Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_11537
- Subject:
- XM_006513099.3
- Aligned Length:
- 2555
- Identities:
- 2120
- Gaps:
- 127
Alignment
Query 1 ATGTCT------------TCCACGGG------GCA-----CCCTGGCTCCT-ACAAAATATGGGGA---GAGAA 47
|||||| |.|| ||| ||| |||.||.||.| || ||||.|| |||||
Sbjct 1 ATGTCTCTGAGCAGTGCCTTCA-GGGCTGTGAGCAACGACCCCCGGATCATCAC-----ATGGAGAATTGAGAA 68
Query 48 AATGGAGCTGGCGCTGGTGCCTGTGAGCGCCCACGGCAACTTCTATGAGGGGGACTGCTACGTCATCCTCTCGA 121
|||||||||||||||||||||..||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||.||.|||||||||
Sbjct 69 AATGGAGCTGGCGCTGGTGCCCCTGAGTGCTCACGGCAACTTCTACGAGGGAGACTGCTACATCGTCCTCTCGA 142
Query 122 CCCGGAGAGTGGCCAGTCTCCTATCCCAGGACATCCACTTCTGGATCGGGAAGGACTCCTCCCAGGATGAGCAA 195
||||||||||||.|||.||.||.||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 143 CCCGGAGAGTGGGCAGCCTTCTCTCCCAGAACATCCACTTTTGGATCGGGAAGGACTCCTCCCAGGACGAGCAG 216
Query 196 AGCTGCGCAGCCATATATACCACACAGCTGGACGACTACCTGGGAGGCAGCCCTGTGCAGCACCGAGAGGTCCA 269
||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 217 AGCTGCGCGGCCATCTATACCACACAGCTGGATGACTACCTGGGAGGCAGCCCGGTGCAGCACCGTGAGGTCCA 290
Query 270 GTACCATGAGTCAGACACTTTCCGTGGCTACTTCAAGCAGGGCATCATCTACAAGCAGGGGGGTGTCGCCTCTG 343
||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||..||||||||||.|||||||
Sbjct 291 GTACCACGAGTCCGACACCTTCCGTGGCTACTTCAAGCAGGGCATCATCTATAAAAAGGGGGGTGTGGCCTCTG 364
Query 344 GGATGAAGCACGTGGAGACCAATACCTACGACGTGAAGCGGCTGCTACATGTGAAAGGGAAAAGAAACATC--- 414
||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||.||||||||||.||.||.|||||||||||||||
Sbjct 365 GGATGAAGCACGTGGAGACCAACACCTATGATGTGAAGAGGCTGCTACACGTAAAGGGGAAAAGAAACATCCAA 438
Query 415 -------AGG----------------------------------GCTACCG----------------------- 424
||| |||.|||
Sbjct 439 GCCACGGAGGTGAGTCTCACACGTGAGTGTCCTGGGTGCCCGGTGCTCCCGCCCTGGCACCTAAGACTGCCCCG 512
Query 425 -----------------------AGGTGGAAATGAGCTGGGACAGTTTCAACCGAGGTGATGTCTTCTTGCTGG 475
||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||.||||||
Sbjct 513 AACCGCTCTGACTGCTCACACGCAGGTGGAAATGAGCTGGGACAGCTTTAACCGAGGCGATGTCTTCCTGCTGG 586
Query 476 ACCTTGGGAAAGTCATCATCCAATGGAATGGCCCAGAGAGCAACAGTGGGGAGCGCCTGAAGGCTATGCTTCTG 549
|||||||||..|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||
