Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11537
• Subject: XM_006513097.3
• Aligned Length: 2642
• Identities: 2120
• Gaps: 214

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCATGTATGTTTTAAAGGAAATGTGTCATCCCTATGGCCCAGAGCTCTTGACCAAGGTGACAGCAGTTCCAG  74

Query    1  -------------ATGTCT------------TCCACGGG------GCA-----CCCTGGCTCCT-ACAAAATAT  37
                         ||||||            |.|| |||      |||     |||.||.||.| ||     ||
Sbjct   75  GAAGACAGCCACTATGTCTCTGAGCAGTGCCTTCA-GGGCTGTGAGCAACGACCCCCGGATCATCAC-----AT  142

Query   38  GGGGA---GAGAAAATGGAGCTGGCGCTGGTGCCTGTGAGCGCCCACGGCAACTTCTATGAGGGGGACTGCTAC  108
            ||.||   ||||||||||||||||||||||||||..||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct  143  GGAGAATTGAGAAAATGGAGCTGGCGCTGGTGCCCCTGAGTGCTCACGGCAACTTCTACGAGGGAGACTGCTAC  216

Query  109  GTCATCCTCTCGACCCGGAGAGTGGCCAGTCTCCTATCCCAGGACATCCACTTCTGGATCGGGAAGGACTCCTC  182
            .||.|||||||||||||||||||||.|||.||.||.||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  217  ATCGTCCTCTCGACCCGGAGAGTGGGCAGCCTTCTCTCCCAGAACATCCACTTTTGGATCGGGAAGGACTCCTC  290

Query  183  CCAGGATGAGCAAAGCTGCGCAGCCATATATACCACACAGCTGGACGACTACCTGGGAGGCAGCCCTGTGCAGC  256
            ||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  291  CCAGGACGAGCAGAGCTGCGCGGCCATCTATACCACACAGCTGGATGACTACCTGGGAGGCAGCCCGGTGCAGC  364

Query  257  ACCGAGAGGTCCAGTACCATGAGTCAGACACTTTCCGTGGCTACTTCAAGCAGGGCATCATCTACAAGCAGGGG  330
            ||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||..|||||
Sbjct  365  ACCGTGAGGTCCAGTACCACGAGTCCGACACCTTCCGTGGCTACTTCAAGCAGGGCATCATCTATAAAAAGGGG  438

Query  331  GGTGTCGCCTCTGGGATGAAGCACGTGGAGACCAATACCTACGACGTGAAGCGGCTGCTACATGTGAAAGGGAA  404
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||.||||||||||.||.||.|||||
Sbjct  439  GGTGTGGCCTCTGGGATGAAGCACGTGGAGACCAACACCTATGATGTGAAGAGGCTGCTACACGTAAAGGGGAA  512

Query  405  AAGAAACATC----------AGG----------------------------------GCTACCG----------  424
            ||||||||||          |||                                  |||.|||          
Sbjct  513  AAGAAACATCCAAGCCACGGAGGTGAGTCTCACACGTGAGTGTCCTGGGTGCCCGGTGCTCCCGCCCTGGCACC  586

Query  425  ------------------------------------AGGTGGAAATGAGCTGGGACAGTTTCAACCGAGGTGAT  462
                                                ||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||
Sbjct  587  TAAGACTGCCCCGAACCGCTCTGACTGCTCACACGCAGGTGGAAATGAGCTGGGACAGCTTTAACCGAGGCGAT  660

Query  463  GTCTTCTTGCTGGACCTTGGGAAAGTCATCATCCAATGGAATGGCCCAGAGAGCAACAGTGGGGAGCGCCTGAA  536
            ||||||.|||||||||||||||..|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct  661  GTCTTCCTGCTGGACCTTGGGATGGTCATCATCCAGTGGAATGGCCCGGAGAGCAACAGTGGGGAACGTCTCAA  734

