Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11537
• Subject: XM_006513101.2
• Aligned Length: 2555
• Identities: 2120
• Gaps: 127

Alignment

Query    1  ATGTCT------------TCCACGGG------GCA-----CCCTGGCTCCT-ACAAAATATGGGGA---GAGAA  47
            ||||||            |.|| |||      |||     |||.||.||.| ||     ||||.||   |||||
Sbjct    1  ATGTCTCTGAGCAGTGCCTTCA-GGGCTGTGAGCAACGACCCCCGGATCATCAC-----ATGGAGAATTGAGAA  68

Query   48  AATGGAGCTGGCGCTGGTGCCTGTGAGCGCCCACGGCAACTTCTATGAGGGGGACTGCTACGTCATCCTCTCGA  121
            |||||||||||||||||||||..||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||.||.|||||||||
Sbjct   69  AATGGAGCTGGCGCTGGTGCCCCTGAGTGCTCACGGCAACTTCTACGAGGGAGACTGCTACATCGTCCTCTCGA  142

Query  122  CCCGGAGAGTGGCCAGTCTCCTATCCCAGGACATCCACTTCTGGATCGGGAAGGACTCCTCCCAGGATGAGCAA  195
            ||||||||||||.|||.||.||.||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct  143  CCCGGAGAGTGGGCAGCCTTCTCTCCCAGAACATCCACTTTTGGATCGGGAAGGACTCCTCCCAGGACGAGCAG  216

Query  196  AGCTGCGCAGCCATATATACCACACAGCTGGACGACTACCTGGGAGGCAGCCCTGTGCAGCACCGAGAGGTCCA  269
            ||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct  217  AGCTGCGCGGCCATCTATACCACACAGCTGGATGACTACCTGGGAGGCAGCCCGGTGCAGCACCGTGAGGTCCA  290

Query  270  GTACCATGAGTCAGACACTTTCCGTGGCTACTTCAAGCAGGGCATCATCTACAAGCAGGGGGGTGTCGCCTCTG  343
            ||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||..||||||||||.|||||||
Sbjct  291  GTACCACGAGTCCGACACCTTCCGTGGCTACTTCAAGCAGGGCATCATCTATAAAAAGGGGGGTGTGGCCTCTG  364

Query  344  GGATGAAGCACGTGGAGACCAATACCTACGACGTGAAGCGGCTGCTACATGTGAAAGGGAAAAGAAACATC---  414
            ||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||.||||||||||.||.||.|||||||||||||||   
Sbjct  365  GGATGAAGCACGTGGAGACCAACACCTATGATGTGAAGAGGCTGCTACACGTAAAGGGGAAAAGAAACATCCAA  438

Query  415  -------AGG----------------------------------GCTACCG-----------------------  424
                   |||                                  |||.|||                       
Sbjct  439  GCCACGGAGGTGAGTCTCACACGTGAGTGTCCTGGGTGCCCGGTGCTCCCGCCCTGGCACCTAAGACTGCCCCG  512

Query  425  -----------------------AGGTGGAAATGAGCTGGGACAGTTTCAACCGAGGTGATGTCTTCTTGCTGG  475
                                   ||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||.||||||
Sbjct  513  AACCGCTCTGACTGCTCACACGCAGGTGGAAATGAGCTGGGACAGCTTTAACCGAGGCGATGTCTTCCTGCTGG  586

Query  476  ACCTTGGGAAAGTCATCATCCAATGGAATGGCCCAGAGAGCAACAGTGGGGAGCGCCTGAAGGCTATGCTTCTG  549
            |||||||||..|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||
Sbjct  587  ACCTTGGGATGGTCATCATCCAGTGGAATGGCCCGGAGAGCAACAGTGGGGAACGTCTCAAGGCTATGCTTCTG  660