Sbjct 587 ACCTTGGGATGGTCATCATCCAGTGGAATGGCCCGGAGAGCAACAGTGGGGAACGTCTCAAGGCTATGCTTCTG 660
Query 550 GCAAAGGATATTCGAGACAGGGAGCGAGGGGGCCGTGCTGAAATAGGAGTGATCGAGGGAGACAAGGAGGCAGC 623
||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 661 GCAAAGGACATTCGGGACAGGGAGCGAGGGGGCCGTGCTGAAATTGGGGTGATTGAGGGAGACAAGGAGGCGGC 734
Query 624 CAGCCCAGAGCTGATGAAGGTCCTTCAGGACACCCTTGGCCGACGCTCCATTATCAAGCCTACAGTCCCTGATG 697
||||||||.||||||||..|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||.||||..||||||
Sbjct 735 CAGCCCAGGGCTGATGACAGTCCTCCAGGATACCCTTGGTCGACGCTCCATGATAAAGCCTGCAGTTTCTGATG 808
Query 698 AGATCATAGATCAGAAGCAGAAATCAACTATCATGTTGTATCATATCTCAGATTCAGCTGGGCAGCTGGCAGTC 771
|||||||.||.||..|.||||||||||.|||||||||.||||||.||||.||..||||||||||||||.|||||
Sbjct 809 AGATCATGGACCAACAACAGAAATCAAGTATCATGTTATATCATGTCTCCGACACAGCTGGGCAGCTGTCAGTC 882
Query 772 ACAGAGGTAGCAACAAGGCCTCTGGTCCAGGACTTACTGAACCATGATGACTGCTACATCCTGGACCAAAGTGG 845
||||||||.|||||||||||.||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 883 ACAGAGGTGGCAACAAGGCCCCTGGTCCAGGACCTACTGAACCACGATGACTGCTACATCCTGGACCAAAGTGG 956
Query 846 AACCAAAATCTACGTGTGGAAAGGAAAAGGAGCCACAAAGGCTGAAAAACAGGCAGCCATGTCTAAAGCGCTGG 919
.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||.|||.||||||||.||||||||.|||||.||||
Sbjct 957 CACCAAGATCTACGTGTGGAAAGGCAAAGGAGCCACCAAGGTTGAGAAACAGGCGGCCATGTCCAAAGCCCTGG 1030
Query 920 GCTTCATCAAGATGAAGAGCTACCCCAGCAGCACCAATGTGGAGACCGTCAACGATGGTGCTGAGTCGGCCATG 993
..|||||||||||||||.|.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 1031 ATTTCATCAAGATGAAGGGATACCCCAGCAGCACCAACGTGGAGACCGTCAACGATGGCGCAGAGTCGGCCATG 1104
Query 994 TTCAAGCAGCTGTTCCAGAAGTGGTCAGTAAAGGACCAGACCATGGGCCTGGGGAAAACGTTCAGCATTGGTAA 1067
|||||.|||.||||||||||.|||||.||.|||||||||||||.||||.|||||||||..|||||||.||||||
Sbjct 1105 TTCAAACAGTTGTTCCAGAAATGGTCGGTGAAGGACCAGACCACGGGCTTGGGGAAAATATTCAGCACTGGTAA 1178
Query 1068 AATTGCTAAAGTTTTCCAGGATAAATTTGATGTGACTCTGCTACACACCAAGCCAGAGGTAGCTGCCCAGGAAA 1141
|||.||||||.|.||||||||.||.||.||||||.||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|
Sbjct 1179 AATCGCTAAAATCTTCCAGGACAAGTTCGATGTGTCTCTGCTACACACCAAGCCAGAAGTGGCTGCACAGGAGA 1252
Query 1142 GAATGGTCGATGATGGCAACGGAAAAGTTGAGGTCTGGAGAATTGAGAACCTGGAGCTGGTCCCTGTGGAGTAT 1215
|||||||.||.||.|||||.||..|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.
