTTCTCTCAGGGTCTGGATGACTACGGGGCACGGTCTGTGAGCAGGAATCCCTTCGCC  1431

Query 1543  AGCGGCACGCTGGTGTCCACAGTG------------------------------  1566
            |.||.|...|||....|.||||||                              
Sbjct 1432  AACGTCCATCTGAAACCAACAGTGACCAATGACAGATCAGCCCCTCTGCTCAGC  1485