Query  537  GGCTATGCTTCTGGCAAAGGATATTCGAGACAGGGAGCGAGGGGGCCGTGCTGAAATAGGAGTGATCGAGGGAG  610
            |||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||
Sbjct  735  GGCTATGCTTCTGGCAAAGGACATTCGGGACAGGGAGCGAGGGGGCCGTGCTGAAATTGGGGTGATTGAGGGAG  808

Query  611  ACAAGGAGGCAGCCAGCCCAGAGCTGATGAAGGTCCTTCAGGACACCCTTGGCCGACGCTCCATTATCAAGCCT  684
            ||||||||||.||||||||||.||||||||..|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||
Sbjct  809  ACAAGGAGGCGGCCAGCCCAGGGCTGATGACAGTCCTCCAGGATACCCTTGGTCGACGCTCCATGATAAAGCCT  882

Query  685  ACAGTCCCTGATGAGATCATAGATCAGAAGCAGAAATCAACTATCATGTTGTATCATATCTCAGATTCAGCTGG  758
            .||||..|||||||||||||.||.||..|.||||||||||.|||||||||.||||||.||||.||..|||||||
Sbjct  883  GCAGTTTCTGATGAGATCATGGACCAACAACAGAAATCAAGTATCATGTTATATCATGTCTCCGACACAGCTGG  956

Query  759  GCAGCTGGCAGTCACAGAGGTAGCAACAAGGCCTCTGGTCCAGGACTTACTGAACCATGATGACTGCTACATCC  832
            |||||||.|||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  957  GCAGCTGTCAGTCACAGAGGTGGCAACAAGGCCCCTGGTCCAGGACCTACTGAACCACGATGACTGCTACATCC  1030

Query  833  TGGACCAAAGTGGAACCAAAATCTACGTGTGGAAAGGAAAAGGAGCCACAAAGGCTGAAAAACAGGCAGCCATG  906
            |||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||.|||.||||||||.||||||
Sbjct 1031  TGGACCAAAGTGGCACCAAGATCTACGTGTGGAAAGGCAAAGGAGCCACCAAGGTTGAGAAACAGGCGGCCATG  1104

Query  907  TCTAAAGCGCTGGGCTTCATCAAGATGAAGAGCTACCCCAGCAGCACCAATGTGGAGACCGTCAACGATGGTGC  980
            ||.|||||.||||..|||||||||||||||.|.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1105  TCCAAAGCCCTGGATTTCATCAAGATGAAGGGATACCCCAGCAGCACCAACGTGGAGACCGTCAACGATGGCGC  1178

Query  981  TGAGTCGGCCATGTTCAAGCAGCTGTTCCAGAAGTGGTCAGTAAAGGACCAGACCATGGGCCTGGGGAAAACGT  1054
            .|||||||||||||||||.|||.||||||||||.|||||.||.|||||||||||||.||||.|||||||||..|
Sbjct 1179  AGAGTCGGCCATGTTCAAACAGTTGTTCCAGAAATGGTCGGTGAAGGACCAGACCACGGGCTTGGGGAAAATAT  1252

Query 1055  TCAGCATTGGTAAAATTGCTAAAGTTTTCCAGGATAAATTTGATGTGACTCTGCTACACACCAAGCCAGAGGTA  1128
            ||||||.|||||||||.||||||.|.||||||||.||.||.||||||.||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1253  TCAGCACTGGTAAAATCGCTAAAATCTTCCAGGACAAGTTCGATGTGTCTCTGCTACACACCAAGCCAGAAGTG  1326

Query 1129  GCTGCCCAGGAAAGAATGGTCGATGATGGCAACGGAAAAGTTGAGGTCTGGAGAATTGAGAACCTGGAGCTGGT  1202
            |||||.|||||.||||||||.||.||.|||||.||..|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1327  GCTGCACAGGAGAGAATGGTGGACGACGGCAAAGGCCAGGTTGAGGTCTGGAGAATTGAGAACCTGGAGCTGGT  1400