Query  550  GCAAAGGATATTCGAGACAGGGAGCGAGGGGGCCGTGCTGAAATAGGAGTGATCGAGGGAGACAAGGAGGCAGC  623
            ||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct  661  GCAAAGGACATTCGGGACAGGGAGCGAGGGGGCCGTGCTGAAATTGGGGTGATTGAGGGAGACAAGGAGGCGGC  734

Query  624  CAGCCCAGAGCTGATGAAGGTCCTTCAGGACACCCTTGGCCGACGCTCCATTATCAAGCCTACAGTCCCTGATG  697
            ||||||||.||||||||..|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||.||||..||||||
Sbjct  735  CAGCCCAGGGCTGATGACAGTCCTCCAGGATACCCTTGGTCGACGCTCCATGATAAAGCCTGCAGTTTCTGATG  808

Query  698  AGATCATAGATCAGAAGCAGAAATCAACTATCATGTTGTATCATATCTCAGATTCAGCTGGGCAGCTGGCAGTC  771
            |||||||.||.||..|.||||||||||.|||||||||.||||||.||||.||..||||||||||||||.|||||
Sbjct  809  AGATCATGGACCAACAACAGAAATCAAGTATCATGTTATATCATGTCTCCGACACAGCTGGGCAGCTGTCAGTC  882

Query  772  ACAGAGGTAGCAACAAGGCCTCTGGTCCAGGACTTACTGAACCATGATGACTGCTACATCCTGGACCAAAGTGG  845
            ||||||||.|||||||||||.||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  883  ACAGAGGTGGCAACAAGGCCCCTGGTCCAGGACCTACTGAACCACGATGACTGCTACATCCTGGACCAAAGTGG  956

Query  846  AACCAAAATCTACGTGTGGAAAGGAAAAGGAGCCACAAAGGCTGAAAAACAGGCAGCCATGTCTAAAGCGCTGG  919
            .|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||.|||.||||||||.||||||||.|||||.||||
Sbjct  957  CACCAAGATCTACGTGTGGAAAGGCAAAGGAGCCACCAAGGTTGAGAAACAGGCGGCCATGTCCAAAGCCCTGG  1030

Query  920  GCTTCATCAAGATGAAGAGCTACCCCAGCAGCACCAATGTGGAGACCGTCAACGATGGTGCTGAGTCGGCCATG  993
            ..|||||||||||||||.|.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 1031  ATTTCATCAAGATGAAGGGATACCCCAGCAGCACCAACGTGGAGACCGTCAACGATGGCGCAGAGTCGGCCATG  1104

Query  994  TTCAAGCAGCTGTTCCAGAAGTGGTCAGTAAAGGACCAGACCATGGGCCTGGGGAAAACGTTCAGCATTGGTAA  1067
            |||||.|||.||||||||||.|||||.||.|||||||||||||.||||.|||||||||..|||||||.||||||
Sbjct 1105  TTCAAACAGTTGTTCCAGAAATGGTCGGTGAAGGACCAGACCACGGGCTTGGGGAAAATATTCAGCACTGGTAA  1178

Query 1068  AATTGCTAAAGTTTTCCAGGATAAATTTGATGTGACTCTGCTACACACCAAGCCAGAGGTAGCTGCCCAGGAAA  1141
            |||.||||||.|.||||||||.||.||.||||||.||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|
Sbjct 1179  AATCGCTAAAATCTTCCAGGACAAGTTCGATGTGTCTCTGCTACACACCAAGCCAGAAGTGGCTGCACAGGAGA  1252

Query 1142  GAATGGTCGATGATGGCAACGGAAAAGTTGAGGTCTGGAGAATTGAGAACCTGGAGCTGGTCCCTGTGGAGTAT  1215
            |||||||.||.||.|||||.||..|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.
Sbjct 1253  GAATGGTGGACGACGGCAAAGGCCAGGTTGAGGTCTGGAGAATTGAGAACCTGGAGCTGGTCCCCGTGGAATAC  1326