Sbjct 1253 GAATGGTGGACGACGGCAAAGGCCAGGTTGAGGTCTGGAGAATTGAGAACCTGGAGCTGGTCCCCGTGGAATAC 1326
Query 1216 CAATGGTATGGCTTCTTTTATGGGGGAGACTGTTATCTGGTCCTCTACACATACGAGGTAAATGGGAAGCCACA 1289
||.|||.||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||.|||||.||.||
Sbjct 1327 CAGTGGCATGGCTTCTTCTACGGGGGAGACTGCTATCTGGTTCTCTACACGTACGATGTGAACGGGAAACCCCA 1400
Query 1290 TCACATCTTGTACATCTGGCAGGGCCGCCACGCCTCACAGGATGAGCTGGCAGCCTCAGCATACCAGGCAGTGG 1363
|.|||||||||||||||||||||||||||||||.||.|.|||||||||||||||||||||.||.|.||||||||
Sbjct 1401 TTACATCTTGTACATCTGGCAGGGCCGCCACGCATCCCGGGATGAGCTGGCAGCCTCAGCCTATCGGGCAGTGG 1474
Query 1364 AGGTGGATCGGCAGTTTGATGGGGCTGCTGTGCAGGTTCGAGTCAGGATGGGAACGGAGCCACGCCACTTCATG 1437
|||||||||.||||||||||||.||..||||||||||.||.||.||.|||||.|.|||||||||||||||||||
Sbjct 1475 AGGTGGATCAGCAGTTTGATGGAGCCCCTGTGCAGGTCCGGGTTAGCATGGGGAAGGAGCCACGCCACTTCATG 1548
Query 1438 GCCATCTTCAAAGGGAAGCTAGTTATCTTTGAGGGTGGGACTTCCAGGAAGGGAAATGCCGAGCCTGACCCTCC 1511
||||||||||||||.|||||.|||||||..|||||.||||||||||||||||||||.|..|||||.||||||||
Sbjct 1549 GCCATCTTCAAAGGAAAGCTGGTTATCTACGAGGGCGGGACTTCCAGGAAGGGAAACGAGGAGCCGGACCCTCC 1622
Query 1512 AGTAAGACTCTTCCAAATTCATGGAAATGACAAATCTAACACCAAAGCAGTGGAAGTTCCAGCCTTTGCCTCCT 1585
||||||.||||||||.||.||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||..|.||||.|||.||||
Sbjct 1623 AGTAAGGCTCTTCCAGATCCACGGGAACGACAAATCCAACACCAAAGCAGTGGAGGTCTCGGCCTCTGCTTCCT 1696
Query 1586 CCCTAAACTCCAATGATGTCTTTCTGCTGCGAACTCAGGCAGAGCACTACCTGTGGTATGGCAAGGGGTCTAGT 1659
|.||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1697 CGCTCAACTCCAACGACGTCTTTCTGCTGCGGACTCAGGCAGAGCACTACCTGTGGTACGGCAAGGGGTCTAGT 1770
Query 1660 GGGGATGAGCGGGCAATGGCTAAGGAGCTGGCCAGCCTTCTCTGTGATGGCAGCGAGAACACTGTGGCCGAGGG 1733
|||||.||||||||.||||||||||||||||.|..|||||||||||||||||..|.|.||||||||||.|||||
Sbjct 1771 GGGGACGAGCGGGCGATGGCTAAGGAGCTGGTCGACCTTCTCTGTGATGGCAATGCGGACACTGTGGCTGAGGG 1844
Query 1734 CCAGGAGCCAGCCGAGTTCTGGGACCTACTGGGAGGGAAAACTCCCTATGCCAATGATAAAAGACTTCAGCAGG 1807
||||||||||.|.||||||||||||||.||||||||.|||||..||||.||.|||||.|||||.||.|||||.|
Sbjct 1845 CCAGGAGCCACCTGAGTTCTGGGACCTTCTGGGAGGAAAAACAGCCTACGCTAATGACAAAAGGCTGCAGCAAG 1918
Query 1808 AAATCCTAGATGTCCA-GTCTCGTCTCTTTGAATGTTCCAATAAGACCGGCCAATTCGTTGTCACTGAGATCAC 1880
|||.|||.||.||||| ||| ||.||||||||.||||||||||||||.||||..|||.||||.||.|||.||||
Sbjct 1919 AAACCCTGGACGTCCAGGTC-CGGCTCTTTGAGTGTTCCAATAAGACTGGCCGCTTCCTTGTTACGGAGGTCAC 1991
Query 1881 AGACTTCACCCAGGATGACCTGAACCCTACTGACGTGATGCTCCTAGATACCTGGGACCAGGTGTTCTTGTGGA 1954
.||||||||||||||.|||||||.|||...|||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1992 GGACTTCACCCAGGAGGACCTGAGCCCAGGTGATGTGATGCTTCTGGACACCTGGGACCAGGTGTTCTTGTGGA 2065
Query 1955 TTGGGGCTGAGGCCAATGCCACGGAGAAGGAGAGTGCCCTTGCCACAGCACAGCAGTACCTGCACACTCACCCC 2028
|.||.||.|||||||||||||||||||||.||.|.|||||..|.||.||.|||.||||||||..|||.||.||.