Query 1203  CCCTGTGGAGTATCAATGGTATGGCTTCTTTTATGGGGGAGACTGTTATCTGGTCCTCTACACATACGAGGTAA  1276
            |||.|||||.||.||.|||.||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.|
Sbjct 1401  CCCCGTGGAATACCAGTGGCATGGCTTCTTCTACGGGGGAGACTGCTATCTGGTTCTCTACACGTACGATGTGA  1474

Query 1277  ATGGGAAGCCACATCACATCTTGTACATCTGGCAGGGCCGCCACGCCTCACAGGATGAGCTGGCAGCCTCAGCA  1350
            |.|||||.||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||.|.|||||||||||||||||||||.
Sbjct 1475  ACGGGAAACCCCATTACATCTTGTACATCTGGCAGGGCCGCCACGCATCCCGGGATGAGCTGGCAGCCTCAGCC  1548

Query 1351  TACCAGGCAGTGGAGGTGGATCGGCAGTTTGATGGGGCTGCTGTGCAGGTTCGAGTCAGGATGGGAACGGAGCC  1424
            ||.|.|||||||||||||||||.||||||||||||.||..||||||||||.||.||.||.|||||.|.||||||
Sbjct 1549  TATCGGGCAGTGGAGGTGGATCAGCAGTTTGATGGAGCCCCTGTGCAGGTCCGGGTTAGCATGGGGAAGGAGCC  1622

Query 1425  ACGCCACTTCATGGCCATCTTCAAAGGGAAGCTAGTTATCTTTGAGGGTGGGACTTCCAGGAAGGGAAATGCCG  1498
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||..|||||.||||||||||||||||||||.|..|
Sbjct 1623  ACGCCACTTCATGGCCATCTTCAAAGGAAAGCTGGTTATCTACGAGGGCGGGACTTCCAGGAAGGGAAACGAGG  1696

Query 1499  AGCCTGACCCTCCAGTAAGACTCTTCCAAATTCATGGAAATGACAAATCTAACACCAAAGCAGTGGAAGTTCCA  1572
            ||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||..|.
Sbjct 1697  AGCCGGACCCTCCAGTAAGGCTCTTCCAGATCCACGGGAACGACAAATCCAACACCAAAGCAGTGGAGGTCTCG  1770

Query 1573  GCCTTTGCCTCCTCCCTAAACTCCAATGATGTCTTTCTGCTGCGAACTCAGGCAGAGCACTACCTGTGGTATGG  1646
            ||||.|||.|||||.||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1771  GCCTCTGCTTCCTCGCTCAACTCCAACGACGTCTTTCTGCTGCGGACTCAGGCAGAGCACTACCTGTGGTACGG  1844

Query 1647  CAAGGGGTCTAGTGGGGATGAGCGGGCAATGGCTAAGGAGCTGGCCAGCCTTCTCTGTGATGGCAGCGAGAACA  1720
            ||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||.|..|||||||||||||||||..|.|.|||
Sbjct 1845  CAAGGGGTCTAGTGGGGACGAGCGGGCGATGGCTAAGGAGCTGGTCGACCTTCTCTGTGATGGCAATGCGGACA  1918

Query 1721  CTGTGGCCGAGGGCCAGGAGCCAGCCGAGTTCTGGGACCTACTGGGAGGGAAAACTCCCTATGCCAATGATAAA  1794
            |||||||.|||||||||||||||.|.||||||||||||||.||||||||.|||||..||||.||.|||||.|||
Sbjct 1919  CTGTGGCTGAGGGCCAGGAGCCACCTGAGTTCTGGGACCTTCTGGGAGGAAAAACAGCCTACGCTAATGACAAA  1992