Query 1216  CAATGGTATGGCTTCTTTTATGGGGGAGACTGTTATCTGGTCCTCTACACATACGAGGTAAATGGGAAGCCACA  1289
            ||.|||.||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||.|||||.||.||
Sbjct 1327  CAGTGGCATGGCTTCTTCTACGGGGGAGACTGCTATCTGGTTCTCTACACGTACGATGTGAACGGGAAACCCCA  1400

Query 1290  TCACATCTTGTACATCTGGCAGGGCCGCCACGCCTCACAGGATGAGCTGGCAGCCTCAGCATACCAGGCAGTGG  1363
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||.||.|.|||||||||||||||||||||.||.|.||||||||
Sbjct 1401  TTACATCTTGTACATCTGGCAGGGCCGCCACGCATCCCGGGATGAGCTGGCAGCCTCAGCCTATCGGGCAGTGG  1474

Query 1364  AGGTGGATCGGCAGTTTGATGGGGCTGCTGTGCAGGTTCGAGTCAGGATGGGAACGGAGCCACGCCACTTCATG  1437
            |||||||||.||||||||||||.||..||||||||||.||.||.||.|||||.|.|||||||||||||||||||
Sbjct 1475  AGGTGGATCAGCAGTTTGATGGAGCCCCTGTGCAGGTCCGGGTTAGCATGGGGAAGGAGCCACGCCACTTCATG  1548

Query 1438  GCCATCTTCAAAGGGAAGCTAGTTATCTTTGAGGGTGGGACTTCCAGGAAGGGAAATGCCGAGCCTGACCCTCC  1511
            ||||||||||||||.|||||.|||||||..|||||.||||||||||||||||||||.|..|||||.||||||||
Sbjct 1549  GCCATCTTCAAAGGAAAGCTGGTTATCTACGAGGGCGGGACTTCCAGGAAGGGAAACGAGGAGCCGGACCCTCC  1622

Query 1512  AGTAAGACTCTTCCAAATTCATGGAAATGACAAATCTAACACCAAAGCAGTGGAAGTTCCAGCCTTTGCCTCCT  1585
            ||||||.||||||||.||.||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||..|.||||.|||.||||
Sbjct 1623  AGTAAGGCTCTTCCAGATCCACGGGAACGACAAATCCAACACCAAAGCAGTGGAGGTCTCGGCCTCTGCTTCCT  1696

Query 1586  CCCTAAACTCCAATGATGTCTTTCTGCTGCGAACTCAGGCAGAGCACTACCTGTGGTATGGCAAGGGGTCTAGT  1659
            |.||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1697  CGCTCAACTCCAACGACGTCTTTCTGCTGCGGACTCAGGCAGAGCACTACCTGTGGTACGGCAAGGGGTCTAGT  1770

Query 1660  GGGGATGAGCGGGCAATGGCTAAGGAGCTGGCCAGCCTTCTCTGTGATGGCAGCGAGAACACTGTGGCCGAGGG  1733
            |||||.||||||||.||||||||||||||||.|..|||||||||||||||||..|.|.||||||||||.|||||
Sbjct 1771  GGGGACGAGCGGGCGATGGCTAAGGAGCTGGTCGACCTTCTCTGTGATGGCAATGCGGACACTGTGGCTGAGGG  1844

Query 1734  CCAGGAGCCAGCCGAGTTCTGGGACCTACTGGGAGGGAAAACTCCCTATGCCAATGATAAAAGACTTCAGCAGG  1807
            ||||||||||.|.||||||||||||||.||||||||.|||||..||||.||.|||||.|||||.||.|||||.|
Sbjct 1845  CCAGGAGCCACCTGAGTTCTGGGACCTTCTGGGAGGAAAAACAGCCTACGCTAATGACAAAAGGCTGCAGCAAG  1918