Sbjct 2066 TAGGAGCGGAGGCCAATGCCACGGAGAAGAAGGGGGCCCTCTCGACGGCTCAGGAGTACCTGGTCACACATCCT 2139
Query 2029 AGCGGCCGAGATCCCGACACACCAATCCTGATCATTAAGCAGGGGTTTGAGCCTCCCATCTTCACAGGCTGGTT 2102
||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||.||||||||.||||.|||||||||||||||
Sbjct 2140 AGTGGCCGAGACCCCGACACACCGATTCTGATCATCAAACAGGGCTTTGAGCCCCCCACCTTCACAGGCTGGTT 2213
Query 2103 CCTAGCCTGGGACCCTAACATTTGGAGTGCAGGAAAAACATATGAACAATTAAAAGAA-GAGCTGGGAGATGCT 2175
|||.||.|||||||||.||||||||||.|.|||||||.|||||||.||..| |||||| ||||||||||||||.
Sbjct 2214 CCTGGCATGGGACCCTCACATTTGGAGCGAAGGAAAATCATATGAGCAGCT-AAAGAACGAGCTGGGAGATGCA 2286
Query 2176 GCTGCTATCATGCGAATCACTGCTGACATGAAGAATGCAACCCTCTCCCTGAATTCTAATGACAGTGAGCCAAA 2249
.||||.||..||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|.|||||||.|||.||||.||||||||||
Sbjct 2287 ACTGCCATTGTGCGAATCACCGCTGACATGAAGAACGCAACACTTTACCTGAATCCTAGTGACGGTGAGCCAAA 2360
Query 2250 ATATTACCCTATAGCAGTTCTGTTGAAAAACCAGAATCAGGAGCTGCCTGAGGATGTAAACCCTGCCAAAAAGG 2323
.||.|||||..|.|.|||||||.|||||...|||||.||||||||||||||||||||..||||.||||||||||
Sbjct 2361 GTACTACCCGGTGGAAGTTCTGCTGAAAGGTCAGAACCAGGAGCTGCCTGAGGATGTGGACCCCGCCAAAAAGG 2434
Query 2324 AGAATTACCTCTCTGAACAGGACTTTGTGTCTGTGTTTGGCATCACAAGAGGGCAATTTGCAGCTCTGCCTGGC 2397
||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||..|.||||||||||||
Sbjct 2435 AGAACTACCTCTCGGAACAAGACTTTGTATCTGTGTTTGGCATCACGAGAGGGCAGTTCACTGCTCTGCCTGGC 2508
Query 2398 TGGAAACAGCTCCAAATGAAGAAAGAAAAGGGGCTTTTC 2436
||||||||||||||..||||||||||||.|||.||||||
Sbjct 2509 TGGAAACAGCTCCAGCTGAAGAAAGAAAGGGGCCTTTTC 2547