Query 1795  AGACTTCAGCAGGAAATCCTAGATGTCCA-GTCTCGTCTCTTTGAATGTTCCAATAAGACCGGCCAATTCGTTG  1867
            ||.||.|||||.||||.|||.||.||||| ||| ||.||||||||.||||||||||||||.||||..|||.|||
Sbjct 1993  AGGCTGCAGCAAGAAACCCTGGACGTCCAGGTC-CGGCTCTTTGAGTGTTCCAATAAGACTGGCCGCTTCCTTG  2065

Query 1868  TCACTGAGATCACAGACTTCACCCAGGATGACCTGAACCCTACTGACGTGATGCTCCTAGATACCTGGGACCAG  1941
            |.||.|||.||||.||||||||||||||.|||||||.|||...|||.||||||||.||.||.||||||||||||
Sbjct 2066  TTACGGAGGTCACGGACTTCACCCAGGAGGACCTGAGCCCAGGTGATGTGATGCTTCTGGACACCTGGGACCAG  2139

Query 1942  GTGTTCTTGTGGATTGGGGCTGAGGCCAATGCCACGGAGAAGGAGAGTGCCCTTGCCACAGCACAGCAGTACCT  2015
            ||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||.||.|.|||||..|.||.||.|||.|||||||
Sbjct 2140  GTGTTCTTGTGGATAGGAGCGGAGGCCAATGCCACGGAGAAGAAGGGGGCCCTCTCGACGGCTCAGGAGTACCT  2213

Query 2016  GCACACTCACCCCAGCGGCCGAGATCCCGACACACCAATCCTGATCATTAAGCAGGGGTTTGAGCCTCCCATCT  2089
            |..|||.||.||.||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||.||||||||.||||.||
Sbjct 2214  GGTCACACATCCTAGTGGCCGAGACCCCGACACACCGATTCTGATCATCAAACAGGGCTTTGAGCCCCCCACCT  2287

Query 2090  TCACAGGCTGGTTCCTAGCCTGGGACCCTAACATTTGGAGTGCAGGAAAAACATATGAACAATTAAAAGAA-GA  2162
            ||||||||||||||||.||.|||||||||.||||||||||.|.|||||||.|||||||.||..| |||||| ||
Sbjct 2288  TCACAGGCTGGTTCCTGGCATGGGACCCTCACATTTGGAGCGAAGGAAAATCATATGAGCAGCT-AAAGAACGA  2360

Query 2163  GCTGGGAGATGCTGCTGCTATCATGCGAATCACTGCTGACATGAAGAATGCAACCCTCTCCCTGAATTCTAATG  2236
            ||||||||||||..||||.||..||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|.|||||||.|||.||
Sbjct 2361  GCTGGGAGATGCAACTGCCATTGTGCGAATCACCGCTGACATGAAGAACGCAACACTTTACCTGAATCCTAGTG  2434

Query 2237  ACAGTGAGCCAAAATATTACCCTATAGCAGTTCTGTTGAAAAACCAGAATCAGGAGCTGCCTGAGGATGTAAAC  2310
            ||.||||||||||.||.|||||..|.|.|||||||.|||||...|||||.||||||||||||||||||||..||
Sbjct 2435  ACGGTGAGCCAAAGTACTACCCGGTGGAAGTTCTGCTGAAAGGTCAGAACCAGGAGCTGCCTGAGGATGTGGAC  2508

Query 2311  CCTGCCAAAAAGGAGAATTACCTCTCTGAACAGGACTTTGTGTCTGTGTTTGGCATCACAAGAGGGCAATTTGC  2384
            ||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||..|
Sbjct 2509  CCCGCCAAAAAGGAGAACTACCTCTCGGAACAAGACTTTGTATCTGTGTTTGGCATCACGAGAGGGCAGTTCAC  2582

Query 2385  AGCTCTGCCTGGCTGGAAACAGCTCCAAATGAAGAAAGAAAAGGGGCTTTTC  2436
            .||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||.|||.||||||
Sbjct 2583  TGCTCTGCCTGGCTGGAAACAGCTCCAGCTGAAGAAAGAAAGGGGCCTTTTC  2634