Query 1808  AAATCCTAGATGTCCA-GTCTCGTCTCTTTGAATGTTCCAATAAGACCGGCCAATTCGTTGTCACTGAGATCAC  1880
            |||.|||.||.||||| ||| ||.||||||||.||||||||||||||.||||..|||.||||.||.|||.||||
Sbjct 1919  AAACCCTGGACGTCCAGGTC-CGGCTCTTTGAGTGTTCCAATAAGACTGGCCGCTTCCTTGTTACGGAGGTCAC  1991

Query 1881  AGACTTCACCCAGGATGACCTGAACCCTACTGACGTGATGCTCCTAGATACCTGGGACCAGGTGTTCTTGTGGA  1954
            .||||||||||||||.|||||||.|||...|||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1992  GGACTTCACCCAGGAGGACCTGAGCCCAGGTGATGTGATGCTTCTGGACACCTGGGACCAGGTGTTCTTGTGGA  2065

Query 1955  TTGGGGCTGAGGCCAATGCCACGGAGAAGGAGAGTGCCCTTGCCACAGCACAGCAGTACCTGCACACTCACCCC  2028
            |.||.||.|||||||||||||||||||||.||.|.|||||..|.||.||.|||.||||||||..|||.||.||.
Sbjct 2066  TAGGAGCGGAGGCCAATGCCACGGAGAAGAAGGGGGCCCTCTCGACGGCTCAGGAGTACCTGGTCACACATCCT  2139

Query 2029  AGCGGCCGAGATCCCGACACACCAATCCTGATCATTAAGCAGGGGTTTGAGCCTCCCATCTTCACAGGCTGGTT  2102
            ||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||.||||||||.||||.|||||||||||||||
Sbjct 2140  AGTGGCCGAGACCCCGACACACCGATTCTGATCATCAAACAGGGCTTTGAGCCCCCCACCTTCACAGGCTGGTT  2213

Query 2103  CCTAGCCTGGGACCCTAACATTTGGAGTGCAGGAAAAACATATGAACAATTAAAAGAA-GAGCTGGGAGATGCT  2175
            |||.||.|||||||||.||||||||||.|.|||||||.|||||||.||..| |||||| ||||||||||||||.
Sbjct 2214  CCTGGCATGGGACCCTCACATTTGGAGCGAAGGAAAATCATATGAGCAGCT-AAAGAACGAGCTGGGAGATGCA  2286

Query 2176  GCTGCTATCATGCGAATCACTGCTGACATGAAGAATGCAACCCTCTCCCTGAATTCTAATGACAGTGAGCCAAA  2249
            .||||.||..||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|.|||||||.|||.||||.||||||||||
Sbjct 2287  ACTGCCATTGTGCGAATCACCGCTGACATGAAGAACGCAACACTTTACCTGAATCCTAGTGACGGTGAGCCAAA  2360

Query 2250  ATATTACCCTATAGCAGTTCTGTTGAAAAACCAGAATCAGGAGCTGCCTGAGGATGTAAACCCTGCCAAAAAGG  2323
            .||.|||||..|.|.|||||||.|||||...|||||.||||||||||||||||||||..||||.||||||||||
Sbjct 2361  GTACTACCCGGTGGAAGTTCTGCTGAAAGGTCAGAACCAGGAGCTGCCTGAGGATGTGGACCCCGCCAAAAAGG  2434

Query 2324  AGAATTACCTCTCTGAACAGGACTTTGTGTCTGTGTTTGGCATCACAAGAGGGCAATTTGCAGCTCTGCCTGGC  2397
            ||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||..|.||||||||||||
Sbjct 2435  AGAACTACCTCTCGGAACAAGACTTTGTATCTGTGTTTGGCATCACGAGAGGGCAGTTCACTGCTCTGCCTGGC  2508

Query 2398  TGGAAACAGCTCCAAATGAAGAAAGAAAAGGGGCTTTTC  2436
            ||||||||||||||..||||||||||||.|||.||||||
Sbjct 2509  TGGAAACAGCTCCAGCTGAAGAAAGAAAGGGGCCTTTTC  2547